CASC11 (cancer susceptibility 11)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC11
locus group:
non-coding RNA
location:
8q24.21
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
TCONS_00014535|LINC00990|CARLo-7|ENST00000518376|MYMLR
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
100270680
ensembl gene id:
ENSG00000249375
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_117101
hgnc_id:
HGNC:48939
approved reserved:
2013-07-17

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.21
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC11基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3808379       rs3824120       rs4132423       rs4298463       rs4392862       rs4480077       rs4645939       rs4645940       rs4645941       rs4645942       rs4645943       rs4645944       rs4645945       rs4733548       rs4733691       rs4733693       rs5894896      

基因表达

基因表达

CASC11基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGACACTGTGGAGAAGTCAG
59
ATCAGTTCCTCACCACATGG
60
CTATTCAACCGCATAAGAGATGG
60
TTTGTGTCTCGGTTCTCCA
59
TAACTTAAGGAGGAAGTCAGCT
59
CCAGTTCTTCTCTGCAATGTC
59
GTCAGTAACTTAAGGAGGAAGTC
58
TCTTCTCTGCAATGTCATCTC
58
ACACTGTGGAGAAGTCAGG
59
TATCAGTTCCTCACCACATGG
60
TATTCAACCGCATAAGAGATGG
58
TTTGTGTCTCGGTTCTCCA
59
AGACACTGTGGAGAAGTCAG
59
TCAGTTCCTCACCACATGG
59
CCTGTCAGTAACTTAAGGAGGA
59
TCTCTGCAATGTCATCTCCA
59
ATTCAACCGCATAAGAGATGG
59
TTTGTGTCTCGGTTCTCCA
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC11基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC11基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC11基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Bladder Neoplasm 0.12 0 0 CTD_human

基因相关服务

基因相关服务

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