ATP6V1G2-DDX39B (ATP6V1G2-DDX39B readthrough (NMD candidate))

symbol:
ATP6V1G2-DDX39B
locus group:
other
location:
6p21.33
gene_family:
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None
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None
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100532737
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ENSG00000254870
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uc063nav.1
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NR_037853.1
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HGNC:41999
approved reserved:
2011-05-31
6p21.33
基因染色体位置图

ATP6V1G2-DDX39B是一个融合基因,由ATP6V1G2基因和DDX39B基因通过染色体易位或重排形成。ATP6V1G2编码液泡型ATP酶(V-ATPase)的G亚基,该酶负责在细胞内酸化细胞器如溶酶体和内体,参与蛋白质降解、膜运输和pH调节。DDX39B则属于DEAD-box RNA解旋酶家族,参与mRNA剪接、核输出和翻译调控,对基因表达至关重要。融合基因可能导致两个基因功能的异常结合或失调,例如影响V-ATPase的质子泵功能或干扰RNA代谢过程。突变或异常表达可能破坏细胞稳态,如溶酶体功能受损或mRNA加工异常,进而影响细胞增殖或凋亡。研究表明,DDX39B的过表达与某些癌症(如淋巴瘤和白血病)相关,可能通过激活致癌信号通路(如NF-κB)促进肿瘤发生;而ATP6V1G2的异常表达可能影响肿瘤微环境酸化,促进侵袭和转移。若该融合基因过表达,可能增强上述致癌效应,而表达降低则可能抑制相关功能,但具体机制仍需进一步研究。ATP6V1G2属于V-ATPase基因家族,其成员均参与质子跨膜运输;DDX39B属于DEAD-box解旋酶家族,特点是具有保守的ATP依赖的RNA解旋酶活性,参与RNA代谢。该融合基因的发现为相关疾病的分子机制和治疗靶点提供了新线索。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring ATP6V1G2 (ATPase, H+ transporting, lysosomal 13kDa, V1 subunit G2) and DDX39B (DEAD box polypeptide 39B) genes located in the major histocompatibility complex class III region of chromosome 6. The read-through transcript and is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is thus unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Feb 2011]

这一位点代表自然发生的周边ATP6V1G2(ATP酶,H +运输,溶酶体13kDa,V1亚基G2)和DDX39B(DEAD盒多肽39B)位于主要组织相容性染色体复杂III类区基因之间通读转录6.通读转录,并且是无义介导的mRNA降解(NMD)的候选,并且因此不太可能产生的蛋白质产物。 [由RefSeq的,2011年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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ATP6V1G2-DDX39B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs10819       rs11264       rs11796       rs929138       rs933208       rs1055384       rs1055385       rs1055388       rs1129640       rs1266079       rs2071591       rs2071592       rs2071593       rs2071594       rs2071595       rs2071596       rs2075580      

ATP6V1G2-DDX39B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TAATTCCAGCTAGGGCCTG
59
GGTCTTCTCTGTAGGCACC
60
AGATGCCAGAAAGAGGAAGG
60
CTTGCTCTGGAATTCGTGC
60
AGATGCCAGAAAGAGGAAGG
60
CTTGCTCTGGAATTCGTGC
60
ATAATTCCAGCTAGGGCCTG
59
GTCTTCTCTGTAGGCACCC
60
AGATGCCAGAAAGAGGAAGG
60
TCTGGAATTCGTGCTCTCG
60
AGATGCCAGAAAGAGGAAGG
60
TCTGGAATTCGTGCTCTCG
60
GATGCCAGAAAGAGGAAGG
58
CTCTGGAATTCGTGCTCTC
58
TAATTCCAGCTAGGGCCTG
59
GTCTTCTCTGTAGGCACCC
60
GATGCCAGAAAGAGGAAGG
58
CTCTGGAATTCGTGCTCTC
58
      尚未收录相关数据

ATP6V1G2-DDX39B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ATP6V1G2-DDX39B基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0015992
F2Z307 (UniProtKB)
IEA
GO:0016471
F2Z307 (UniProtKB)
IEA
GO:0016820
F2Z307 (UniProtKB)
IEA
GO:0055085
F2Z307 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ATP6V1G2-DDX39B基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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