CARS1 (cysteinyl-tRNA synthetase 1)

symbol:
CARS1
locus group:
protein-coding gene
location:
11p15.4
gene_family:
Aminoacyl tRNA synthetases, Class I
alias symbol:
None
alias name:
cysteine tRNA ligase 1, cytoplasmic
entrez id:
833
ensembl gene id:
ENSG00000110619
ucsc gene id:
uc001lxh.4
refseq accession:
NM_001751
hgnc_id:
HGNC:1493
approved reserved:
1992-12-10
11p15.4
基因染色体位置图

CARS1(中文名:半胱氨酰-tRNA合成酶1,英文全称:Cysteinyl-tRNA synthetase 1)是一种重要的管家基因(housekeeping gene),属于氨基酰-tRNA合成酶(Aminoacyl-tRNA synthetases, aaRSs)基因家族。该家族负责将特定氨基酸连接到对应的tRNA分子上,这是蛋白质合成的关键步骤。CARS1编码的酶专门催化半胱氨酸(Cysteine)与其对应tRNA的结合,确保遗传密码准确翻译为蛋白质。该基因广泛表达于所有细胞中,主要作用位点是细胞质,其功能直接影响蛋白质合成的保真度和效率。若CARS1发生功能丧失突变,会导致半胱氨酸-tRNA合成障碍,引发蛋白质翻译错误、内质网应激(ER stress,指蛋白质折叠压力增大)甚至细胞凋亡。研究发现CARS1突变与周围神经病变(如Charcot-Marie-Tooth disease,CMT)和某些癌症相关。当CARS1过表达时,可能通过异常激活mTOR信号通路(调控细胞生长的关键通路)促进肿瘤细胞增殖;而表达降低则会导致氧化应激(oxidative stress,指自由基积累造成的细胞损伤)加剧,因半胱氨酸是合成谷胱甘肽(重要抗氧化剂)的前体。该基因家族(aaRSs)的共性包括:均具有高度保守的催化结构域,多数由核基因编码却在胞质和线粒体双定位,部分成员(如CARS1)还具有非经典功能(如参与血管生成调控)。目前"CARS1"的中文译名存在争议,也有文献称为"半胱氨酸-tRNA连接酶1"(原英文:Cysteine--tRNA ligase 1)。

This gene encodes a class 1 aminoacyl-tRNA synthetase, cysteinyl-tRNA synthetase. Each of the twenty aminoacyl-tRNA synthetases catalyzes the aminoacylation of a specific tRNA or tRNA isoaccepting family with the cognate amino acid. This gene is one of several located near the imprinted gene domain on chromosome 11p15.5, an important tumor-suppressor gene region. Alterations in this region have been associated with Beckwith-Wiedemann syndrome, Wilms tumor, rhabdomyosarcoma, adrenocortical carcinoma, and lung, ovarian and breast cancers. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2010]

??该基因编码1类氨酰基-tRNA合成酶,半胱氨酰tRNA合成酶。每二十氨酰tRNA合成酶的催化一个特定的tRNA或tRNA的同功家族与同源氨基酸氨酰化。该基因是几个位于染色体11p15.5,一个重要的肿瘤抑制基因区印迹基因领域之一。在这一地区的变化已与威思 - 威德曼综合征,肾母细胞瘤,横纹肌肉瘤,肾上腺皮质癌和肺癌,卵巢癌和乳腺癌有关。这个基因的选择性剪接的结果在多个转录变体。 [由RefSeq的,2010年8月提供]

CARS1基因的碱基序列:[NCBI]
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CARS1基因的碱基突变:           仅显示部分snp

CARS1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

CARS1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CARS1基因的本体(GO)信息:

可能调控 CARS1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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