BPIFA4P (BPI fold containing family A member 4, pseudogene)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
BPIFA4P
locus group:
pseudogene
location:
20q11.21
gene_family:
BPI fold containing
alias symbol:
BASE
alias name:
breast cancer and salivary gland e…
entrez id:
317716
ensembl gene id:
ENSG00000183566
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_026760
hgnc_id:
HGNC:20469
approved reserved:
2011-07-29

基因染色体位置

基因染色体位置

20q11.21
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

BPIFA4P基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs735624       rs735625       rs735626       rs911139       rs1040795       rs2377795       rs3887270       rs6057749       rs6057751       rs6057752       rs6057753       rs6057754       rs6057755       rs6057756       rs6057757       rs6057758       rs6059149      

基因表达

基因表达

BPIFA4P基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAACACTGTTAGCATACAGGT
58
GTGGCCTCCTTTCTTTGAG
58
GAAATCCAGGGACCTGACC
60
GCAGAGGATGAGACAAGCA
60
CCTTAATGATTTGACTCAAGGACTC
60
GCACTACTCAATGGTTTCTGG
59
TCCCAGCTCCTTAATGTGG
59
TTTCACCTGTATGCTAACAGTG
59
TCAATCCGAATCAGCTTCTG
58
AATCAACACGATCTACGCA
57
CAGCTCCTTAATGATTTGACTC
57
ACTCAATGGTTTCTGGAGG
57
GAGAAATCCAGGGACCTGAC
60
AGAGGATGAGACAAGCAGC
60
ATCAATCCGAATCAGCTTCTG
59
ATCAACACGATCTACGCAG
58
TTCCCAGCTCCTTAATGTG
57
TTCACCTGTATGCTAACAGTG
58
CTTCGATGGTGTATCAGGC
58
TTCACCTGTATGCTAACAGTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

BPIFA4P基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BPIFA4P基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
Q86YQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0008289
Q86YQ2 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 BPIFA4P基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000814326 3 0 BeFree
Neoplasm, Residual 0.000542884 2 0 BeFree
Wasting Disease, Chronic 0.000271442 1 0 BeFree
Leukemia, Lymphocytic, Acute, L1 0.000271442 1 0 BeFree
MULTICYSTIC RENAL DYSPLASIA, BILATERAL 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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