APOD (apolipoprotein D)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
APOD
locus group:
protein-coding gene
location:
3q29
gene_family:
Apolipoproteins|Lipocalins
alias symbol:
Apo-D
alias name:
None
entrez id:
347
ensembl gene id:
ENSG00000189058
ucsc gene id:
uc003fur.2
refseq accession:
NM_001647
hgnc_id:
HGNC:612
approved reserved:
2001-06-22

基因染色体位置

基因染色体位置

3q29
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

APOD（载脂蛋白D）是一种主要由肝脏和大脑产生的载脂蛋白，属于脂质运载蛋白家族（lipocalin family）。该家族成员通常具有结合和运输疏水分子（如胆固醇、类固醇、胆汁酸等）的能力，并参与多种生理过程。APOD的主要生物学功能包括调节脂质代谢、抗氧化、神经保护和炎症调节。它通过与低密度脂蛋白（LDL）和高密度脂蛋白（HDL）结合，参与胆固醇的运输和分布，尤其在神经系统和周围组织中发挥重要作用。APOD在脑脊液和神经组织中含量较高，被认为对阿尔茨海默病（AD）和帕金森病（PD）等神经退行性疾病具有保护作用，可能通过减少氧化应激和抑制β-淀粉样蛋白聚集来实现。此外，APOD在乳腺癌、前列腺癌和卵巢癌等肿瘤组织中表达异常，可能与肿瘤的发生和发展相关。APOD的突变可能导致其功能异常，影响脂质代谢和神经保护作用，进而增加神经退行性疾病或代谢紊乱的风险。例如，某些APOD基因多态性与阿尔茨海默病的易感性相关。APOD过表达可能增强其抗氧化和神经保护作用，但也可能与某些癌症的进展相关；而降低表达则可能导致脂质代谢紊乱和神经退行性疾病的易感性增加。APOD与其他基因（如APOE）相互作用，共同调节脂质代谢和神经功能。APOD属于脂质运载蛋白家族，该家族成员通常具有保守的β-桶状结构，能够结合和运输小分子，并参与细胞信号传导、免疫调节和代谢调控等过程。

This gene encodes a component of high density lipoprotein that has no marked similarity to other apolipoprotein sequences. It has a high degree of homology to plasma retinol-binding protein and other members of the alpha 2 microglobulin protein superfamily of carrier proteins, also known as lipocalins. This glycoprotein is closely associated with the enzyme lecithin:cholesterol acyltransferase - an enzyme involved in lipoprotein metabolism. [provided by RefSeq, Aug 2008]

这个基因编码具有没有显着相似性的其他载脂蛋白序列高密度脂蛋白的组分。它具有血浆视黄醇结合蛋白和载体蛋白，也称为脂笼蛋白的α2微球蛋白的蛋白质超家族的其他成员具有高度的同源性。这种糖蛋白是紧密地与酶卵磷脂关联：胆固醇酰基转移酶 - 参与脂蛋白代谢的酶。 [由RefSeq的，2008年8月提供]

OMIM数据库中对APOD基因的介绍     Wikipedia数据库中对APOD基因的介绍

基因序列

基因序列

APOD基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

APOD基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs5952       rs5953       rs5954       rs5955       rs7659       rs8306       rs1464504       rs1464505       rs1467282       rs1568563       rs1568564       rs1568565       rs1568566       rs1965470       rs1976843       rs2056469       rs2140087      

基因表达

基因表达

APOD基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCCTGGTTTATGCCATCG
58
GCAGGTACAGGAATACACG
58
TTCCTGGTTTATGCCATCG
58
GCAGGTACAGGAATACACG
58
TCACCATCTTGGCTCACTG
60
TCCGAGATACTGTAGTCCCA
59
GTGAATAAGTATCTCGGAAGATGG
59
ATTAGTGAGTAGTTGGCCTGG
60
GTGATTACAGCTCCAGGTC
58
TGAAATGCTTGTCCCTCTG
58
GGAGTTGAGAGCTGATGGA
58
CTTAACTTCCAGCTTGGCAG
59
TTTCCTGGTTTATGCCATCG
59
AGGTACAGGAATACACGAGG
59
TGATTACAGCTCCAGGTCC
59
GAAATGCTTGTCCCTCTGC
59
TGGGACTACAGTATCTCGGA
59
TAGTGAGTAGTTGGCCTGG
58
AGGAGTTGAGAGCTGATGG
58
TTAACTTCCAGCTTGGCAG
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
NOTCH3
APOD
Repression
21705670

基因本体信息

APOD基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

APOD基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005215
C9JF17 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
C9JF17 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9JF17 (UniProtKB)
IEA
GO:0008289
C9JF17 (UniProtKB)
IEA
GO:0036094
C9JF17 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
C9JX71 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
C9JX71 (UniProtKB)
IEA
GO:0008289
C9JX71 (UniProtKB)
IEA
GO:0000302
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0001525
P05090 (UniProtKB)
NAS
GO:0005319
P05090 (UniProtKB)
NAS
GO:0005515
P05090 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P05090 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
P05090 (UniProtKB)
NAS
GO:0005615
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0005783
P05090 (UniProtKB)
ISS
GO:0006006
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0006629
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0006869
P05090 (UniProtKB)
IEA
GO:0007420
P05090 (UniProtKB)
ISS
GO:0007568
P05090 (UniProtKB)
NAS
GO:0010642
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0014012
P05090 (UniProtKB)
ISS
GO:0015485
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0022626
P05090 (UniProtKB)
ISS
GO:0030425
P05090 (UniProtKB)
ISS
GO:0042246
P05090 (UniProtKB)
ISS
GO:0042308
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0042493
P05090 (UniProtKB)
ISS
GO:0043025
P05090 (UniProtKB)
ISS
GO:0048471
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0048662
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0048678
P05090 (UniProtKB)
ISS
GO:0051895
P05090 (UniProtKB)
IMP
GO:0060588
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:0071638
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:1900016
P05090 (UniProtKB)
IDA
GO:2000098
P05090 (UniProtKB)
IMP
GO:2000405
P05090 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 APOD基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Glioma 0.120271442 1 0 BeFree_CTD_human
Hypokinesia 0.12 1 0 CTD_human
Neurodegenerative Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Learning Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Cerebrovascular accident 0.080271442 2 0 BeFree_RGD
Status Epilepticus 0.08 1 0 RGD
Impotence, Vasculogenic 0.08 1 0 RGD
Alzheimer's Disease 0.020908413 5 0 BeFree_GAD_LHGDN
Schizophrenia 0.00617715 5 0 BeFree_GAD_LHGDN
Inflammation 0.005091382 2 0 GAD_LHGDN

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

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