CADM3 (cell adhesion molecule 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CADM3
locus group:
protein-coding gene
location:
1q23.2
gene_family:
V-set domain containing|C2-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
BIgR|FLJ10698|TSLL1|NECL1|SynCAM3|Necl-1
alias name:
nectin-like 1
entrez id:
57863
ensembl gene id:
ENSG00000162706
ucsc gene id:
uc001ftk.3
refseq accession:
NM_021189
hgnc_id:
HGNC:17601
approved reserved:
2004-02-24

基因染色体位置

基因染色体位置

1q23.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CADM3（细胞粘附分子3）是一种属于免疫球蛋白超家族的细胞粘附分子，也称为SynCAM3或Necl3。它主要表达于神经系统和免疫系统中，通过介导细胞间的粘附作用参与突触形成、神经元迁移和免疫调节等生物学过程。CADM3通过其胞外免疫球蛋白样结构域与其他CADM家族成员或自身相互作用，形成同源或异源二聚体，从而促进细胞间信号传递。在神经系统中，CADM3对突触的可塑性和稳定性至关重要，影响学习记忆功能；在免疫系统中，它参与T细胞活化及免疫突触的形成。CADM3属于CADM基因家族（包括CADM1-4），该家族成员均具有相似的免疫球蛋白样和纤连蛋白III型结构域，介导细胞间粘附并在神经系统发育和肿瘤抑制中发挥重要作用。CADM3突变可能导致其粘附功能受损，与自闭症谱系障碍和精神分裂症等神经精神疾病相关，某些突变还会影响突触传递效率。CADM3过表达可能增强神经元间的异常连接，导致癫痫样活动或神经发育异常；而表达降低则可能损害突触功能，引起认知障碍。在癌症中，CADM3常作为抑癌基因发挥作用，其表达下调与胶质瘤、肺癌等肿瘤的侵袭性增强相关，可能通过失去细胞间接触抑制而促进转移。CADM家族成员功能既有重叠又存在组织特异性，例如CADM1更多参与上皮细胞间连接，而CADM3主要影响神经回路。研究还发现CADM3与阿尔茨海默病的淀粉样斑块形成存在潜在关联，可能通过调节突触稳定性影响疾病进程。

IGSF4B is a brain-specific protein related to the calcium-independent cell-cell adhesion molecules known as nectins (see PVRL3; MIM 607147) (Kakunaga et al., 2005 [PubMed 15741237]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

IGSF4B是与被称为nectins的钙非依赖性细胞 - 细胞粘着分子的脑特异性蛋白（见PVRL3; MIM 607147）[由OMIM供给（Kakunaga等，2005 [搜索PubMed 15741237]）。 2008年3月]

OMIM数据库中对CADM3基因的介绍     Wikipedia数据库中对CADM3基因的介绍

基因序列

基因序列

CADM3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CADM3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2746047       rs6676002       rs34190692       rs35333710       rs35432289       rs41313908       rs60925311       rs113039163       rs140039373       rs142925054       rs148552989       rs149599957       rs181807663       rs182877020       rs187276340       rs190268853       rs190928348      

基因表达

基因表达

CADM3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGGCTTTCATTGTCTTCCTG
59
GTCAGGTAGGTTCCTTTGTG
58
TGGCTTTCATTGTCTTCCTG
59
GTCAGGTAGGTTCCTTTGTG
58
CAGGAAGATCCCAATGACAC
58
CAGTGTAGCAACAGCTTCTG
59
AAGAACTCCACGGAGAACC
59
AACCTGGAATGTCACCGAG
60
CGTGGCTTTCATTGTCTTCC
60
AGGTAGGTTCCTTTGTGCC
60
TCACTGTGCTAGGAATTCCA
59
AGTTTAGGGTGGCTGTGTC
60
CGTGGCTTTCATTGTCTTCC
60
AGGTAGGTTCCTTTGTGCC
60
CAGGAAGATCCCAATGACAC
58
AGTGTAGCAACAGCTTCTG
58
GTGGCTTTCATTGTCTTCCT
59
CAGGTAGGTTCCTTTGTGC
59
GTGGCTTTCATTGTCTTCCT
59
CAGGTAGGTTCCTTTGTGC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CADM3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CADM3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004872
Q8N126 (UniProtKB)
IBA
GO:0005102
Q8N126 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
Q8N126 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q8N126 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q8N126 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q8N126 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q8N126 (UniProtKB)
IBA
GO:0005911
Q8N126 (UniProtKB)
ISS
GO:0005913
Q8N126 (UniProtKB)
IBA
GO:0007156
Q8N126 (UniProtKB)
IBA
GO:0007156
Q8N126 (UniProtKB)
ISS
GO:0007157
Q8N126 (UniProtKB)
IBA
GO:0007157
Q8N126 (UniProtKB)
ISS
GO:0008037
Q8N126 (UniProtKB)
IBA
GO:0008104
Q8N126 (UniProtKB)
IEA
GO:0034332
Q8N126 (UniProtKB)
TAS
GO:0042803
Q8N126 (UniProtKB)
IBA
GO:0042803
Q8N126 (UniProtKB)
ISS
GO:0050839
Q8N126 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CADM3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Schizophrenia 0.00272435 1 0 LHGDN
Glioma 0.000814326 3 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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