ARPC5 (actin related protein 2/3 complex subunit 5)

symbol:
ARPC5
locus group:
protein-coding gene
location:
1q25.3
gene_family:
Actin related protein 2/3 complex subunits
alias symbol:
p16-Arc|ARC16|dJ127C7.3
alias name:
Arp2/3 protein complex subunit p16
entrez id:
10092
ensembl gene id:
ENSG00000162704
ucsc gene id:
uc057nwe.1
refseq accession:
NM_005717
hgnc_id:
HGNC:708
approved reserved:
1999-08-06
1q25.3
基因染色体位置图

ARPC5(Actin-Related Protein 2/3 Complex Subunit 5)是肌动蛋白相关蛋白2/3复合体(ARP2/3复合体)的一个关键亚基,属于ARP2/3基因家族。该家族由7个成员组成(ARPC1-ARPC5及ARP2、ARP3),共同形成稳定的复合物,在细胞中调控肌动蛋白的成核和分支网络的形成,从而影响细胞形态、迁移、内吞和胞质分裂等过程。ARPC5与其他亚基协同作用,稳定复合体结构并增强其激活效率,尤其在细胞运动或膜重塑(如伪足形成)时发挥核心作用。若ARPC5发生功能丧失性突变,会导致ARP2/3复合体组装异常,削弱肌动蛋白分支能力,进而引发细胞迁移障碍,与某些发育缺陷或免疫细胞功能异常相关。研究发现,ARPC5表达下调可能减少肿瘤细胞的侵袭性,因其抑制了依赖肌动蛋白重构的转移过程;而过表达则可能促进病理性的细胞迁移,如癌症转移或慢性炎症中的白细胞浸润。此外,ARPC5与Wiskott-Aldrich综合征(一种免疫缺陷疾病)的发病机制存在间接关联,因该疾病相关蛋白WASp是ARP2/3复合体的关键激活因子。在基因家族共性方面,所有ARP2/3成员均通过维持细胞骨架动态平衡参与多种生理活动,且其功能异常常导致运动相关疾病或发育异常。研究ARPC5可为靶向细胞骨架的疗法(如抗转移药物)提供新思路。

This gene encodes one of seven subunits of the human Arp2/3 protein complex. The Arp2/3 protein complex has been implicated in the control of actin polymerization in cells and has been conserved through evolution. The exact role of the protein encoded by this gene, the p16 subunit, has yet to be determined. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012]

该基因编码的7个亚基的人类的Arp2 / 3蛋白质复合物中的一个。所述的Arp2 / 3蛋白质复合物已经牵涉于肌动蛋白聚合在细胞中的控制,并已通过进化保守的。由该基因,所述p16蛋白亚基编码的蛋白质的确切作用,还有待确定。编码不同同种型的可变剪接转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的,2012年7月提供]

ARPC5基因的碱基序列:[NCBI]
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ARPC5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs11755       rs1174686       rs2231236       rs2231237       rs2231238       rs2231239       rs2231240       rs2231241       rs2254972       rs2761574       rs2767303       rs2767304       rs2767305       rs3754513       rs3856127       rs4652822       rs6424898      

ARPC5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCGTGGACGAAGAAGATGG
60
ATGTTTCCTGTGATGGAATGC
59
AAGAGTCAGGCAGTGAAGG
59
GTCCAGAGATTGAACTGCCT
60
CTCTGTCTGAAACACTTTCCT
58
TAAGGACCTGAAGGACGTG
59
TCGTGGACGAAGAAGATGG
60
AGCTGTCATGTTTCCTTGC
59
CAAACTCCTTACAATGCCTG
57
GTAAGTCAGAGGTTATGGGAG
57
TCGTGGACGAAGAAGATGG
60
GCTGTCATGTTTCCTTGCC
60
TCGTGGACGAAGAAGATGG
60
TGTTTCCTGTGATGGAATGC
59
AAGAGTCAGGCAGTGAAGG
59
GTCCAGAGATTGAACTGCC
58
AAATCCTCTCAGCTCTGCC
60
TGGAGGTGGTAAGAAACTAGAC
59
TCGTGGACGAAGAAGATGG
60
GTTTCCTGTGATGGAATGCC
60
      尚未收录相关数据

ARPC5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ARPC5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005885
B1ALC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0034314
B1ALC0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005200
O15511 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
O15511 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0005885
O15511 (UniProtKB)
IDA
GO:0005925
O15511 (UniProtKB)
IDA
GO:0006928
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0015629
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0016477
O15511 (UniProtKB)
IMP
GO:0030036
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0034314
O15511 (UniProtKB)
IDA
GO:0038096
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0042995
O15511 (UniProtKB)
IEA
GO:0048013
O15511 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
O15511 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O15511 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O15511 (UniProtKB)
IDA
GO:0051015
O15511 (UniProtKB)
IDA

可能调控 ARPC5基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Squamous cell carcinoma of the head and neck 0.000271442 1 0 BeFree
Rhabdomyosarcoma 0.000271442 1 0 BeFree
invasive cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Squamous cell carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree

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