CAPRIN1 (cell cycle associated protein 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CAPRIN1
locus group:
protein-coding gene
location:
11p13
gene_family:
alias symbol:
caprin-1|RNG105
alias name:
cytoplasmic activation/proliferati…
entrez id:
4076
ensembl gene id:
ENSG00000135387
ucsc gene id:
uc001mvh.2
refseq accession:
NM_005898
hgnc_id:
HGNC:6743
approved reserved:
1995-12-18

基因染色体位置

基因染色体位置

11p13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CAPRIN1（细胞周期相关蛋白1）是一种多功能RNA结合蛋白，在细胞周期调控、mRNA稳定性、翻译调控以及应激颗粒形成中发挥重要作用。它广泛表达于多种组织中，尤其在增殖活跃的细胞中表达较高。CAPRIN1通过结合特定mRNA分子调控其翻译效率，影响细胞增殖、分化和凋亡过程。该蛋白在神经元中也有显著表达，参与突触可塑性和记忆形成。CAPRIN1的突变或异常表达与多种疾病相关，包括癌症（如乳腺癌、胶质母细胞瘤）、神经退行性疾病（如阿尔茨海默病）和病毒感染（如流感病毒复制）。CAPRIN1过表达可促进肿瘤细胞增殖和转移，而表达降低则可能导致细胞周期阻滞和凋亡增加。在神经系统中，CAPRIN1表达异常与认知功能障碍相关。CAPRIN1属于CAPRIN基因家族，该家族成员都具有RNA结合能力并参与转录后调控。这个家族的共性包括含有保守的RNA识别基序（RRM），能够形成应激颗粒，并在细胞应激反应中起关键作用。CAPRIN1与家族其他成员如CAPRIN2在功能上有部分重叠，但各自又有独特的调控靶标和生物学功能。研究表明CAPRIN1与多种信号通路分子相互作用，包括mTOR和Wnt通路成分，这解释了它在多种生理和病理过程中的广泛影响。

None

无

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CAPRIN1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs8191       rs10436       rs11710       rs15328       rs958332       rs1132973       rs2004272       rs2179830       rs2421456       rs2421457       rs2957487       rs2957488       rs2982590       rs2982591       rs2982592       rs3073356       rs3858466      

基因表达

基因表达

CAPRIN1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAAGAGGCTTGATGAATGGA
57
ATATCCATCCCGTTGATAGC
57
AGAAACTTCGGAACCTGGAG
60
CTAGTAACGCTCCCGAGAC
59
CGGGTAAGCTTGATGATTACC
59
GTACTTAGAAACGGCATCCAG
59
AGGGTAAGCTTGATGATTACC
58
ACTTAGAAACGGCATCCAG
58
TTCAAACAGTGGTTGGCAC
59
AAATCCAGTGTTCTGCTGAG
58
TTGAGTGCCAATTGGTTGG
59
GAAATCCAGTGTTCTGCTGAG
59
CATTGTATCTGCACAGCCT
58
GATTCAGAATGAACTGGAGGG
59
GATTCAACAAACTGCACAAAGC
60
AAGCTTACCCTGTAAGATTTGC
59
TTGCAAATCTTACAGGGTAAGC
59
CCTGGTACTTAGAAACGGCA
60
ATCAGATTCAGGCAACAATCTC
59
ATACTTGAGGCTGAGACGC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CAPRIN1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CAPRIN1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005737
G3V153 (UniProtKB)
IDA
GO:0000932
Q14444 (UniProtKB)
ISS
GO:0003723
Q14444 (UniProtKB)
ISS
GO:0005737
Q14444 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q14444 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
Q14444 (UniProtKB)
TAS
GO:0010494
Q14444 (UniProtKB)
ISS
GO:0016020
Q14444 (UniProtKB)
IDA
GO:0017148
Q14444 (UniProtKB)
ISS
GO:0030425
Q14444 (UniProtKB)
IEA
GO:0044822
Q14444 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q14444 (UniProtKB)
IDA
GO:0050775
Q14444 (UniProtKB)
ISS
GO:0061003
Q14444 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CAPRIN1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human

基因相关服务

基因相关服务

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