AIRN (antisense of IGF2R non-protein coding RNA)

symbol:
AIRN
locus group:
non-coding RNA
location:
6q25.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
AIR|NCRNA00088|IGF2RAS|IGF2R-AS1
alias name:
non-protein coding RNA 88|IGF2R an…
entrez id:
100271873
ensembl gene id:
ENSG00000268257
ucsc gene id:
uc031sqx.1
refseq accession:
NR_047511
hgnc_id:
HGNC:34515
approved reserved:
2008-11-25
6q25.3
基因染色体位置图

AIRN(Antisense of IGF2R Noncoding RNA)是一种长链非编码RNA(lncRNA),位于人类第6号染色体上,与IGF2R(胰岛素样生长因子2受体)基因的反义链重叠。AIRN的主要功能是通过表观遗传调控影响IGF2R的表达,它通过招募组蛋白甲基转移酶G9a等修饰蛋白到IGF2R启动子区域,促进H3K9me2修饰的形成,从而抑制IGF2R的转录。IGF2R在细胞生长、分化及肿瘤抑制中起重要作用,因此AIRN通过调控IGF2R间接影响这些生物学过程。AIRN的异常表达与多种疾病相关,例如其过表达可能导致IGF2R表达下降,进而促进细胞增殖和肿瘤发生,特别是在某些癌症如肝细胞癌中观察到AIRN上调。相反,降低AIRN表达可能恢复IGF2R的正常水平,抑制肿瘤生长。此外,AIRN属于长链非编码RNA家族,这一家族的成员通常不编码蛋白质,但通过调控基因表达、染色质重塑或作为分子支架参与多种细胞过程。AIRN的突变或表达异常可能破坏其对IGF2R的调控,导致生长信号通路失调。研究还发现,AIRN在印记调控中起作用,其表达受父源等位基因的甲基化调控。由于AIRN与IGF2R的密切关系,其功能研究对理解癌症、发育障碍及印记相关疾病具有重要意义。未来研究可能探索靶向AIRN的治疗策略,以调节IGF2R相关通路。

Both spliced and un-spliced long non-coding RNAs are transcribed from this gene. This gene overlaps on the opposite strand the second intron of the insulin-like growth factor 2 receptor gene; a CpG island associated with the second intron denotes an active promoter that drives the expression of this gene. The related mouse gene is responsible for silencing the insulin-like growth factor 2 receptor gene and flanking genes in the imprinted gene cluster of mice. This gene may be expressed in Wilms tumors. [provided by RefSeq, Feb 2013]

拼接都和未拼接长非编码RNA是由该基因转录。此基因在相反链重叠胰岛素样生长因子2受体基因的第二内含子;与第二内含子相关联的CpG岛表示活性启动子驱动该基因的表达。相关小鼠基因负责沉默胰岛素样生长因子2受体基因和侧翼小鼠的印迹基因簇中的基因。这个基因可以在肾母细胞瘤中表达。 [由RefSeq的,2013年2月提供]

AIRN基因的碱基序列:[NCBI]
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AIRN基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs677882       rs1003737       rs3734181       rs3798191       rs3798192       rs3798193       rs3822843       rs4596512       rs4709388       rs6455679       rs6933622       rs6940097       rs8191713       rs8191714       rs8191715       rs8191716       rs8191717      

AIRN基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATGACCTAGTTACTCCACTCAG
59
ATGTTCCATATGTGCATGGT
58
CCAATCAGATAGAGCCCTG
57
AGTCTGGCAATACCATAAGG
57
CTATGACCTAGTTACTCCACTC
57
TGTTCCATATGTGCATGGT
57
AATCAGATAGAGCCCTGGT
57
ATAGTCTGGCAATACCATAAGG
58
TATGGATTAACACATGGCTCAC
59
GATTGGATCAGCTATCATCCC
58
GATCCAATCAGATAGAGCCCT
59
CTGGCAATACCATAAGGTAATGAG
60
      尚未收录相关数据

AIRN基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AIRN基因的本体(GO)信息:

可能调控 AIRN基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes 0.000814326 3 1 BeFree
Diabetes Mellitus 0.000814326 3 1 BeFree
Hyperinsulinism 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma of pancreas 0.000271442 1 0 BeFree

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