AGER (advanced glycosylation end-product specific receptor)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
AGER
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.32
gene_family:
C2-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
RAGE|SCARJ1|sRAGE
alias name:
receptor for advanced glycation en…
entrez id:
177
ensembl gene id:
ENSG00000204305
ucsc gene id:
uc003oal.3
refseq accession:
NM_001136
hgnc_id:
HGNC:320
approved reserved:
1994-10-17

基因染色体位置

基因染色体位置

6p21.32
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

AGER（Advanced Glycation End-product Receptor），也称为RAGE（Receptor for Advanced Glycation End-products），是一种细胞表面受体，属于免疫球蛋白超家族成员。它主要通过与晚期糖基化终末产物（AGEs）结合而激活，参与多种炎症反应和氧化应激过程。AGER在多种组织中表达，包括血管内皮细胞、巨噬细胞、神经元和肺泡上皮细胞等，尤其在糖尿病、阿尔茨海默病、动脉粥样硬化和慢性炎症性疾病中发挥重要作用。AGER的生物学功能包括促进炎症信号通路的激活（如NF-κB通路）、增强氧化应激反应以及参与细胞迁移和增殖。其表达产物是一种跨膜蛋白，能够识别并结合多种配体，如AGEs、高迁移率族蛋白1（HMGB1）和S100蛋白等。突变或异常表达的AGER可能导致其功能失调，例如持续激活会加剧慢性炎症和纤维化，与糖尿病并发症、神经退行性疾病和肿瘤进展密切相关。AGER过表达通常与疾病恶化相关，如加速动脉粥样硬化斑块形成或促进肿瘤转移；而降低其表达可能减轻炎症反应和组织损伤，但也可能影响某些生理功能，如伤口愈合。AGER属于RAGE基因家族，该家族成员具有类似的免疫球蛋白样结构域，主要参与先天免疫和炎症调控。家族共性包括多配体结合能力、介导细胞间通讯以及在慢性疾病中的关键作用。研究AGER及其家族成员有助于开发针对炎症和退行性疾病的治疗策略。

The advanced glycosylation end product (AGE) receptor encoded by this gene is a member of the immunoglobulin superfamily of cell surface receptors. It is a multiligand receptor, and besides AGE, interacts with other molecules implicated in homeostasis, development, and inflammation, and certain diseases, such as diabetes and Alzheimer's disease. Many alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms, as well as non-protein-coding variants, have been described for this gene (PMID:18089847). [provided by RefSeq, May 2011]

由该基因编码的高级糖基化终产物（AGE）受体是细胞表面受体的免疫球蛋白超家族中的一员。它是一个多配受体，而除了年龄，在稳态，开发和炎症牵连其他分子，和某些疾病，如糖尿病和阿尔茨海默氏病进行交互。许多可变剪接转录物变体编码不同同种型，以及非蛋白质编码变体，已经为这种基因（：18089847 PMID）中所述。 [由RefSeq的，2011年5月提供]

OMIM数据库中对AGER基因的介绍     Wikipedia数据库中对AGER基因的介绍

基因序列

基因序列

AGER基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

AGER基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs995       rs995       rs995       rs995       rs995       rs995       rs995       rs996       rs996       rs996       rs996       rs996       rs996       rs996       rs997       rs997       rs997      

基因表达

基因表达

AGER基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGGAAACTGAACACAGGC
58
CCTTTGCCACAAGATGACC
59
AATGGAAACTGAACACAGGC
59
CATTCCTGTTCATTGCCTGG
60
GTCATCTTGTGGCAAAGGC
60
CTGATTCAGTTCTGCACGC
60
CATCAGCATCATCGAACCAG
59
CTTTGCCACAAGATGACCC
59
CACTGGATGAAGGATGGTG
58
ATGATGCTGATGCTGACAG
58
GTGTCAGAGGGAAGCTACC
60
GTTCCTTCACAGATACTCCCT
59
GTGTCAGAGGGAAGCTACC
60
CCTTCACAGATACTCCCTTCTC
60
AATGGAAACTGAACACAGGC
59
CTTTGCCACAAGATGACCC
59
TCAGCATCATCGAACCAGG
60
CCTTTGCCACAAGATGACC
59
ACTGGATGAAGGATGGTGTG
60
GATGATGCTGATGCTGACAG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
NFKB1
AGER
Activation
18622638; 19616578
PPARG
AGER
Repression
18855759
RELA
AGER
Activation
18622638; 19616578

基因本体信息

AGER基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGER基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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A0A0G2JID9 (UniProtKB)
IEA
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A0A0G2JL21 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A0G2JL65 (UniProtKB)
IEA
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A8MS87 (UniProtKB)
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C0IP14 (UniProtKB)
IEA
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Q15109 (UniProtKB)
IDA
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Q15109 (UniProtKB)
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IEA
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Q15109 (UniProtKB)
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Q15109 (UniProtKB)
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Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:0060100
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:0060290
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:0070301
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:0070379
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:0071333
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:0071398
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:0071407
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:0072714
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:1901018
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:2000353
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:2000379
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:2000514
Q15109 (UniProtKB)
IDA
GO:2000676
Q15109 (UniProtKB)
IEA
GO:2001200
Q15109 (UniProtKB)
IMP
GO:0016021
Q3L1R2 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 AGER基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Atherosclerosis 0.213992882 12 0 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN_RGD
Diabetic Angiopathies 0.128987376 7 2 BeFree_CTD_human_LHGDN
Rheumatoid Arthritis 0.128715934 6 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Pulmonary function (finding) 0.124734064 3 1 GAD_GWASCAT
Inflammation 0.12272435 2 0 CTD_human_LHGDN
Hyperglycemia 0.120814326 4 0 BeFree_CTD_human
Lewy Body Disease 0.12 1 0 CTD_human
Pancreatic Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.10445097 27 2 BeFree_GAD_LHGDN_RGD
Diabetic Retinopathy 0.101613118 17 2 BeFree_GAD_LHGDN_RGD

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

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