AGAP6 (ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 6)

symbol:
AGAP6
locus group:
protein-coding gene
location:
10q11.23
gene_family:
ArfGAPs|Ankyrin repeat domain containing|Pleckstrin homology domain containing
alias symbol:
bA324H6.1
alias name:
None
entrez id:
414189
ensembl gene id:
ENSG00000204149
ucsc gene id:
uc001jix.5
refseq accession:
NM_001077665
hgnc_id:
HGNC:23466
approved reserved:
2004-05-27
10q11.23
基因染色体位置图

AGAP6(ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 6)属于AGAP基因家族,该家族成员均含有ArfGAP结构域、GTP酶结构域、锚蛋白重复序列和PH结构域,主要参与调控小G蛋白Arf(ADP-核糖基化因子)的GTP酶活性,影响囊泡运输、细胞骨架重组和信号转导等过程。AGAP6在神经系统中表达较高,其表达产物通过调节Arf蛋白的活性参与神经元突触可塑性和神经递质释放,对维持正常神经功能至关重要。该基因的突变可能导致Arf蛋白功能异常,影响突触囊泡的运输与递质释放,与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)和精神分裂症等精神疾病的发生相关。AGAP6过表达可能增强Arf蛋白的GTP酶活性,导致囊泡运输过度活跃,破坏突触稳态,引发神经元过度兴奋或凋亡;而表达降低则可能减弱Arf调控,使突触传递效率下降,影响学习记忆功能。AGAP家族成员(如AGAP1-3)均通过PH结构域结合膜磷脂,锚定至特定细胞区室,协同调控Arf依赖的膜运输途径。研究表明AGAP6与AGAP1功能部分冗余,但AGAP6在神经元中的特异性作用更为突出。此外,该基因可能通过影响β-淀粉样蛋白前体(APP)的运输参与阿尔茨海默病病理进程,其表达异常还可能与肿瘤细胞侵袭转移相关,因Arf信号通路也调控细胞迁移。目前针对AGAP6的研究仍在深入,其在疾病中的具体机制及作为治疗靶点的潜力有待进一步探索。

None

AGAP6基因的碱基序列:[NCBI]
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AGAP6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9476       rs1057789       rs2490919       rs2573417       rs2573433       rs2805120       rs2805280       rs2805362       rs2805363       rs2813140       rs2997934       rs2997942       rs3098113       rs3121869       rs3175298       rs3964934       rs4042901      

AGAP6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGATGCCTGAAGCTTTGGA
59
CTTCTGTTTGAGAGTTCCTCTG
59
AGATGCCTGAAGCTTTGGA
59
CTTCTGTTTGAGAGTTCCTCTG
59
AGATGCCTGAAGCTTTGGA
59
CATCTGTTTGAGAGTTCCTCTG
59
CTCATTTGCGGTTTCCACC
60
GTCGATGGAATGGAGGAGG
60
CTCATTTGCGGTTTCCACC
59
GTCGATGGAATGGAGGAGG
59
AGGTGACTGTTGAAGTTGG
58
GGTTAAACTCCAAAGCTTCAG
58
AGCTTGTGTTCGACAATATTCC
59
CTCCAAGGTCACAGATATTATTGTC
59
AGCTTGTGTTCGACAATATTCC
59
CTCCAAGGTCACAGATATTATTGTC
60
AGGTGACTGTTGAAGTTGG
58
GGTTAAACTCCAAAGCTTCAG
58
AGGTGACTGTTGAAGTTGG
58
GGTTAAACTCCAAAGCTTCAG
58
      尚未收录相关数据

AGAP6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AGAP6基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005096
A0A087X0I8 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
A0A087X0I8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005096
A0A087X2I8 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
A0A087X2I8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005096
Q5VW22 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
Q5VW22 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q5VW22 (UniProtKB)
IEA

可能调控 AGAP6基因的相关microRNA:     

BioGrid

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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