C4orf46 (chromosome 4 open reading frame 46)

symbol:
C4orf46
locus group:
protein-coding gene
location:
4q32.1
gene_family:
alias symbol:
LOC201725|RCDG1
alias name:
renal cancer differentiation gene 1
entrez id:
201725
ensembl gene id:
ENSG00000205208
ucsc gene id:
uc003iqa.4
refseq accession:
NM_001008393
hgnc_id:
HGNC:27320
approved reserved:
2008-07-14
4q32.1
基因染色体位置图

C4orf46(Chromosome 4 Open Reading Frame 46)是一个位于人类第4号染色体上的功能尚未完全明确的基因。目前关于C4orf46的研究相对有限,但已有研究表明它可能在细胞增殖、分化或代谢过程中发挥一定作用。该基因编码的蛋白质产物结构中含有保守的功能域,暗示其可能参与某些信号通路或分子相互作用。C4orf46的表达具有组织特异性,在某些器官如大脑、肝脏或肾脏中表达较高,但其具体生物学功能仍需进一步探索。突变或异常表达可能影响细胞的正常功能,但尚未明确与特定疾病的直接关联。过表达C4orf46可能干扰细胞周期或代谢平衡,而降低表达则可能影响某些组织的发育或功能。C4orf46属于一个尚未命名的基因家族,其家族成员通常具有相似的序列特征和潜在功能,可能参与基础细胞过程或组织特异性调控。由于研究尚不充分,C4orf46的具体机制和临床意义仍需更多实验验证。科学家正在利用基因编辑、表达分析和蛋白质互作研究等方法进一步揭示其功能。未来研究可能发现它与某些疾病如癌症或代谢紊乱的潜在联系,或阐明其在特定生理过程中的精确作用。

This gene encodes a small, conserved protein of unknown function that is expressed in a variety of tissues. There are pseudogenes for this gene on chromosomes 6, 8, 16, and X. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2013]

这个基因编码是在各种组织中表达的未知功能的小的,保守的蛋白质。有用于在染色体6,8,16这个基因假,并在多个转录变异体X的选择性剪接的结果。 [由RefSeq的,2013年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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C4orf46基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3210748       rs3210749       rs4596202       rs4690907       rs7697479       rs10024549       rs11100194       rs11544037       rs11556457       rs11725368       rs28396605       rs56169722       rs56397319       rs56789534       rs58788393       rs60001230       rs60999542      

C4orf46基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCTCCCTCCTCTTCAGAC
58
GTGGCTTCAAGAAGTTTGG
57
CCTTCGAGATCGATTGGAG
58
TGGCTTCAAGAAGTTTGGT
58
TTCTCCCTCCTCTTCAGAC
58
GTGGCTTCAAGAAGTTTGG
57
TTCGAGATCGATTGGAGGC
60
GTGGCTTCAAGAAGTTTGGT
59
CTTCTCCCTCCTCTTCAGAC
59
TGGCTTCAAGAAGTTTGGT
58
CTTCTCCCTCCTCTTCAGAC
59
TGGCTTCAAGAAGTTTGGT
58
CTTCGAGATCGATTGGAGG
58
TGGCTTCAAGAAGTTTGGT
58
TTCTCCCTCCTCTTCAGAC
58
TGGCTTCAAGAAGTTTGGT
58
TTCTCCCTCCTCTTCAGAC
58
TGGCTTCAAGAAGTTTGGT
58
      尚未收录相关数据

C4orf46基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

C4orf46基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q504U0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q504U0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q504U0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q504U0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 C4orf46基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Renal Cell Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree

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