AGPAT4 (1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
AGPAT4
locus group:
protein-coding gene
location:
6q26
gene_family:
1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferases
alias symbol:
LPAAT-delta|dJ473J16.2|LPAAT4|LPLAT4
alias name:
lysophosphatidic acid acyltransfer…
entrez id:
56895
ensembl gene id:
ENSG00000026652
ucsc gene id:
uc003qtr.2
refseq accession:
NM_020133
hgnc_id:
HGNC:20885
approved reserved:
2003-11-25

基因染色体位置

基因染色体位置

6q26
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

AGPAT4（1-酰基甘油-3-磷酸-O-酰基转移酶4）是一种参与甘油磷脂代谢的关键酶，属于AGPAT基因家族（也称为LPAAT家族）。该家族共有11个成员，其共同特点是催化溶血磷脂酸（LPA）转化为磷脂酸（PA），这是甘油磷脂和甘油三酯生物合成中的重要步骤。AGPAT4主要在肝脏、脂肪组织和大脑中表达，其产物PA是细胞膜结构的重要成分，也参与信号传导和脂滴形成。AGPAT4的突变可能导致脂代谢紊乱，与肥胖、胰岛素抵抗和非酒精性脂肪肝等代谢性疾病相关。过表达AGPAT4会促进PA的合成，可能增强脂质储存并影响胰岛素敏感性，而降低表达则可能导致PA水平下降，影响膜完整性和脂质信号传导。AGPAT4还与某些癌症进展有关，因为PA是mTOR信号通路的重要激活剂，该通路调控细胞生长和增殖。此外，AGPAT家族成员在组织分布和底物偏好上存在差异，但都共享保守的催化结构域和相似的酶活性。AGPAT4的功能研究为理解脂代谢疾病和开发相关治疗策略提供了重要线索。

This gene encodes a member of the 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase family. This integral membrane protein converts lysophosphatidic acid to phosphatidic acid, the second step in de novo phospholipid biosynthesis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶家族的一个成员。这个完整的膜蛋白溶血磷脂酸转化为磷脂酸，在从头磷脂生物合成中的第二个步骤。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对AGPAT4基因的介绍     Wikipedia数据库中对AGPAT4基因的介绍

基因序列

基因序列

AGPAT4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

AGPAT4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1404270       rs2281492       rs4709497       rs6934457       rs9458144       rs12199314       rs41268555       rs60587380       rs61552758       rs71565792       rs73786014       rs75401401       rs75667153       rs76785366       rs78378982       rs78904418       rs79443022      

基因表达

基因表达

AGPAT4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATTGCATCTCAAGCCAGCT
60
CCTTCCCATACTTGAGGTAGG
59
GTATGTTAGGAGGATCCCACTG
60
TTCTCCTGGTAGAGCTTGTG
59
ATCCCACTGGAAGACATCC
59
GAAAGGCATCCTTCTCCTG
58
TATTGCATCTCAAGCCAGCT
59
CCTTCCCATACTTGAGGTAGG
59
CATCGTGGTTCTCAACCAC
59
CAAGAGGTCAAACCCTAACAG
59
ATCCCACTGGAAGACATCC
59
GAAAGGCATCCTTCTCCTG
58
GTATGTTAGGAGGATCCCACTG
59
TTCTCCTGGTAGAGCTTGTG
59
CATCGTGGTTCTCAACCAC
59
AGAGGTCAAACCCTAACAGC
60
ATCCCACTGGAAGACATCC
59
AAAGGCATCCTTCTCCTGG
59
ATCCCACTGGAAGACATCC
59
AAAGGCATCCTTCTCCTGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

AGPAT4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGPAT4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
G3XAF1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016746
G3XAF1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5TEE8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016746
Q5TEE8 (UniProtKB)
IEA
GO:0003841
Q9NRZ5 (UniProtKB)
NAS
GO:0003841
Q9NRZ5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q9NRZ5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005789
Q9NRZ5 (UniProtKB)
TAS
GO:0006654
Q9NRZ5 (UniProtKB)
TAS
GO:0008654
Q9NRZ5 (UniProtKB)
NAS
GO:0016021
Q9NRZ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016024
Q9NRZ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0019432
Q9NRZ5 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 AGPAT4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hematocrit level 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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