BARX1 (BARX homeobox 1)

symbol:
BARX1
locus group:
protein-coding gene
location:
9q22.32
gene_family:
NKL subclass homeoboxes and pseudogenes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
56033
ensembl gene id:
ENSG00000131668
ucsc gene id:
uc010mrh.4
refseq accession:
NM_021570
hgnc_id:
HGNC:955
approved reserved:
2000-07-12
9q22.32
基因染色体位置图

BARX1(BarH-like homeobox 1)是一个属于BARX基因家族的成员,该家族还包括BARX2,它们共同特点是含有同源异型盒(homeobox)结构域,这类基因在胚胎发育和组织分化中起关键调控作用,尤其在颅面部、牙齿和消化系统的形态发生中表现突出。BARX1编码的蛋白质作为转录因子,通过结合特定DNA序列调控下游基因表达,其典型作用位点包括间充质组织,如颌骨、牙乳头和胃间质,参与细胞增殖、分化和组织模式形成。在牙齿发育中,BARX1决定磨牙的形成位置,若其功能缺失会导致磨牙缺失或形态异常;而在胃发育中,它调控胃窦部特异性标志物的表达。突变或表达异常可能引发先天性疾病,如牙齿发育障碍(如少牙症)或胃部畸形。研究发现BARX1在多种癌症(如胃癌、结直肠癌)中异常表达,可能通过影响WNT/β-catenin等信号通路促进肿瘤侵袭。过表达BARX1可能加速某些组织(如胃上皮)的异常增殖,甚至诱发癌前病变;而敲低表达则可能导致发育缺陷(如颅面骨骼畸形)或器官功能障碍。该基因与家族成员BARX2功能部分冗余,但BARX1更集中于颌面部和胃的发育,而BARX2在肌肉和神经系统作用更显著。整体上,BARX1通过时空特异性表达调控形态发生,其精确表达水平对维持组织稳态至关重要。

This gene encodes a member of the Bar subclass of homeobox transcription factors. Studies of the mouse and chick homolog suggest the encoded protein may play a role in developing teeth and craniofacial mesenchyme of neural crest origin. The protein may also be associated with differentiation of stomach epithelia. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的同源转录因子的栏的子类的成员。鼠标和小鸡同源的研究表明,这种编码的蛋白可能参与显影的牙齿和神经嵴起源颅面间质的作用。该蛋白质也可以与胃上皮的分化有关。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

BARX1基因的碱基序列:[NCBI]
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BARX1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1057713       rs1057715       rs1343899       rs2297835       rs4563951       rs7872123       rs11347798       rs11552443       rs11789015       rs11793324       rs11793856       rs12684081       rs41281146       rs57483569       rs59397123       rs73519466       rs73519470      

BARX1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCGGACAGAATAGATCTTGCT
60
ACTTCATCCTCCGATTCTGG
59
CCGGACAGAATAGATCTTGCT
60
ACTTCATCCTCCGATTCTGG
59
CCGGACAGAATAGATCTTGC
58
CTTCATCCTCCGATTCTGG
57
CCGGACAGAATAGATCTTGC
58
CTTCATCCTCCGATTCTGG
57
CCGGACAGAATAGATCTTGCT
60
CTTCATCCTCCGATTCTGGT
59
CCGGACAGAATAGATCTTGCT
60
CTTCATCCTCCGATTCTGGT
59
      尚未收录相关数据

BARX1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BARX1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000977
Q9HBU1 (UniProtKB)
IBA
GO:0001228
Q9HBU1 (UniProtKB)
IBA
GO:0003700
Q9HBU1 (UniProtKB)
NAS
GO:0005634
Q9HBU1 (UniProtKB)
IBA
GO:0006357
Q9HBU1 (UniProtKB)
IBA
GO:0006366
Q9HBU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007267
Q9HBU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0009888
Q9HBU1 (UniProtKB)
IBA
GO:0009952
Q9HBU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0030178
Q9HBU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0030855
Q9HBU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
Q9HBU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0048513
Q9HBU1 (UniProtKB)
IBA
GO:0048536
Q9HBU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0055123
Q9HBU1 (UniProtKB)
IBA
GO:0007399
Q9HBU1 (UniProtKB)
IBA

可能调控 BARX1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Adenocarcinoma Of Esophagus 0.240271442 2 1 BeFree_CTD_human_GWASCAT
Digestive System Disorders 0.12 1 1 GWASCAT
Cleft Lip 0.00272435 1 0 LHGDN
Barrett Esophagus 0.000271442 1 0 BeFree
IRIDOGONIODYSGENESIS, TYPE 2 0.000271442 1 0 BeFree

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