ATG5 (autophagy related 5)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ATG5
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protein-coding gene
location:
6q21
gene_family:
alias symbol:
ASP|APG5|hAPG5
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None
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NM_004849
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HGNC:589
approved reserved:
1999-09-16

基因染色体位置

基因染色体位置

6q21
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ATG5是自噬相关基因家族（ATG家族）的重要成员，在自噬过程中发挥核心作用。自噬是细胞通过形成双层膜结构的自噬体来降解受损细胞器或错误折叠蛋白质的重要机制，对维持细胞稳态至关重要。ATG5编码的蛋白质通过与ATG12结合形成ATG12-ATG5复合物，参与自噬体膜的延伸和成熟。这一过程对细胞应对营养缺乏、清除病原体和防止异常蛋白聚集等生理功能至关重要。ATG5的主要作用位点是正在形成的自噬体膜，它与其他ATG蛋白协同作用促进自噬体的形成。ATG5突变会导致自噬功能障碍，可能引发神经退行性疾病（如帕金森病）、癌症和免疫系统异常。研究发现ATG5表达降低会损害自噬功能，导致异常蛋白积累和细胞损伤；而过表达则可能增强细胞清除有害物质的能力，但也可能与某些癌症的发展相关。ATG5属于自噬相关基因家族，该家族成员均参与自噬过程的不同阶段，具有维持细胞内环境稳定的共同功能。这个家族的蛋白质通常通过形成复合物发挥作用，且在进化上高度保守。ATG5的异常表达不仅影响自噬过程，还可能通过调节凋亡和炎症反应影响其他细胞功能。例如，ATG5缺失可能导致线粒体功能异常和炎症因子释放增加。在免疫系统中，ATG5对淋巴细胞发育和功能至关重要，其缺陷可能导致自身免疫疾病。此外，ATG5还参与某些病毒感染的防御机制。由于自噬在多种疾病中的关键作用，ATG5已成为潜在的治疗靶点，针对其调控的研究可能为相关疾病提供新的治疗策略。

None

无

OMIM数据库中对ATG5基因的介绍     Wikipedia数据库中对ATG5基因的介绍

基因序列

基因序列

ATG5基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ATG5基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs14503       rs473543       rs478310       rs484621       rs490010       rs501804       rs506027       rs510432       rs511472       rs520296       rs524428       rs532906       rs538557       rs543465       rs546456       rs547738       rs552852      

基因表达

基因表达

ATG5基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAAACTCATGGAATATCCTGC
59
GGTCTTTCAGTCGTTGTCTG
58
CTGCTATTGATCCTGAAGATGG
58
GATGTTCACTCAGCCACTG
58
TGCTATTGATCCTGAAGATGG
57
GATGTTCACTCAGCCACTG
58
GAAACTCATGGAATATCCTGCAG
59
GGTCTTTCAGTCGTTGTCTG
58
GAAACTCATGGAATATCCTGCA
58
GGTCTTTCAGTCGTTGTCTG
58
GCTATTGATCCTGAAGATGGG
58
GATGTTCACTCAGCCACTG
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
ATF4
ATG5
Activation
20038797
DDIT3
ATG5
Activation
20038797
E2F1
ATG5
Activation
18408756

基因本体信息

ATG5基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ATG5基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006914
L7UQJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0034045
L7UQJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0000045
Q9H1Y0 (UniProtKB)
ISS
GO:0000045
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IBA
GO:0000422
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IBA
GO:0001974
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0002739
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q9H1Y0 (UniProtKB)
ISS
GO:0005776
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9H1Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9H1Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9H1Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9H1Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9H1Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005930
Q9H1Y0 (UniProtKB)
ISS
GO:0006501
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IBA
GO:0006914
Q9H1Y0 (UniProtKB)
ISS
GO:0006915
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0006995
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IBA
GO:0009620
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IDA
GO:0016236
Q9H1Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0016236
Q9H1Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0019725
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0019883
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0030670
Q9H1Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0031397
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0034045
Q9H1Y0 (UniProtKB)
ISS
GO:0034045
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IBA
GO:0034274
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IBA
GO:0035973
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IMP
GO:0039689
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0042311
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0042493
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0043066
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0043687
Q9H1Y0 (UniProtKB)
ISS
GO:0044233
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0044804
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IBA
GO:0045060
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0045087
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0048840
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0051279
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0055015
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0060047
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0060548
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IMP
GO:0061739
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0070257
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:1902017
Q9H1Y0 (UniProtKB)
ISS
GO:1903599
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:2000378
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:2000619
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0019776
Q9H1Y0 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ATG5基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lupus Erythematosus, Systemic 0.123724241 7 2 BeFree_GAD_GWASCAT
Rheumatoid Arthritis 0.120542884 3 1 BeFree_GWASCAT
Lethargy 0.12 1 0 CTD_human
Hepatomegaly 0.12 1 0 CTD_human
Drug-Induced Liver Injury 0.12 1 0 CTD_human
Weight decreased 0.12 1 0 CTD_human
Lymphopenia 0.12 1 0 CTD_human
Necrosis 0.12 1 0 CTD_human
Systemic Scleroderma 0.12 1 1 GWASCAT
Anemia 0.12 1 0 CTD_human

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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