AFM (afamin)

symbol:
AFM
locus group:
protein-coding gene
location:
4q13.3
gene_family:
alias symbol:
ALB2|ALBA
alias name:
None
entrez id:
173
ensembl gene id:
ENSG00000079557
ucsc gene id:
uc003hhb.4
refseq accession:
NM_001133
hgnc_id:
HGNC:316
approved reserved:
1994-12-09
4q13.3
基因染色体位置图

AFM(Afamin)是一种主要在肝脏中合成的糖蛋白,属于白蛋白基因家族,与白蛋白(ALB)、甲胎蛋白(AFP)和维生素D结合蛋白(GC)同源。该家族成员通常具有结合和运输小分子(如脂类、激素或维生素)的功能。AFM的主要生物学功能是作为脂质转运蛋白,特别是结合并运输维生素E等脂溶性维生素,同时在体液中参与氧化应激调节。它主要在血液、脑脊液和卵泡液中表达,可能影响生殖健康和神经系统功能。AFM的突变可能导致其结合能力下降,影响维生素E的运输,进而增加氧化应激相关疾病(如心血管疾病或神经退行性疾病)的风险。研究表明,AFM水平异常与糖尿病、阿尔茨海默病和某些癌症(如卵巢癌)相关。AFM过表达可能增强抗氧化能力,但可能干扰脂代谢平衡;而表达降低可能导致维生素E缺乏,加剧氧化损伤。该基因家族(白蛋白家族)的共性包括高度保守的结构域、血浆高丰度表达及小分子结合特性。AFM的独特之处在于其糖基化修饰及对生殖和神经系统的潜在调控作用,但具体机制仍需进一步研究。

This gene is a member of the albumin gene family, which is comprised of four genes that localize to chromosome 4 in a tandem arrangement. These four genes encode structurally-related serum transport proteins that are known to be evolutionarily related. The protein encoded by this gene is regulated developmentally, expressed in the liver and secreted into the bloodstream. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是白蛋白基因家族,它是由该定位于4号染色体在串联排列四种基因的一个成员。这四个基因编码已知是进化相关的结构相关的血清转运蛋白。由该基因编码的蛋白质是发育调节,在肝脏中表达并分泌到血液中。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

AFM基因的碱基序列:[NCBI]
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AFM基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1158101       rs1159624       rs1894292       rs1894293       rs2040354       rs2071097       rs2071098       rs2269364       rs2276444       rs3765639       rs4301076       rs4311283       rs4502652       rs4607187       rs4619861       rs4694619       rs4694620      

AFM基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGACCTGTCTATACCAGAGCT
60
ATTTGTCTTCCGCGTAACG
59
AGACCTGTCTATACCAGAGCT
60
ATTTGTCTTCCGCGTAACG
59
AAATACCATTACCTCATCAGGC
58
AAGTAGTGAAAGCTGTCACC
58
AGACCTGTCTATACCAGAGC
58
ATTTGTCTTCCGCGTAACG
59
AGACCTGTCTATACCAGAGC
58
ATTTGTCTTCCGCGTAACG
59
AAATACCATTACCTCATCAGGC
58
AGTAGTGAAAGCTGTCACCA
59
AAATACCATTACCTCATCAGGC
58
GTAGTGAAAGCTGTCACCA
57
GACCTGTCTATACCAGAGCT
58
ATTTGTCTTCCGCGTAACG
59
GACCTGTCTATACCAGAGCT
58
ATTTGTCTTCCGCGTAACG
59
      尚未收录相关数据

AFM基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AFM基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
P43652 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
P43652 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P43652 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P43652 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P43652 (UniProtKB)
IDA
GO:0008431
P43652 (UniProtKB)
IPI
GO:0008431
P43652 (UniProtKB)
IDA
GO:0051180
P43652 (UniProtKB)
IDA
GO:0051180
P43652 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P43652 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P43652 (UniProtKB)
IDA
GO:0072562
P43652 (UniProtKB)
IDA

可能调控 AFM基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.12 1 1 GWASCAT
Ataxia 0.000271442 1 0 BeFree
Hepatitis C 0.000271442 1 0 BeFree
Optic Atrophy, Autosomal Dominant 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree
Liver Failure, Acute 0.000271442 1 0 BeFree
Liver neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Mental Retardation 0.000271442 1 0 BeFree
FRAXE Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree

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