ANKRD30A (ankyrin repeat domain 30A)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ANKRD30A
locus group:
protein-coding gene
location:
10p11.21
gene_family:
Ankyrin repeat domain containing
alias symbol:
NY-BR-1
alias name:
breast cancer antigen NY-BR-1
entrez id:
91074
ensembl gene id:
ENSG00000148513
ucsc gene id:
uc057sua.1
refseq accession:
NM_052997
hgnc_id:
HGNC:17234
approved reserved:
2004-05-12

基因染色体位置

基因染色体位置

10p11.21
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ANKRD30A基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1148257       rs1148258       rs1148259       rs1148260       rs1148261       rs1148262       rs1200857       rs1200875       rs1200876       rs1200877       rs1200878       rs1200879       rs1200880       rs1200881       rs1200882       rs1200883       rs1200884      

基因表达

基因表达

ANKRD30A基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATACTGAGAGTCTCTGTGAGAC
59
GACCATCTTTAACAGGAGACC
58
GTTACAATCAGAGCCTCCC
58
CCAAGGCTTTATTTGGAACAG
58
ATTCTGAGAGTCTCTGTGAGAC
59
GACCATCTTTAACAGGAGACC
58
TCTTCTGAAGGCTACCTGC
59
GCTTTGAAAGTTTGCATGTCC
59
CTTTCAAAGCAGAGCCTCC
59
CAAGGCTTTATTTGGAACAGAC
58
CTGTTCCAAATAAAGCCTTGG
58
CACAGAGACTCTCAGAATCC
57
CTGTTCCAAATAAAGCCTTGG
58
ACAGAGACTCTCAGAATCCC
58
GATTCTGAGAGTCTCTGTGAG
57
ACCATCTTTAACAGGAGACC
57
ATGAGATACTCCCATCAGAATCC
59
AAACAGTCTCACAGAGACTCTC
60
GTTACAATCAGAGCCTCCC
58
CAAGGCTTTATTTGGAACAGAC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ANKRD30A基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ANKRD30A基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
Q9BXX3 (UniProtKB)
NAS
GO:0003700
Q9BXX3 (UniProtKB)
NAS
GO:0005634
Q9BXX3 (UniProtKB)
NAS
GO:0006355
Q9BXX3 (UniProtKB)
NAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ANKRD30A基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.003538676 3 0 BeFree_LHGDN
Prostatic Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Ductal Carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of breast 0.001628651 6 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Invasive breast carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Autoimmune Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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