BORCS7-ASMT (BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate))

symbol:
BORCS7-ASMT
locus group:
other
location:
10q24.32
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None
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HGNC:49183
approved reserved:
2013-09-25
10q24.32
基因染色体位置图

BORCS7-ASMT是一个嵌合基因,由BORCS7(BLOC-1 Related Complex Subunit 7)和ASMT(乙酰血清素-O-甲基转移酶)两个基因融合而成。BORCS7属于BORC复合体(BLOC-1 Related Complex)的亚基之一,该复合体参与溶酶体定位和运输,对维持细胞内稳态至关重要。ASMT则是褪黑激素合成途径中的关键酶,负责将乙酰血清素转化为褪黑激素,调节昼夜节律和睡眠。BORCS7-ASMT融合基因的生物学功能尚不完全清楚,但可能保留了部分ASMT的酶活性,影响褪黑激素的合成。该基因的主要作用位点可能涉及松果体(褪黑激素的主要合成部位)以及溶酶体相关通路。BORCS7-ASMT的突变可能干扰溶酶体功能或褪黑激素水平,进而影响睡眠、情绪或神经退行性疾病。研究表明,ASMT基因的异常与抑郁症、自闭症谱系障碍和精神分裂症等精神疾病相关,而BORCS7的异常可能影响神经元的健康。如果BORCS7-ASMT过表达,可能导致褪黑激素水平异常升高或溶酶体功能紊乱,影响昼夜节律或引发溶酶体贮积症;降低表达则可能导致褪黑激素不足,引发睡眠障碍或情绪问题。BORCS7属于BORC基因家族,该家族成员共同参与溶酶体运输和定位,维持细胞内物质降解和信号传导的平衡。ASMT属于甲基转移酶家族,其成员通常参与小分子的甲基化修饰,影响代谢和信号通路。BORCS7-ASMT的嵌合特性使其可能同时具备溶酶体调节和激素合成的双重功能,但具体机制仍需进一步研究。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring C10orf32 (chromosome 10 open reading frame 32) and AS3MT (arsenic, +3 oxidation state, methyltransferase) genes. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is therefore unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Dec 2010]

这一位点代表自然发生的周边C10orf32(染色体10开放阅读框32)和AS3MT(砷,+3氧化态,甲基)基因之间通读转录。的通读转录为无义介导的mRNA降解(NMD)的候选,因此,不太可能产生蛋白质产物。 [由RefSeq的,2010年12月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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BORCS7-ASMT基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs600266       rs1046778       rs1591915       rs3740390       rs3740391       rs3740392       rs3740393       rs3740394       rs3740400       rs3832685       rs4363528       rs4568943       rs4917986       rs7084472       rs7085104       rs7085598       rs7085854      

BORCS7-ASMT基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

BORCS7-ASMT基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BORCS7-ASMT基因的本体(GO)信息:

可能调控 BORCS7-ASMT基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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