C9orf72 (C9orf72-SMCR8 complex subunit)
- symbol:
- C9orf72
- locus group:
- protein-coding gene
- location:
- 9p21.2
- gene_family:
- DENN/MADD domain containing
- alias symbol:
- MGC23980|DENNL72|DENND9
- alias name:
- None
- entrez id:
- 203228
- ensembl gene id:
- ENSG00000147894
- ucsc gene id:
- uc022bfa.2
- refseq accession:
- NM_018325
- hgnc_id:
- HGNC:28337
- approved reserved:
- 2004-01-06
C9orf72（染色体9开放阅读框72）是一个位于人类第9号染色体短臂上的基因，编码一种功能尚未完全明确的蛋白质。该基因最显著的特征是其六核苷酸重复序列（GGGGCC）的异常扩增，这种突变与神经退行性疾病密切相关，特别是肌萎缩侧索硬化症（ALS）和额颞叶痴呆（FTD）。C9orf72蛋白在神经元中高表达，被认为参与多种细胞过程，包括自噬、内体运输和免疫调节。其正常功能可能涉及维持神经元健康和细胞内物质运输的平衡。当C9orf72基因发生GGGGCC重复扩增时（通常超过30次重复），会导致基因功能丧失（单倍剂量不足）和毒性RNA或二肽重复蛋白的产生，这些异常产物会干扰细胞正常功能，引发神经元损伤和死亡。C9orf72基因的突变是家族性ALS和FTD最常见的遗传原因，约占家族性ALS病例的40%和家族性FTD病例的25%。研究表明，C9orf72蛋白水平降低会损害自噬过程，导致异常蛋白聚集，而过表达则可能对神经元有保护作用。C9orf72属于DENN（差异表达于正常和肿瘤细胞）结构域蛋白家族，该家族成员通常作为鸟苷酸交换因子（GEF）参与小GTP酶的调控，影响囊泡运输和膜 trafficking。C9orf72蛋白含有DENN结构域，暗示它可能参与调节Rab GTP酶活性，进而影响细胞内运输过程。这个基因的异常不仅影响神经元，还可能改变免疫系统功能，因为C9orf72在髓系细胞中也有表达，其缺失可能导致炎症反应增强。目前针对C9orf72相关疾病的研究集中在减少毒性重复RNA、阻断二肽重复蛋白产生或增强自噬等治疗策略上。
The protein encoded by this gene plays an important role in the regulation of endosomal trafficking, and has been shown to interact with Rab proteins that are involved in autophagy and endocytic transport. Expansion of a hexanucleotide repeat in non-coding sequence between alternate 5' exons in transcripts from this gene is associated with 9p-linked ALS (amyotrophic lateral sclerosis) and FTD (frontotemporal dementia) (PMID: 21944778, 21944779). Studies suggest that hexanucleotide expansions could result in the selective stabilization of repeat-containing pre-mRNA, and the accumulation of insoluble dipeptide repeat protein aggregates that could be pathogenic in FTD-ALS patients (PMID: 23393093). Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Feb 2015]
该基??因编码的蛋白在胞内贩卖的调节具有重要作用，并已被证明与所涉及的自噬和内吞转运的Rab蛋白相互作用。在非编码候补5‘外显子之间的序列在转录从该基因的六核苷酸重复的扩张与九段联ALS（肌萎缩性侧索硬化症）和FTD（额颞叶性痴呆）（：21944778，21944779 PMID）相关联。研究表明，六核苷酸扩张可能导致前mRNA包含重复-的选择性稳定化，不溶性二肽重复蛋白聚集物的积累，可能是在FTD-ALS患者（PMID：23393093）致病。在多个转录剪接变异体导致编码不同亚型。 [由RefSeq的，2015年2月提供]
基因本体信息
C9orf72基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：
- 质膜
- 细胞质
- 细胞外
- 高尔基体
- 囊泡
- 细胞骨架
- 内质网
- 细胞核
- 内体
- 溶酶体
- 线粒体
C9orf72基因的本体（GO）信息：
| 疾病名称 | 关系值 | NofPmids | NofSnps | 来源 |
| Amyotrophic Lateral Sclerosis | 0.176112523 | 200 | 4 | BeFree_GAD_GWASCAT |
| AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS AND/OR FRONTOTEMPORAL DEMENTIA 1 | 0.122171535 | 8 | 0 | BeFree_CLINVAR |
| Juvenile arthritis | 0.12 | 1 | 0 | CTD_human |
| Frontotemporal dementia | 0.042887816 | 158 | 1 | BeFree |
| Pick Disease of the Brain | 0.040987723 | 151 | 0 | BeFree |
| Frontotemporal Lobar Degeneration | 0.020901024 | 77 | 1 | BeFree |
| GRN-related frontotemporal dementia | 0.00868614 | 32 | 0 | BeFree |
| Motor Neuron Disease | 0.006243163 | 23 | 2 | BeFree |
| Neurodegenerative Disorders | 0.005971721 | 22 | 0 | BeFree |
| AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS 1 | 0.004885954 | 18 | 0 | BeFree |
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