ARF6 (ADP ribosylation factor 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ARF6
locus group:
protein-coding gene
location:
14q21.3
gene_family:
ADP-ribosylation factor (ARF) family GTPases
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None
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None
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382
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ENSG00000165527
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uc001wxg.5
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NM_001663
hgnc_id:
HGNC:659
approved reserved:
1994-02-01

基因染色体位置

基因染色体位置

14q21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ARF6（ADP-核糖基化因子6）属于ARF基因家族，该家族是一类小GTP酶蛋白，主要参与细胞内囊泡运输、细胞骨架重组和信号转导等过程。ARF6在细胞膜动力学中起关键作用，调控内吞、外排和质膜重组等过程，影响细胞迁移、粘附和胞质分裂。ARF6通过GTP/GDP循环切换激活状态，与效应蛋白如POR1、JIP3/4等相互作用，调节肌动蛋白重塑和膜运输。突变可能导致功能丧失或持续激活，影响细胞形态和运动，与癌症转移、神经发育障碍和免疫缺陷相关。ARF6过表达会增强细胞迁移和侵袭能力，促进肿瘤转移，同时扰乱内吞途径导致受体信号异常；而表达降低则损害胞吐作用，影响细胞分裂和突触可塑性。ARF家族成员（如ARF1-6）均具有GTP酶活性，通过调控膜运输和细胞骨架参与多种细胞活动，但ARF6独特地定位于质膜和内体，更直接参与细胞表面动态变化。在疾病方面，ARF6异常与乳腺癌、前列腺癌等恶性肿瘤侵袭性相关，还可能参与阿尔茨海默病等神经退行性疾病中的突触功能障碍。

This gene encodes a member of the human ARF gene family, which is part of the RAS superfamily. The ARF genes encode small guanine nucleotide-binding proteins that stimulate the ADP-ribosyltransferase activity of cholera toxin and play a role in vesicular trafficking and as activators of phospholipase D. The product of this gene is localized to the plasma membrane, and regulates vesicular trafficking, remodelling of membrane lipids, and signaling pathways that lead to actin remodeling. A pseudogene of this gene is located on chromosome 7. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的人类ARF基因家族，它是在RAS超家族的部分的构件。 ARF的基因编码刺激霍乱毒素的ADP-核糖基转移酶活性，并在囊泡运输和作为该基因的产物被定位于质膜的磷脂酶D的活化剂发挥作用小鸟嘌呤核苷酸结合蛋白，并调节囊泡运输，重塑膜脂的，和信令，导致肌动蛋白重塑通路。该基因的假基因位于[由RefSeq的，2008年7月提供] 7号染色体

OMIM数据库中对ARF6基因的介绍     Wikipedia数据库中对ARF6基因的介绍

基因序列

基因序列

ARF6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ARF6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs15382       rs1064615       rs3100898       rs3100908       rs3100909       rs3126180       rs3179189       rs8012313       rs11552918       rs61732572       rs61734985       rs61755563       rs61755575       rs61758874       rs72680046       rs73273802       rs73275404      

基因表达

基因表达

ARF6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCACCGCATTATCAATGAC
58
CTTGTTGGCGAAGATGAGG
59
CACTGTGGGTTTCAACGTG
60
ATCCCATACGTTGAACTTGAC
59
TGCACCGCATTATCAATGAC
59
TTGTTGGCGAAGATGAGGA
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
SP1
ARF6
Activation
19642173

基因本体信息

ARF6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ARF6基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001726
P62330 (UniProtKB)
IDA
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P62330 (UniProtKB)
IEA
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TAS
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IPI
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IPI
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IPI
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P62330 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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TAS
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P62330 (UniProtKB)
TAS
GO:0005768
P62330 (UniProtKB)
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IEA
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IDA
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IDA
GO:0005886
P62330 (UniProtKB)
IDA
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P62330 (UniProtKB)
IDA
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P62330 (UniProtKB)
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P62330 (UniProtKB)
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P62330 (UniProtKB)
IEA
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P62330 (UniProtKB)
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P62330 (UniProtKB)
TAS
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P62330 (UniProtKB)
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P62330 (UniProtKB)
IEA
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P62330 (UniProtKB)
IMP
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P62330 (UniProtKB)
IMP
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P62330 (UniProtKB)
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P62330 (UniProtKB)
IDA
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P62330 (UniProtKB)
IPI
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P62330 (UniProtKB)
IEA
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P62330 (UniProtKB)
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GO:0034394
P62330 (UniProtKB)
ISS
GO:0035020
P62330 (UniProtKB)
IDA
GO:0036010
P62330 (UniProtKB)
IMP
GO:0043209
P62330 (UniProtKB)
IEA
GO:0047485
P62330 (UniProtKB)
IEA
GO:0048261
P62330 (UniProtKB)
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GO:0051301
P62330 (UniProtKB)
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P62330 (UniProtKB)
IDA
GO:0060998
P62330 (UniProtKB)
ISS
GO:0070062
P62330 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P62330 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P62330 (UniProtKB)
IDA
GO:0090004
P62330 (UniProtKB)
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GO:0090162
P62330 (UniProtKB)
IEA
GO:0097284
P62330 (UniProtKB)
IEA
GO:2000171
P62330 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ARF6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.0054487 2 0 LHGDN
Glioma 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
melanoma 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Neoplasm Metastasis 0.001900093 7 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001357209 5 0 BeFree
Invasive breast carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
HIV Infections 0.000814326 3 0 BeFree
Epilepsy, Myoclonic, Infantile 0.000271442 1 0 BeFree
Ischemia 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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