BANK1 (B cell scaffold protein with ankyrin repeats 1)

symbol:
BANK1
locus group:
protein-coding gene
location:
4q24
gene_family:
Ankyrin repeat domain containing
alias symbol:
BANK|FLJ20706
alias name:
None
entrez id:
55024
ensembl gene id:
ENSG00000153064
ucsc gene id:
uc003hvy.5
refseq accession:
NM_017935
hgnc_id:
HGNC:18233
approved reserved:
2003-10-24
4q24
基因染色体位置图

BANK1(B细胞支架蛋白含锚蛋白重复1)是一种主要在B细胞中表达的基因,属于锚蛋白重复基因家族。该基因编码的蛋白质作为支架蛋白,参与B细胞受体(BCR)信号通路的调控,对B细胞的活化、增殖和分化至关重要。BANK1蛋白通过其多个结构域(如PH结构域和锚蛋白重复序列)与其他信号分子(如Lyn、IP3R和PLCγ2)相互作用,调节钙离子信号和下游激酶活性。BANK1基因的突变或功能异常与多种自身免疫性疾病密切相关,特别是系统性红斑狼疮(SLE)和类风湿关节炎(RA)。研究发现,某些单核苷酸多态性(SNP)如rs10516487和rs3733197可能通过改变BANK1的表达或功能,导致B细胞过度活化,从而促进自身抗体的产生和炎症反应。BANK1过表达可能增强B细胞信号传导,加剧自身免疫反应,而降低表达则可能削弱B细胞功能,影响免疫应答。BANK1属于锚蛋白重复基因家族,该家族成员通常含有保守的锚蛋白重复序列,介导蛋白质间相互作用,参与细胞信号转导、细胞周期调控和炎症反应等过程。BANK1的功能研究为理解自身免疫疾病的发病机制提供了重要线索,并可能成为潜在的治疗靶点。

The protein encoded by this gene is a B-cell-specific scaffold protein that functions in B-cell receptor-induced calcium mobilization from intracellular stores. This protein can also promote Lyn-mediated tyrosine phosphorylation of inositol 1,4,5-trisphosphate receptors. Polymorphisms in this gene are associated with susceptibility to systemic lupus erythematosus. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2009]

由该基因编码的蛋白质是B细胞特异性支架蛋白,在B细胞受体诱导的动员从细胞内储存钙的功能。这种蛋白也可以促进1,4,5-三磷酸肌醇受体林恩介导的酪氨酸磷酸化。在这种基因多态性与易感性系统性红斑狼疮相关联。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2009年10月提供]

BANK1基因的碱基序列:[NCBI]
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BANK1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs727085       rs727086       rs767052       rs901406       rs918363       rs923206       rs923207       rs957458       rs976654       rs1027012       rs1027013       rs1125271       rs1317829       rs1345568       rs1352173       rs1352174       rs1352175      

BANK1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTGCATATGGTGAAGGTTGG
59
CTAGTGCTGATGTGGTTGG
58
CAGATTCTGAAGACTACTTTGAGG
59
CACCAGGATTCTCACATGGA
60
CGAGACTGCATTATTGGGA
57
AGTTTCCTTACCACCTGGA
58
CTGAAATTCCATGTGAGAATCC
58
ATTCAACCTCTACAGTATCACC
57
CTGAAATTCCATGTGAGAATCC
58
ATTCAACCTCTACAGTATCACC
57
CCTTACCAGGGACAATGGT
59
CTCCTGTTTCTTGTCTAACACC
59
CCTTACCAGGGACAATGGT
59
CTCCTGTTTCTTGTCTAACACC
59
CTGAAATTCCATGTGAGAATCC
58
ATTCAACCTCTACAGTATCACC
57
CAGATTCTGAAGACTACTTTGAGG
59
CACCAGGATTCTCACATGGA
60
TATGGTGAAGGTTGGGCTG
60
AAGCCTAGTGCTGATGTGG
60
      尚未收录相关数据

BANK1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

BANK1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0042113
Q8NDB2 (UniProtKB)
IEA
GO:0043410
Q8NDB2 (UniProtKB)
IEA
GO:0045947
Q8NDB2 (UniProtKB)
IEA
GO:0050869
Q8NDB2 (UniProtKB)
IEA
GO:0051898
Q8NDB2 (UniProtKB)
IEA
GO:1900165
Q8NDB2 (UniProtKB)
IEA

可能调控 BANK1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lupus Erythematosus, Systemic 0.264646467 16 3 BeFree_CTD_human_GAD_GWASCAT_LHGDN
Crohn Disease 0.12 1 1 GWASCAT
Antiphospholipid Syndrome 0.004734064 2 0 GAD
Systemic Scleroderma 0.003724241 5 2 BeFree_GAD
Autoimmune Diseases 0.003181358 4 0 BeFree_GAD
Rheumatoid Arthritis 0.003181358 3 9 BeFree_GAD
Diffuse Scleroderma 0.002909916 2 0 BeFree_GAD
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Giant Cell Arteritis 0.002638474 1 0 BeFree_GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

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