AFAP1L2 (actin filament associated protein 1 like 2)

symbol:
AFAP1L2
locus group:
protein-coding gene
location:
10q25.3
gene_family:
Pleckstrin homology domain containing
alias symbol:
FLJ14564|Em:AC005383.4|XB130
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None
entrez id:
84632
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uc001lbn.5
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NM_032550
hgnc_id:
HGNC:25901
approved reserved:
2004-02-18
10q25.3
基因染色体位置图

AFAP1L2(Actin Filament-Associated Protein 1-Like 2)是一种与肌动蛋白细胞骨架相关的基因,属于AFAP(Actin Filament-Associated Protein)基因家族。该家族成员通常编码能够结合肌动蛋白纤维的支架蛋白,参与调控细胞形态、迁移、粘附以及信号转导等过程。AFAP1L2通过其特定的结构域(如SH3和PH结构域)与其他蛋白质相互作用,影响细胞骨架的动态重组,尤其在神经发育和突触可塑性中可能发挥重要作用。该基因的突变或表达异常可能导致细胞运动或形态发生缺陷,进而与某些神经系统疾病或癌症的进展相关。例如,AFAP1L2的过表达可能促进肿瘤细胞的侵袭和转移,因其增强了细胞迁移能力;而表达降低则可能影响神经元的正常发育或突触功能,导致认知或运动障碍。目前研究还发现AFAP1L2与某些精神分裂症或自闭症谱系障碍的遗传易感性存在潜在关联,但具体机制仍需进一步探索。基因家族成员(如AFAP1和AFAP1L1)均具有类似的肌动蛋白结合功能,但组织分布和调控途径可能存在差异。总体而言,AFAP1L2是细胞骨架调控网络中的关键分子,其功能异常可能对多种生理和病理过程产生广泛影响。

None

AFAP1L2基因的碱基序列:[NCBI]
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AFAP1L2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs472079       rs472134       rs475150       rs480457       rs482627       rs485305       rs490607       rs491529       rs493236       rs493347       rs494133       rs494975       rs496783       rs502568       rs503523       rs507098       rs511407      

AFAP1L2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAACCTGAAGAAGGCTGAG
58
ACAGCTTTGGGATTCTCCA
59
CCAAGATGATTCCAGAACGG
59
GTGTCATATGGCTCAGCCT
60
CAACCTAATGAATCTGGGCAG
59
TTCAGGTAACTGGATGTCTCG
60
AGAAGAAGGAAGAAATCCGGG
60
AGGACTTCCTTGTCTGTGC
60
GGCTTCTGTGCTACAAATCC
59
TTCTCCTTGTGAATGACGCT
60
TCACCTACGACTATGTGGA
57
ACTTTCTCTGCATCAGTAAGAG
58
CCAAGATGATTCCAGAACGG
58
GTGTCATATGGCTCAGCCT
59
AAGAAGGAAGAAATCCGGG
57
CAGGACTTCCTTGTCTGTG
58
CCTACGACTATGTGGATGC
58
ACTTTCTCTGCATCAGTAAGAG
58
CCAAGATGATTCCAGAACGG
59
TGTCATATGGCTCAGCCTC
59
      尚未收录相关数据

AFAP1L2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AFAP1L2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005737
F6QUH3 (UniProtKB)
IEA
GO:0009967
F6QUH3 (UniProtKB)
IEA
GO:0035591
F6QUH3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q8N4X5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q8N4X5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q8N4X5 (UniProtKB)
IDA
GO:0006954
Q8N4X5 (UniProtKB)
IDA
GO:0007346
Q8N4X5 (UniProtKB)
IDA
GO:0017124
Q8N4X5 (UniProtKB)
IPI
GO:0030296
Q8N4X5 (UniProtKB)
IDA
GO:0032675
Q8N4X5 (UniProtKB)
IDA
GO:0032757
Q8N4X5 (UniProtKB)
IDA
GO:0035591
Q8N4X5 (UniProtKB)
IEA
GO:0042169
Q8N4X5 (UniProtKB)
IPI
GO:0045742
Q8N4X5 (UniProtKB)
IDA
GO:0045893
Q8N4X5 (UniProtKB)
IDA
GO:0061098
Q8N4X5 (UniProtKB)
IEA

可能调控 AFAP1L2基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.002367032 1 0 GAD
Thyroid Neoplasm 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Thyroid carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree

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