BIVM-ERCC5 (BIVM-ERCC5 readthrough)

symbol:
BIVM-ERCC5
locus group:
other
location:
13q33.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100533467
ensembl gene id:
ENSG00000270181
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None
refseq accession:
NM_001204425
hgnc_id:
HGNC:43690
approved reserved:
2013-05-10
13q33.1
基因染色体位置图

BIVM-ERCC5是一个融合基因,由BIVM(Basic, Immunoglobulin-like Variable Motif Containing)基因和ERCC5(Excision Repair Cross-Complementation Group 5)基因通过染色体易位或重排形成。ERCC5又称XPG,属于核酸切除修复(NER)通路的关键基因,负责修复DNA损伤,特别是紫外线引起的嘧啶二聚体。ERCC5编码的XPG蛋白是一种结构特异性内切酶,在NER过程中切割损伤DNA的3'端。若ERCC5发生突变,会导致NER功能缺陷,引发着色性干皮病(XP)、科凯恩综合征(CS)等遗传病,增加皮肤癌风险。BIVM的功能尚不明确,但可能与内质网相关蛋白的转运或免疫调节有关。BIVM-ERCC5融合可能导致ERCC5功能异常,影响DNA修复能力,从而促进基因组不稳定性和肿瘤发生。若ERCC5过表达,可能增强DNA修复能力,但过度激活可能干扰正常细胞周期;若表达降低,则会导致DNA损伤积累,诱发突变或细胞凋亡。ERCC5属于ERCC基因家族,该家族成员均参与DNA修复,如ERCC1、ERCC2(XPD)、ERCC3(XPB)等,共同维护基因组稳定性。BIVM-ERCC5融合基因的发现为研究某些癌症(如淋巴瘤、白血病)的分子机制提供了线索,但其具体致病机制仍需进一步探索。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring BIVM (basic, immunoglobulin-like variable motif containing) and ERCC5 (excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 5) genes on chromosome 13. The read-through transcript encodes a fusion protein that shares sequence identity with the products of each individual gene. [provided by RefSeq, Feb 2011]

这一位点代表自然发生的通读转录邻近BIVM(含碱性,免疫球蛋白样可变图案)和ERCC5之间(切除修复交叉互补灭鼠修复缺陷,互补组5)基因在染色体13的读取 - 通过转录物编码共享与每个基因的产物的序列同一性的融合蛋白。 [由RefSeq的,2011年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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BIVM-ERCC5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4743       rs9676       rs17655       rs732321       rs751402       rs768502       rs873601       rs943245       rs943246       rs943247       rs1047768       rs1047769       rs1047778       rs1140184       rs1323697       rs1323698       rs1323699      

BIVM-ERCC5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCAGAAGGAATGTCCTCAGC
59
ATGCAGTACCATCGTCTGAG
59
GAAACAGACTTTGGTGAAGAG
57
TTCAGAAGCTTCTCTGTCG
57
AGAAACAGACTTTGGTGAAGAG
58
TCAGAAGCTTCTCTGTCGT
58
      尚未收录相关数据

BIVM-ERCC5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BIVM-ERCC5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003697
R4GMW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0004519
R4GMW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
R4GMW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006289
R4GMW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0090305
R4GMW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0090305
R4GMW8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 BIVM-ERCC5基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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