ASB16 (ankyrin repeat and SOCS box containing 16)

symbol:
ASB16
locus group:
protein-coding gene
location:
17q21.31
gene_family:
Ankyrin repeat domain containing
alias symbol:
FLJ30165
alias name:
None
entrez id:
92591
ensembl gene id:
ENSG00000161664
ucsc gene id:
uc002ifl.1
refseq accession:
NM_080863
hgnc_id:
HGNC:19768
approved reserved:
2002-12-03
17q21.31
基因染色体位置图

ASB16(Ankyrin Repeat and SOCS Box Containing 16)属于ASB基因家族,该家族是一类含有锚蛋白重复序列(Ankyrin Repeat)和SOCS盒(Suppressor of Cytokine Signaling Box)的蛋白质编码基因。ASB基因家族的共性是通过锚蛋白重复序列介导蛋白质相互作用,而SOCS盒则参与泛素-蛋白酶体系统,调控靶蛋白的降解。ASB16主要在睾丸中高表达,可能参与精子发生过程,但其具体生物学功能尚未完全阐明。ASB16的表达产物可能通过调节细胞信号转导或蛋白质稳定性来影响生殖系统的发育和功能。目前关于ASB16突变的研究较少,但ASB家族其他成员的突变常与肿瘤、免疫失调或代谢疾病相关,推测ASB16的功能异常也可能影响生殖健康或细胞增殖。若ASB16过表达,可能干扰正常的蛋白质降解途径,导致信号通路异常激活或抑制,进而影响精子发生或睾丸功能;而降低表达则可能阻碍生殖细胞发育或激素响应。ASB16与其他ASB家族成员(如ASB1-ASB15)在结构上相似,但组织分布和功能可能存在差异。该基因与疾病的关联尚不明确,但ASB家族基因的异常表达曾报道与癌症、炎症等相关,未来研究或可揭示ASB16在男性不育或睾丸肿瘤中的潜在作用。

The protein encoded by this gene is a member of the ankyrin repeat and SOCS box-containing (ASB) family of proteins. They contain ankyrin repeat sequence and a SOCS box domain. The SOCS box serves to couple suppressor of cytokine signalling (SOCS) proteins and their binding partners with the elongin B and C complex, possibly targeting them for degradation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是锚蛋白重复和蛋白质SOCS含盒(ASB)家族的一个成员。它们含有锚蛋白重复序列??和SOCS盒域。该SoC盒用于细胞因子信号(SOCS)的蛋白质,并与elongin B和C复杂的绑定合作伙伴,可能针对他们的降解抑制夫妇。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ASB16基因的碱基序列:[NCBI]
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ASB16基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1135215       rs3826412       rs7212573       rs7212854       rs7214540       rs7217858       rs7218329       rs7220138       rs7224330       rs12937692       rs61758719       rs73316154       rs74491716       rs74766920       rs74900589       rs75035046       rs75035743      

ASB16基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAGATGAAGGTGGATGCAG
60
CTCCACAATCATGTTGGCG
60
GAGATGCTGAAACACTGCG
59
AGGATAGGCATTAAGCAGGA
58
CTCTGTACCTGGAGCATGG
60
CGCAGTGTTTCAGCATCTG
60
TTGTGTCCCATCCTGTGAG
59
TGTAGAAGGCTTCGTGCTC
60
GTGTCCCATCCTGTGAGAC
60
CTGTAGAAGGCTTCGTGCT
60
CTCTGTACCTGGAGCATGG
60
GCAGTGTTTCAGCATCTGG
60
GAGATGAAGGTGGATGCAG
58
TCTCCACAATCATGTTGGC
58
GAGATGCTGAAACACTGCG
59
GGATAGGCATTAAGCAGGAC
58
CTCTGTACCTGGAGCATGG
60
CAGTGTTTCAGCATCTGGG
59
GAGATGAAGGTGGATGCAG
58
CTCCACAATCATGTTGGCG
60
      尚未收录相关数据

ASB16基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ASB16基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q96NS5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005622
Q96NS5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016567
Q96NS5 (UniProtKB)
IEA
GO:0035556
Q96NS5 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ASB16基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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