APOC4-APOC2 (APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate))

symbol:
APOC4-APOC2
locus group:
other
location:
19q13.32
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100533990
ensembl gene id:
ENSG00000224916
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_037932
hgnc_id:
HGNC:44426
approved reserved:
2013-05-14
19q13.32
基因染色体位置图

APOC4-APOC2是一个复合基因位点,位于人类第19号染色体上,属于载脂蛋白基因家族(Apolipoprotein gene family)。这个基因家族主要编码参与脂质代谢的载脂蛋白,其成员通常具有结合和运输脂质的功能,并在胆固醇和甘油三酯代谢中起关键作用。APOC4-APOC2基因位点包含两个相邻的基因:APOC4和APOC2,它们编码的蛋白质分别是载脂蛋白C-IV(ApoC-IV)和载脂蛋白C-II(ApoC-II)。ApoC-II是一种重要的脂蛋白脂肪酶(LPL)激活剂,LPL是分解乳糜微粒和极低密度脂蛋白(VLDL)中甘油三酯的关键酶。ApoC-II通过与LPL结合并激活其活性,促进甘油三酯的水解,从而调节血浆脂质水平。ApoC-IV的功能尚未完全明确,但研究表明它可能参与脂质代谢的调节,并与高密度脂蛋白(HDL)的代谢有关。APOC2基因的突变可能导致ApoC-II功能缺陷,进而引发家族性乳糜微粒血症综合征(FCS),这是一种罕见的遗传性疾病,表现为严重的高甘油三酯血症和胰腺炎风险增加。APOC4的突变或表达异常可能与血脂异常和心血管疾病风险相关。如果APOC2表达降低,会导致LPL活性不足,甘油三酯分解受阻,血浆中乳糜微粒和VLDL积累,引发高甘油三酯血症。相反,APOC2过表达可能增强LPL活性,加速甘油三酯清除,但也可能因过度代谢导致其他脂蛋白异常。APOC4的表达变化对机体的影响尚需更多研究,但可能通过影响HDL代谢或与其他载脂蛋白相互作用来调节血脂平衡。载脂蛋白基因家族的共性包括编码的蛋白质多具有脂质结合能力,参与脂蛋白的组装、运输和代谢,并在心血管健康和代谢性疾病中发挥重要作用。APOC4-APOC2位点的研究有助于理解脂质代谢紊乱和相关疾病的机制,为治疗高脂血症和心血管疾病提供潜在靶点。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring apolipoprotein C-IV (APOC4) and apolipoprotein C-II (APOC2) genes on chromosome 19. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is thus unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Mar 2011]

这一位点代表自然发生的读通过相邻的载脂蛋白C-IV(APOC4)和载脂蛋白C-II(APOC2)19号染色体基因通读成绩单是无义介导的mRNA降解的候选人之间的转录(NMD),并且因此不太可能产生的蛋白质产物。 [由RefSeq的,2011年3月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
APOC4-APOC2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs5120       rs5121       rs5122       rs5123       rs5125       rs5126       rs5127       rs5159       rs5160       rs5161       rs5162       rs5163       rs5164       rs5165       rs5166       rs5167       rs5168      

APOC4-APOC2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTGGGATTTGAGGTCCAGG
59
ATTCCTTCACCTGGGTGAG
59
AAACTCAGGGACTTGTACAG
57
AGCACAGAAAGAACTTGGT
57
TTGGGATTTGAGGTCCAGG
59
ATTCCTTCACCTGGGTGAG
59
      尚未收录相关数据

APOC4-APOC2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

APOC4-APOC2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006629
K7ER74 (UniProtKB)
IEA
GO:0006869
K7ER74 (UniProtKB)
IEA
GO:0008047
K7ER74 (UniProtKB)
IEA
GO:0042627
K7ER74 (UniProtKB)
IEA
GO:0043085
K7ER74 (UniProtKB)
IEA

可能调控 APOC4-APOC2基因的相关microRNA:     

BioGrid

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。