BAZ2B (bromodomain adjacent to zinc finger domain 2B)

symbol:
BAZ2B
locus group:
protein-coding gene
location:
2q24.2
gene_family:
PHD finger proteins
alias symbol:
WALp4
alias name:
None
entrez id:
29994
ensembl gene id:
ENSG00000123636
ucsc gene id:
uc002uao.4
refseq accession:
NM_001289975
hgnc_id:
HGNC:963
approved reserved:
1999-09-06
2q24.2
基因染色体位置图

BAZ2B(溴结构域相邻锌指蛋白2B)属于BAZ基因家族,该家族成员通常含有溴结构域和锌指结构域,参与染色质重塑和基因转录调控。BAZ2B的主要功能是通过其溴结构域识别组蛋白乙酰化修饰,从而调控基因表达,尤其在神经发育和突触可塑性中发挥重要作用。它主要作用于染色质,通过与其他蛋白质(如组蛋白去乙酰化酶复合物)相互作用来抑制或激活靶基因。BAZ2B的突变可能导致其功能异常,与神经发育障碍如智力障碍、自闭症谱系障碍(ASD)和精神分裂症等疾病相关。若BAZ2B过表达,可能引起基因表达失调,影响神经细胞的正常分化和功能,甚至促进某些癌症的发生;而降低表达则可能导致突触功能异常或认知缺陷。BAZ2B与家族成员BAZ2A在结构上相似,均参与表观遗传调控,但BAZ2A更多与核糖体RNA转录相关,而BAZ2B偏向神经系统的调控。研究表明,BAZ2B的表达水平变化可能影响其他神经相关基因(如BDNF、SYN1)的表达,进一步影响神经元活动和行为。总体而言,BAZ2B在神经系统中具有关键作用,其异常表达或突变可能导致多种疾病,是潜在的药物靶点。

None

BAZ2B基因的碱基序列:[NCBI]
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BAZ2B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs740       rs741       rs3670       rs174221       rs174222       rs174223       rs174224       rs174225       rs174226       rs174227       rs174228       rs174229       rs174230       rs174231       rs174232       rs242514       rs357006      

BAZ2B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTCTAATAACAGGATACAAGGC
58
TTCACACCAACATTCAGCA
57
AAACATCAGGAACGAGAGC
57
GCTGCTCTAGTTTACGCTC
58
ATTGGAATATGGCTGGCAG
58
GGAGCATAATATGCTACTTCTCC
58
CCACATTGATCACAATATGGAG
57
GTGTCGAAGATGAAGTTGGT
58
GCTCAGCAAATTCTAGAGGC
59
TATGCCTCTCCAACTCCTG
58
ACAGTAAGGTTTCCCAACAG
57
TAACATTCAACTGGCTAGCA
57
CATTGCTAAGGCAAGTGGT
58
GCCTTTCTTTGACTCATTAGTC
57
ACCCATGTGGACATTTATTCAG
58
TAGACCAAAGACTGGGTGG
58
TCTTCGACACCTTCTGTGG
59
CTGAATAAATGTCCACATGGGT
58
TACAGTAAGGTTTCCCAACAG
57
AACATTCAACTGGCTAGCA
57
      尚未收录相关数据

BAZ2B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BAZ2B基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
A0A0A0MR97 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
A0A0A0MR97 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
H7C092 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
H7C092 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q9UIF8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9UIF8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UIF8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UIF8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UIF8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UIF8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UIF8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9UIF8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q9UIF8 (UniProtKB)
NAS
GO:0006355
Q9UIF8 (UniProtKB)
NAS
GO:0008270
Q9UIF8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 BAZ2B基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Sudden Cardiac Arrest 0.12 1 1 GWASCAT
Sudden Cardiac Death 0.002367032 1 1 GAD

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