CALR3 (calreticulin 3)

symbol:
CALR3
locus group:
protein-coding gene
location:
19p13.11
gene_family:
alias symbol:
CRT2|FLJ25355|MGC26577|CT93
alias name:
cancer/testis antigen 93|calsperin
entrez id:
125972
ensembl gene id:
ENSG00000269058
ucsc gene id:
uc002ned.3
refseq accession:
NM_145046
hgnc_id:
HGNC:20407
approved reserved:
2003-02-04
19p13.11
基因染色体位置图

CALR3(钙网蛋白3)是钙网蛋白基因家族的一员,该家族还包括CALR和CALR2。钙网蛋白家族成员主要参与细胞内钙离子(Ca²⁺)的储存与调控,并在蛋白质折叠、细胞粘附、免疫应答等过程中发挥重要作用。CALR3主要表达于睾丸、视网膜和大脑等组织,其编码的蛋白质定位于内质网,通过与钙离子结合参与细胞内钙稳态的维持。CALR3在精子发生和视觉功能中具有关键作用,尤其在光感受器细胞的发育和功能中不可或缺。CALR3的突变可能导致其功能异常,进而影响钙离子信号传导,与某些男性不育症和视网膜病变(如视网膜色素变性)相关。若CALR3过表达,可能扰乱细胞内钙平衡,导致细胞凋亡或功能紊乱;而降低表达则可能损害精子发生或光感受器细胞的正常功能,进而影响生育能力或视力。此外,CALR3与其他钙结合蛋白(如CALR和CALR2)功能相似,但组织分布和具体作用存在差异。研究表明,CALR3可能与某些癌症(如胶质瘤)的发生发展有关,但其具体机制仍需进一步探索。总体而言,CALR3作为钙网蛋白家族的重要成员,在生殖、视觉及神经系统中扮演关键角色,其表达异常或突变可能引发多种疾病。

The protein encoded by this gene belongs to the calreticulin family, members of which are calcium-binding chaperones localized mainly in the endoplasmic reticulum. This protein is also localized to the endoplasmic reticulum lumen, however, its capacity for calcium-binding may be absent or much lower than other family members. This gene is specifically expressed in the testis, and may be required for sperm fertility. Mutation in this gene has been associated with familial hypertrophic cardiomyopathy. [provided by RefSeq, Dec 2011]

该基??因编码的蛋白属于钙网蛋白家族,成员是主要定位于内质网中的钙结合伴侣。这种蛋白也定位于内质网腔,但是,其容量为钙结合可以不存在或比其他家庭成员要低得多。该基因在睾丸特异性表达,并可能需要精子的生育能力。在这种基因突变已与家族性肥厚型心肌病有关。 [由RefSeq的,2011年12月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CALR3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs967886       rs3745325       rs3810199       rs3810200       rs3810201       rs4808049       rs7246005       rs8103427       rs9989671       rs10409401       rs10409518       rs11544148       rs11667136       rs11878957       rs62118142       rs71180303       rs74930731      

CALR3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTTGACGCAGTATGACCTC
58
TGGTTCCAGATCTCACCTG
59
CAAGAGGAATTTCTAGACGGA
57
TATCGGGTCCTTTATCTTTCTC
57
CTGGACAATTGCTGCATGG
60
CTCCCAGTCCTTCAGATGTG
60
AGGTGTAAGGTTGATGGCT
59
CCGGATTCAATTGACTGACC
59
AAGAGGAATTTCTAGACGGAG
57
TATCGGGTCCTTTATCTTTCTC
57
CCACGATGGCAATATTATAGAACC
60
GCTTCTCCCAGTCCTTCAG
60
CAGGTGTAAGGTTGATGGC
59
CGGATTCAATTGACTGACCA
58
AAGATAAAGGTCTGCAAACCAC
59
TCCCTTTATTGCTGAACGGT
60
AGATAAAGGTCTGCAAACCAC
59
TTCCCTTTATTGCTGAACGG
59
CATTGGAGAAACCGATGGT
58
TATCGGGTCCTTTATCTTTCTC
57
      尚未收录相关数据

CALR3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CALR3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
M0R0Y8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005783
M0R0Y8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006457
M0R0Y8 (UniProtKB)
IEA
GO:0051082
M0R0Y8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q96L12 (UniProtKB)
IEA
GO:0005788
Q96L12 (UniProtKB)
IEA
GO:0006457
Q96L12 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
Q96L12 (UniProtKB)
IEA
GO:0030154
Q96L12 (UniProtKB)
IEA
GO:0030246
Q96L12 (UniProtKB)
IEA
GO:0044183
Q96L12 (UniProtKB)
IEA
GO:0051082
Q96L12 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CALR3基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
CARDIOMYOPATHY, FAMILIAL HYPERTROPHIC, 19 0.24 1 1 CLINVAR_UNIPROT
Arrhythmogenic Right Ventricular Dysplasia 0.12 0 1 CLINVAR

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