ALCAM (activated leukocyte cell adhesion molecule)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ALCAM
locus group:
protein-coding gene
location:
3q13.11
gene_family:
CD molecules|V-set domain containing|C2-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
CD166|MEMD
alias name:
None
entrez id:
214
ensembl gene id:
ENSG00000170017
ucsc gene id:
uc003dvx.4
refseq accession:
NM_001627
hgnc_id:
HGNC:400
approved reserved:
1997-01-17

基因染色体位置

基因染色体位置

3q13.11
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ALCAM（激活白细胞黏附分子，Activated Leukocyte Cell Adhesion Molecule），也称为CD166，是一种属于免疫球蛋白超家族（IgSF）的细胞表面黏附分子。它广泛表达于多种细胞类型，包括免疫细胞、神经细胞、上皮细胞和内皮细胞，主要介导细胞间的同型或异型黏附作用，参与细胞迁移、组织发育、免疫应答和炎症反应等生物学过程。ALCAM通过与其配体CD6（另一种免疫球蛋白超家族成员）结合，在T细胞激活和免疫突触形成中发挥关键作用。此外，ALCAM还参与神经系统的发育，如轴突导向和髓鞘形成。ALCAM的突变或异常表达与多种疾病相关。例如，ALCAM表达下调与肿瘤进展和转移密切相关，尤其在乳腺癌、结肠癌和黑色素瘤中，其低表达可能导致细胞黏附能力下降，促进肿瘤侵袭。相反，ALCAM过表达在某些炎症性疾病（如类风湿性关节炎）中可能加剧白细胞浸润和组织损伤。在神经退行性疾病中，ALCAM的异常表达可能影响神经元存活和突触可塑性。ALCAM属于免疫球蛋白超家族，该家族成员均含有免疫球蛋白样结构域，主要参与细胞识别、黏附和信号传导。家族共性包括介导细胞间相互作用、调节免疫应答及参与发育过程。ALCAM的功能受其表达水平和细胞微环境影响，其调控机制涉及转录因子、表观遗传修饰及剪切变异。研究ALCAM有助于理解其在疾病中的作用，并为靶向治疗提供潜在分子标记。

This gene encodes activated leukocyte cell adhesion molecule (ALCAM), also known as CD166 (cluster of differentiation 166), which is a member of a subfamily of immunoglobulin receptors with five immunoglobulin-like domains (VVC2C2C2) in the extracellular domain. This protein binds to T-cell differentiation antigene CD6, and is implicated in the processes of cell adhesion and migration. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found. [provided by RefSeq, Aug 2011]

这个基因编码活化白细胞粘附分子（ALCAM），也称为CD166（分化166的簇），它是免疫球蛋白受体的亚家族在细胞外结构域5的免疫球蛋白样结构域（VVC2C2C2）一个构件。该蛋白质结合的T细胞分化反基因CD6，和在细胞粘附和迁移的处理被牵连。已发现编码不同亚型多重选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的，2011年8月提供]

OMIM数据库中对ALCAM基因的介绍     Wikipedia数据库中对ALCAM基因的介绍

基因序列

基因序列

ALCAM基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ALCAM基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1157       rs1524       rs9370       rs14550       rs474355       rs478259       rs481177       rs485593       rs485922       rs490029       rs495691       rs499342       rs503321       rs517415       rs519016       rs526297       rs526375      

基因表达

基因表达

ALCAM基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCCATCATCTCAGGTTCCAC
59
CAGGTTTAGATGGTTGCTCTC
59
GGAGGAATATGGAATCCAAGG
58
TATACCATCCAAGGCCTGG
59
CAGCTATCACAGTTCACTATTTGG
60
GATATTGTGCATGACACGGG
60
CAGCTATCACAGTTCACTATTTGG
60
GATATTGTGCATGACACGGG
60
GCTATCACAGTTCACTAGTTAGC
59
TCTCCACTTGGGTTTAAGGA
58
TGGATGAAAGATAACATCAGGC
59
GCAGACATAGTTTCCAGCA
58
CAGCTATCACAGTTCACTATTTGG
60
GATATTGTGCATGACACGGG
60
AGACAGTTATCCAGATGGCA
58
AAATTATGACCACCGCTCC
57
CTCTGCTATAAGTATTCCAGAACAC
59
AGACCAACAACGATTCCCA
59
TGGATGAAAGATAACATCAGGC
59
GCAGACATAGTTTCCAGCA
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ALCAM基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ALCAM基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
F5GXJ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7C543 (UniProtKB)
IEA
GO:0001772
Q13740 (UniProtKB)
IDA
GO:0002250
Q13740 (UniProtKB)
IEA
GO:0005102
Q13740 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q13740 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13740 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q13740 (UniProtKB)
IPI
GO:0005887
Q13740 (UniProtKB)
ISS
GO:0005925
Q13740 (UniProtKB)
IDA
GO:0007155
Q13740 (UniProtKB)
ISS
GO:0007157
Q13740 (UniProtKB)
IMP
GO:0007165
Q13740 (UniProtKB)
TAS
GO:0008045
Q13740 (UniProtKB)
IEA
GO:0009897
Q13740 (UniProtKB)
IEA
GO:0030424
Q13740 (UniProtKB)
ISS
GO:0030425
Q13740 (UniProtKB)
IEA
GO:0031226
Q13740 (UniProtKB)
IDA
GO:0031290
Q13740 (UniProtKB)
ISS
GO:0043025
Q13740 (UniProtKB)
IEA
GO:0048846
Q13740 (UniProtKB)
ISS
GO:0070062
Q13740 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q13740 (UniProtKB)
IDA
GO:1990138
Q13740 (UniProtKB)
ISS
GO:0042101
Q13740 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ALCAM基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Animal Mammary Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Mammary Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Mammary Neoplasms 0.008173051 3 0 LHGDN
melanoma 0.007077352 7 0 BeFree_LHGDN
Neoplasm Metastasis 0.005710211 11 0 BeFree_LHGDN
Squamous cell carcinoma 0.0054487 2 0 LHGDN
ovarian neoplasm 0.0054487 2 0 LHGDN
Prostatic Neoplasms 0.0054487 2 0 LHGDN
Breast Carcinoma 0.003257302 12 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.003257302 12 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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