ATP2B3 (ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 3)

symbol:
ATP2B3
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq28
gene_family:
P-type ATPases
alias symbol:
PMCA3|CFAP39
alias name:
plasma membrane calcium-transporti…
entrez id:
492
ensembl gene id:
ENSG00000067842
ucsc gene id:
uc065btp.1
refseq accession:
NM_021949
hgnc_id:
HGNC:816
approved reserved:
1992-07-10
Xq28
基因染色体位置图

ATP2B3基因编码一种称为质膜钙转运ATP酶3(PMCA3)的蛋白质,属于P型ATP酶家族的ATP2B基因家族(也称为质膜钙ATP酶或PMCAs)。这个家族共有四个成员(ATP2B1-4),它们的主要功能是通过消耗ATP能量将细胞内的钙离子(Ca²⁺)主动转运到细胞外,从而维持细胞内钙离子浓度的稳态。钙离子是重要的第二信使,参与多种细胞过程如肌肉收缩、神经传递、基因表达和细胞凋亡等。ATP2B3主要在神经系统、骨骼肌和内分泌组织中高表达,尤其在神经元中发挥关键作用,调控突触传递和神经元兴奋性。该基因的突变可能导致功能异常,影响钙离子外排,造成细胞内钙超载,进而干扰神经信号传导。一些研究发现ATP2B3突变与神经系统疾病如共济失调、癫痫和智力障碍有关,还可能影响胰岛素分泌与糖尿病发生。当ATP2B3过表达时,可能过度降低细胞内钙浓度,影响依赖钙信号的生理过程如神经递质释放;而表达降低则会导致钙清除能力下降,引发钙依赖性细胞毒性或异常兴奋性。ATP2B基因家族的共性包括:都具有10个跨膜结构域,依赖ATP水解进行钙离子转运,且多数成员通过选择性剪接产生不同亚型以适应组织特异性需求。研究还发现ATP2B3与某些癌症如神经母细胞瘤相关,可能通过影响钙信号通路参与肿瘤发生。由于钙信号通路的广泛性,ATP2B3的功能异常可能对多种生理系统产生复杂影响,这使得它成为神经退行性疾病和代谢紊乱研究的潜在靶点。

The protein encoded by this gene belongs to the family of P-type primary ion transport ATPases characterized by the formation of an aspartyl phosphate intermediate during the reaction cycle. These enzymes remove bivalent calcium ions from eukaryotic cells against very large concentration gradients and play a critical role in intracellular calcium homeostasis. The mammalian plasma membrane calcium ATPase isoforms are encoded by at least four separate genes and the diversity of these enzymes is further increased by alternative splicing of transcripts. The expression of different isoforms and splice variants is regulated in a developmental, tissue- and cell type-specific manner, suggesting that these pumps are functionally adapted to the physiological needs of particular cells and tissues. This gene encodes the plasma membrane calcium ATPase isoform 3. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质属于家庭P型初级离子迁移ATP酶特征天冬氨酰磷酸的反应周期期间中间体的形成。这些酶移除真核细胞中的二价钙离子对非常大的浓度梯度,发挥细胞内钙稳态的关键作用。哺乳动物质膜钙ATP酶同种型是通过至少四个分开的基因编码,并且这些酶的多样性被进一步增加转录物的可变剪接。不同同种型和剪接变体的表达在发育,组织 - 和细胞类型特异性的方式被限制,这表明这些泵在功能上适用于特定的细胞和组织的生理需要。该基因编码质膜钙ATP酶同种型3。可替代地剪接转录变体编码不同同种型也已确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ATP2B3基因的碱基序列:[NCBI]
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ATP2B3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782821062       rs782820618       rs782819897       rs782820075       rs782819742       rs782818718       rs782817899       rs782818521       rs782817436       rs782817229       rs782817367       rs782817193       rs782817124       rs782814925       rs782816006       rs782814710       rs782813423      

ATP2B3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAACTAAGGTGGCTGAAGAC
58
GTTGAATGGATTTGGGTCCT
58
TTCAACTGACGGTCAATGTG
58
TCATAGGAAACTTCCAGAACTG
57
AGTTCCTGCAGTTTCAACTG
58
AGGAGAGTCCTGAGTAATGC
58
ACCAGAATCCAAGACCTCC
58
GTCATTGATCAGAAACTCGGG
59
TCCTGCAGTTTCAACTGAC
58
ACTTCCAGAACTGAGTAATGC
58
GCAGTTTCAACTGACGGTC
59
CTTTGAGAGGAGAGTCCTGAG
59
AACCAGAATCCAAGACCTCC
59
TCATTGATCAGAAACTCGGG
57
TTCCTGCAGTTTCAACTGAC
58
AGGAGAGTCCTGAGTAATGC
58
TTTCAACTGACGGTCAATGTG
59
CATAGGAAACTTCCAGAACTGAG
59
      尚未收录相关数据

ATP2B3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ATP2B3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005388
Q16720 (UniProtKB)
TAS
GO:0005516
Q16720 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
Q16720 (UniProtKB)
IEA
GO:0005794
Q16720 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q16720 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q16720 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q16720 (UniProtKB)
IBA
GO:0006810
Q16720 (UniProtKB)
TAS
GO:0006874
Q16720 (UniProtKB)
IBA
GO:0030165
Q16720 (UniProtKB)
IBA
GO:0034220
Q16720 (UniProtKB)
TAS
GO:0043231
Q16720 (UniProtKB)
IBA
GO:0046872
Q16720 (UniProtKB)
IEA
GO:0070588
Q16720 (UniProtKB)
IEA
GO:1903561
Q16720 (UniProtKB)
IDA
GO:1903779
Q16720 (UniProtKB)
TAS

可能调控 ATP2B3基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
SPINOCEREBELLAR ATAXIA, X-LINKED 1 0.24 1 1 CLINVAR_UNIPROT
Adenoma 0.120542884 2 0 BeFree_CTD_human
Hypertensive disease 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Hyperaldosteronism 0.12 1 0 CTD_human
Spinocerebellar Ataxia, X-Linked 5 0.12 0 0 ORPHANET
Aldosterone-Producing Adrenal Cortex Adenoma 0.12 0 3 CLINVAR
Attention deficit hyperactivity disorder 0.002367032 1 0 GAD
Cerebellar Ataxia 0.001085767 4 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000814326 3 0 BeFree

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