ATR (ATR serine/threonine kinase)

symbol:
ATR
locus group:
protein-coding gene
location:
3q23
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FRP1|SCKL|SCKL1|MEC1
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MEC1, mitosis entry checkpoint 1, …
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uc003eux.5
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NM_001184
hgnc_id:
HGNC:882
approved reserved:
1998-04-06
3q23
基因染色体位置图

ATR(共济失调毛细血管扩张症和Rad3相关蛋白)是一种重要的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,属于PIKK(磷脂酰肌醇3-激酶相关激酶)家族,与ATM(共济失调毛细血管扩张症突变蛋白)共同参与DNA损伤应答(DDR)通路。ATR的主要功能是感知DNA复制压力(如单链DNA断裂或停滞的复制叉)并激活下游信号通路,通过磷酸化靶蛋白(如CHK1、p53)来阻滞细胞周期、促进DNA修复或诱导凋亡,从而维持基因组稳定性。ATR的作用位点集中在DNA损伤部位,其激活依赖于ATRIP(ATR相互作用蛋白)和TOPBP1等辅助因子。突变或功能缺失会导致严重的基因组不稳定性,表现为对复制压力极度敏感,与多种癌症(如卵巢癌、乳腺癌)和发育障碍相关。ATR过表达可能增强细胞对DNA损伤的耐受性,但可能促进肿瘤细胞存活;而表达降低或抑制会加剧基因组不稳定性,使癌细胞对化疗或放疗更敏感,因此ATR抑制剂(如AZD6738)正在临床试验中用于癌症治疗。PIKK家族成员(包括ATM、mTOR、DNA-PK等)均具有大分子量、C端激酶结构域和参与应激反应的特点,但ATR独特地专注于复制压力应答。该基因还与Seckel综合征(一种侏儒症伴智力障碍)相关,其部分突变导致功能削弱而非完全丧失。

The protein encoded by this gene belongs the PI3/PI4-kinase family, and is most closely related to ATM, a protein kinase encoded by the gene mutated in ataxia telangiectasia. This protein and ATM share similarity with Schizosaccharomyces pombe rad3, a cell cycle checkpoint gene required for cell cycle arrest and DNA damage repair in response to DNA damage. This kinase has been shown to phosphorylate checkpoint kinase CHK1, checkpoint proteins RAD17, and RAD9, as well as tumor suppressor protein BRCA1. Mutations of this gene are associated with Seckel syndrome. An alternatively spliced transcript variant of this gene has been reported, however, its full length nature is not known. Transcript variants utilizing alternative polyA sites exist. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质所属的PI3 / PI4激酶家族,和最密切相关的自动取款机,通过在共济失调毛细血管扩张症突变的基因编码的蛋白质激酶。这种蛋白质和ATM份额相似性裂殖酵母RAD3,以应对DNA损伤的细胞周期阻滞和DNA损伤修复所需要的细胞周期检验点的基因。这种激酶已经显示出磷酸化的检查点激酶CHK1,关卡蛋白RAD17,和RAD9,以及肿瘤抑制蛋白的BRCA1。此基因的突变与泽克尔综合征。这个基因的可变剪接转录物变体已有报道,但是,它的全长性质是未知的。成绩单变种利用替代多聚腺苷酸位点存在。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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ATR基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1129391       rs1129393       rs1129395       rs1802904       rs1804758       rs2227928       rs2227929       rs2227930       rs2227931       rs2227932       rs2229032       rs2229033       rs3223772       rs3922730       rs3922731       rs3923464       rs4256152      

ATR基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGCAGAGTACTTGTTGGG
58
GTTTGGCATTGAATCTCCTC
57
CAATTGTGGAGGAGATTTCCTG
59
CTTCTGAGAACTCTTGTATCTGG
59
CGAGAGCCTTTAATGAGTGTC
59
CCAGTTTCATTCAGTGGCG
60
CGAGAGCCTTTAATGAGTGTC
59
CCAGTTTCATTCAGTGGCG
60
TAGCTATTCACCACAGGCA
58
GCTGTTCTCCACTCAAGGA
59
CAGTAATAGTGATGGAATATCACCC
59
TGAAAGTACGGTCCTCAGTC
59
TTGAAAGAGGCTCCTACCA
58
TAATCTGGTCTGGAGAATGCT
59
AAGGGTACTTCCCTTGATCTG
59
GGTCTTGGCTTAATGAGGTC
58
ATTGTACCTCTTTCAGCTGC
58
CACATAACATGTGCAATCTCAC
58
CGAGAGCCTTTAATGAGTGTC
59
CCAGTTTCATTCAGTGGCG
60
      尚未收录相关数据

ATR基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ATR基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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D6RFJ6 (UniProtKB)
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IMP
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IC
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TAS
GO:1901796
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TAS
GO:1904884
Q13535 (UniProtKB)
IMP
GO:0000784
Q13535 (UniProtKB)
IC

可能调控 ATR基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
CUTANEOUS TELANGIECTASIA AND CANCER SYNDROME, FAMILIAL 0.36 1 1 CLINVAR_ORPHANET_UNIPROT
Seckel syndrome 0.322985861 11 0 BeFree_CTD_human_MGD_ORPHANET
Urologic Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Pneumoconiosis 0.12 1 0 CTD_human
Malignant neoplasm of breast 0.017926433 11 0 BeFree_GAD
Malignant neoplasm of lung 0.007372538 4 0 BeFree_GAD
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.005895776 14 0 BeFree_GAD
Anoxia 0.0054487 2 0 LHGDN
Colonic Neoplasms 0.005091382 1 0 GAD_LHGDN
Pancreatic Neoplasm 0.005005506 3 0 BeFree_GAD

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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