ALYREF (Aly/REF export factor)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ALYREF
locus group:
protein-coding gene
location:
17q25.3
gene_family:
RNA binding motif containing|THO complex
alias symbol:
ALY|BEF|ALY/REF|REF
alias name:
THO complex subunit 4
entrez id:
10189
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uc002kbu.3
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NM_005782
hgnc_id:
HGNC:19071
approved reserved:
2002-12-09

基因染色体位置

基因染色体位置

17q25.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ALYREF（也称为THOC4或ALY）是一个重要的基因，属于THO复合体（THO complex）基因家族，该家族在mRNA加工和核质转运中发挥关键作用。ALYREF编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白，主要参与mRNA的剪接、加工和从细胞核到细胞质的转运过程。它在转录后调控中扮演核心角色，通过与转录机器和mRNA输出因子相互作用，确保mRNA的正确成熟和运输。ALYREF的主要作用位点是细胞核，特别是在转录活跃的区域，它与TREX复合体（转录-输出复合体）结合，促进mRNA的核输出。ALYREF的突变可能导致mRNA加工和转运的缺陷，进而影响基因表达调控，甚至与某些疾病相关。例如，ALYREF的异常表达或突变与癌症（如白血病和乳腺癌）的发生发展有关，因为它可能影响癌基因或抑癌基因的mRNA稳定性及翻译效率。此外，ALYREF在病毒感染过程中也发挥作用，某些病毒会劫持ALYREF的功能以促进自身mRNA的核输出和翻译。当ALYREF过表达时，可能导致mRNA转运的异常增加，进而影响细胞增殖和分化，甚至促进肿瘤发生。相反，ALYREF表达降低可能导致mRNA转运受阻，影响正常基因表达，导致细胞功能异常或凋亡。THO基因家族的共性在于它们都参与mRNA的代谢和转运，形成多蛋白复合体以协调转录、剪接和输出过程。ALYREF作为该家族成员之一，与其他成员（如THOC1、THOC2等）协同作用，确保mRNA的准确加工和高效转运。总之，ALYREF是一个关键的RNA代谢调控因子，其功能异常与多种疾病密切相关，尤其在癌症和病毒感染中具有重要研究价值。

The protein encoded by this gene is a heat stable, nuclear protein and functions as a molecular chaperone. It is thought to regulate dimerization, DNA binding, and transcriptional activity of basic region-leucine zipper (bZIP) proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是一个热稳定的，核蛋白质和功能作为分子伴侣。它被认为是调节二聚化，DNA结合，及碱性区亮氨酸拉链（bZIP蛋白）蛋白的转录活性。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对ALYREF基因的介绍     Wikipedia数据库中对ALYREF基因的介绍

基因序列

基因序列

ALYREF基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ALYREF基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs8067831       rs11550403       rs75583866       rs111848880       rs112154648       rs112480169       rs113130670       rs113727280       rs114233604       rs115610695       rs137935308       rs138108291       rs138513877       rs138529209       rs138567865       rs139402425       rs139424088      

基因表达

基因表达

ALYREF基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TAGTACACCTCTGAGTGCG
59
CTGTTTACGCTCTGTGCAG
59
CTTAGGAACAGCAGACGTG
58
GATGTAGCTTGCATCCAGAG
59
AACAACTTCCCGACAAGTG
58
CTAGAAACCACCTGAATATCGG
59
GTCGTAAAGACAAAGGCCG
59
TTCTAGTCATGCCACCTCTG
59
CGATATTCAGGAACTCTTTGCTG
60
CGTCTGCTGTTCCTAAGCT
60
CATGACTAGAAACCGTGGC
59
TTTAACTGGTGTCCATTCTCG
58
GGGCTGTAGTCGTAAAGAC
58
CACCTCTGTTTACGCTCTG
58
GTCGTAAAGACAAAGGCCG
59
TCTAGTCATGCCACCTCTG
59
CATGACTAGAAACCGTGGC
59
TTAACTGGTGTCCATTCTCG
58
AGCTTAGGAACAGCAGACG
60
TGTAGCTTGCATCCAGAGG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ALYREF基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ALYREF基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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IC
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Q86V81 (UniProtKB)
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Q86V81 (UniProtKB)
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Q86V81 (UniProtKB)
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Q86V81 (UniProtKB)
IMP
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GO:0044822
Q86V81 (UniProtKB)
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GO:0044822
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Q86V81 (UniProtKB)
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GO:0000784
Q86V81 (UniProtKB)
IDA
GO:0035145
Q86V81 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ALYREF基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
HIV Infections 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Heart failure 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree
Dyspnea 0.000271442 1 0 BeFree
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.000271442 1 0 BeFree
Congestive heart failure 0.000271442 1 0 BeFree
Severe Combined Immunodeficiency 0.000271442 1 0 BeFree
Squamous cell carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Influenza 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

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