BLACAT1 (BLACAT1 overlapping LEMD1 locus)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
BLACAT1
locus group:
protein-coding gene
location:
1q32.1
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
linc-UBC1|LINC00912|onco-lncRNA-30
alias name:
long intergenic noncoding RNA up-r…
entrez id:
101669762
ensembl gene id:
ENSG00000281406
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NM_001397426
hgnc_id:
HGNC:48597
approved reserved:
2013-05-21

基因染色体位置

基因染色体位置

1q32.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

BLACAT1（Bladder Cancer Associated Transcript 1）是一种长链非编码RNA（lncRNA），最初被发现与膀胱癌的发生发展密切相关。它位于人类染色体1q32.1区域，属于非编码RNA家族，不编码蛋白质但通过调控基因表达参与多种生物学过程。BLACAT1在多种癌症中异常表达，包括膀胱癌、胃癌、结直肠癌和卵巢癌等，通常作为致癌基因发挥作用。其表达产物通过表观遗传调控、转录调控或作为竞争性内源RNA（ceRNA）影响下游信号通路。BLACAT1的主要作用位点包括与染色质修饰复合物相互作用或吸附微小RNA（miRNA）来调控靶基因表达。例如，在膀胱癌中，BLACAT1通过吸附miRNA如miR-558来上调 heparanase（HPSE）的表达，促进肿瘤侵袭和转移。突变对BLACAT1功能的影响研究较少，但其表达水平的变化显著影响癌症进展。BLACAT1过表达通常与肿瘤恶性程度高、预后差相关，促进细胞增殖、迁移和侵袭，抑制凋亡；而降低其表达则能抑制肿瘤生长和转移。BLACAT1还参与调控上皮-间质转化（EMT）、血管生成和化疗耐药等过程。此外，BLACAT1与某些疾病如心血管疾病和炎症反应也有潜在关联。BLACAT1属于lncRNA家族，该家族成员通常不编码蛋白质但通过多种机制调控基因表达，参与细胞分化、发育和疾病发生。BLACAT1的异常表达可能影响其他基因如细胞周期相关基因（如Cyclin D1）或信号通路分子（如Wnt/β-catenin和PI3K/AKT），进而扰乱正常细胞功能。研究BLACAT1有助于理解癌症机制并开发新的诊断标志物或治疗靶点。

None

无

OMIM数据库中对BLACAT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对BLACAT1基因的介绍

基因序列

基因序列

BLACAT1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

BLACAT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs877623       rs884554       rs913724       rs913725       rs913726       rs1059657       rs1887976       rs1999131       rs1999132       rs3738744       rs3738745       rs3795551       rs3795552       rs3795553       rs3795554       rs3835299       rs4951000      

基因表达

基因表达

BLACAT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATAACAGGTGGCGATGAG
58
TTTATAATGCGTGCCTTCCT
58
TGGATGGAAGTGGTATGGT
58
ACTTGCCTTTCCCTCTCAC
60
GATGGAAGTGGTATGGTGG
58
TGACTTGCCTTTCCCTCTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

BLACAT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BLACAT1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 BLACAT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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