CALML5 (calmodulin like 5)

symbol:
CALML5
locus group:
protein-coding gene
location:
10p15.1
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
CLSP
alias name:
calmodulin-like skin protein
entrez id:
51806
ensembl gene id:
ENSG00000178372
ucsc gene id:
uc001iic.3
refseq accession:
NM_017422
hgnc_id:
HGNC:18180
approved reserved:
2003-11-10
10p15.1
基因染色体位置图

CALML5(Calmodulin Like 5)属于钙调蛋白(Calmodulin, CaM)基因家族,该家族成员以钙离子结合蛋白为特征,参与细胞内钙信号传导。CALML5主要在皮肤表皮中表达,尤其在角质形成细胞中高度特异,其表达产物是一种小分子钙结合蛋白,通过与钙离子结合调节细胞分化、增殖和皮肤屏障功能。CALML5在角质形成细胞终末分化过程中起关键作用,促进角化包膜的形成,从而维持皮肤屏障完整性。该基因突变可能导致皮肤屏障功能受损,与某些皮肤病如鱼鳞病或特应性皮炎相关。若CALML5过表达,可能加速角质形成细胞分化,导致皮肤过度角化;而降低表达则可能延缓分化,削弱皮肤屏障功能。CALML5与家族其他成员(如CALM1-3)共享EF-hand钙结合结构域,但组织分布和功能更专一。研究表明,CALML5可能通过调控下游靶蛋白(如转谷氨酰胺酶)影响角质化过程,其表达异常还可能干扰其他钙依赖性信号通路,进而影响皮肤炎症或修复反应。

This gene encodes a novel calcium binding protein expressed in the epidermis and related to the calmodulin family of calcium binding proteins. Functional studies with recombinant protein demonstrate it does bind calcium and undergoes a conformational change when it does so. Abundant expression is detected only in reconstructed epidermis and is restricted to differentiating keratinocytes. In addition, it can associate with transglutaminase 3, shown to be a key enzyme in the terminal differentiation of keratinocytes. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码在表皮表达和相关的钙调蛋白家族钙结合蛋白的一种新颖的钙结合蛋白。用重组蛋白的功能性研究表明它结合钙和当它这样做经历构象变化。丰富的表情只检测在重建表皮,并仅限于差异化的角质形成细胞。此外,它可以与转谷氨酰胺3相关联,显示出在角质形成细胞的终末分化的关键酶。 [省由RefSeq的,2008年7月被提供的]

CALML5基因的碱基序列:[NCBI]
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CALML5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4881466       rs10904516       rs10904517       rs11546426       rs11592596       rs12412562       rs57631224       rs61164868       rs74113080       rs75247653       rs75861487       rs78072103       rs112779065       rs112791836       rs112831135       rs112999192       rs113188335      

CALML5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGCTAAGGAAACTCATCTCCG
60
CTCCTGGAAGCTGATTTCG
58
GCTAAGGAAACTCATCTCCGA
60
CTCCTGGAAGCTGATTTCG
58
GCTAAGGAAACTCATCTCCG
58
CTCCTGGAAGCTGATTTCG
58
      尚未收录相关数据

CALML5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CALML5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q9NZT1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
Q9NZT1 (UniProtKB)
TAS
GO:0008544
Q9NZT1 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
Q9NZT1 (UniProtKB)
IDA

可能调控 CALML5基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Dermatologic disorders 0.000271442 1 0 BeFree
Psoriasis 0.000271442 1 0 BeFree

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