BRDT (bromodomain testis associated)

symbol:
BRDT
locus group:
protein-coding gene
location:
1p22.1
gene_family:
alias symbol:
BRD6|CT9
alias name:
cancer/testis antigen 9
entrez id:
676
ensembl gene id:
ENSG00000137948
ucsc gene id:
uc001dol.5
refseq accession:
NM_207189
hgnc_id:
HGNC:1105
approved reserved:
1997-08-15
1p22.1
基因染色体位置图

BRDT(Bromodomain Testis-Specific Protein)是一种在睾丸中特异性表达的基因,属于溴结构域(Bromodomain)蛋白家族。溴结构域是一类能够识别并结合乙酰化组蛋白的蛋白质结构域,主要参与染色质重塑和基因转录调控。BRDT基因编码的蛋白质含有两个溴结构域和一个额外的末端结构域(ET domain),这些结构域使其能够与乙酰化的组蛋白结合,从而调控精子发生(spermatogenesis)过程中的基因表达。BRDT主要在精原细胞和减数分裂后的生精细胞中表达,对精子形成至关重要。BRDT的功能异常或突变可能导致男性不育,因为它会影响减数分裂和染色质浓缩等关键步骤。研究发现,BRDT基因的突变或缺失会导致精子发生停滞,表现为少精症(oligozoospermia)或无精症(azoospermia)。此外,BRDT还与某些癌症(如睾丸癌)的发生有关,可能通过调控细胞增殖相关基因的表达发挥作用。如果BRDT过表达,可能会干扰正常的精子发生过程,导致生精细胞异常增殖或凋亡失衡;而降低表达则可能导致精子发生障碍,进而引发不育。BRDT属于溴结构域和额外末端结构域(BET)蛋白家族,该家族包括BRD2、BRD3、BRD4和BRDT等成员。BET家族蛋白的共同特点是含有两个溴结构域,能够识别乙酰化组蛋白并参与转录调控,在细胞增殖、分化和肿瘤发生中发挥重要作用。由于BRDT在睾丸中的特异性表达,它成为男性避孕药物开发的潜在靶点,抑制其功能可能提供一种可逆的避孕方法。

BRDT is similar to the RING3 protein family. It possesses 2 bromodomain motifs and a PEST sequence (a cluster of proline, glutamic acid, serine, and threonine residues), characteristic of proteins that undergo rapid intracellular degradation. The bromodomain is found in proteins that regulate transcription. Several transcript variants encoding multiple isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2011]

BRDT类似于RING3蛋白家族。它具有2溴区基序和一个PEST序列(脯氨酸,谷氨酸,丝氨酸和苏氨酸残基簇),它经历快速细胞内降解的蛋白质的特性。该布罗莫是在调节转录蛋白质中。已发现该基因编码多种亚型几个抄本变形。 [由RefSeq的,2011年6月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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BRDT基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs766665       rs766666       rs928015       rs996512       rs1064566       rs1064567       rs1064568       rs1064570       rs1156281       rs1328592       rs1328593       rs1410583       rs1571420       rs1887812       rs1887813       rs1969967       rs2031891      

BRDT基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGCCCAGTTCCTCTTAGG
60
AATAGCTGTTTGTCGACTTGG
59
CTCTGAAGGGAACTCTTCTG
57
TACAGCTTTAAGCTGCTCC
58
AACTACAGTTGCCTCCTGG
59
GGCATCTGAGATAATTTCTGCA
59
AAGAAAGAGATAGCTGCTATGG
58
ATAGCTGTTTGTCGACTTGG
58
CTGTAGTCCCAGCTACTCG
59
CTGTCTACAAGTACATGTCCTC
58
CAATCACATAAGTCCGGGC
59
AATTACAGTACAGGCAGCAG
58
TTGCTACAAGTACAATCCTCCA
60
ATCCTGAAGCATTCTTGCC
58
TATAACAAGCCTGGAGATGAC
57
GTGGCATCTGAGATAATTTCTG
57
CTGTAGTCCCAGCTACTCG
59
CTGTCTACAAGTACATGTCCTC
58
ATCACATAAGGATTGTGGTGG
58
AAAGTGCTGAGATTACAGGG
58
      尚未收录相关数据

BRDT基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BRDT基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001207
Q58F21 (UniProtKB)
ISS
GO:0003713
Q58F21 (UniProtKB)
TAS
GO:0005634
Q58F21 (UniProtKB)
ISS
GO:0006338
Q58F21 (UniProtKB)
ISS
GO:0006351
Q58F21 (UniProtKB)
IEA
GO:0006397
Q58F21 (UniProtKB)
IEA
GO:0007140
Q58F21 (UniProtKB)
ISS
GO:0007141
Q58F21 (UniProtKB)
ISS
GO:0007283
Q58F21 (UniProtKB)
ISS
GO:0008380
Q58F21 (UniProtKB)
IEA
GO:0030154
Q58F21 (UniProtKB)
IEA
GO:0042393
Q58F21 (UniProtKB)
IDA
GO:0043484
Q58F21 (UniProtKB)
ISS
GO:0051039
Q58F21 (UniProtKB)
ISS
GO:0070577
Q58F21 (UniProtKB)
ISS

可能调控 BRDT基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Azoospermia 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Oligospermia 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Subfertility 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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