ADGRE4P (adhesion G protein-coupled receptor E4, pseudogene)

symbol:
ADGRE4P
locus group:
pseudogene
location:
19p13.2
gene_family:
Adhesion G protein-coupled receptors, subfamily E
alias symbol:
PGR16
alias name:
None
entrez id:
326342
ensembl gene id:
ENSG00000268758
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_024075
hgnc_id:
HGNC:19240
approved reserved:
2003-02-25
19p13.2
基因染色体位置图

ADGRE4P(也称为EMR4假基因)属于ADGRE(粘附型G蛋白偶联受体E类)基因家族,该家族成员通常编码与免疫调节和细胞粘附相关的跨膜受体蛋白。ADGRE家族基因的共同特点是含有7次跨膜结构域(典型G蛋白偶联受体特征)和较长的胞外区,这些受体参与细胞间通讯、炎症反应和免疫细胞迁移等过程。ADGRE4P是一个假基因,意味着它在进化过程中失去了编码功能蛋白的能力,可能由于突变积累导致转录或翻译缺陷。假基因通常通过调控其他功能基因的表达或作为非编码RNA发挥作用。虽然ADGRE4P不产生功能性蛋白,但它的基因组位置和序列特征可能影响邻近基因的调控。目前关于ADGRE4P的具体生物学功能研究较少,但作为ADGRE家族成员,其祖先基因可能参与免疫系统功能。假基因的突变通常不会直接影响机体,但可能通过改变染色质结构或竞争性结合调控因子间接影响其他基因表达。ADGRE4P的过表达或低表达可能干扰正常基因调控网络,特别是影响邻近功能基因的表达水平。某些假基因被发现与疾病相关,例如通过产生非编码RNA参与癌症发生,但ADGRE4P与特定疾病的关联尚未明确。研究这类假基因有助于理解基因组进化和基因调控的复杂性。

This gene is a member of the EGF-TM7 receptor gene family which is thought to play a role in leukocyte adhesion and migration. In other vertebrates, including nonhuman primates, this gene encodes a protein containing N-terminal EGF domains and a C-terminal transmembrane domain. Sequence evidence for the human gene, however, indicates nucleotide deletion in the genomic sequence would result in frameshift and early termination of translation. A protein expressed by this gene would be soluble rather than expressed on the cell surface. As the encoded protein has not been detected, this gene may represent a transcribed pseudogene. [provided by RefSeq, Aug 2008]

该基因是被认为在白细胞粘附和迁移作用的EGF-TM7受体基因家族的一个成员。在其他脊椎动物,包括非人灵长类动物,该基因编码含有N末端EGF结构域和C端跨膜结构域的蛋白质。对人类基因序列的证据,但是,表明基因组序列核苷酸缺失会导致翻译移码和提前终止。由该基因表达的蛋白质将是可溶而不是在细胞表面上表达。如所编码的蛋白质也没有被检测到,该基因可能是一种转录假基因。 [由RefSeq的,2008年8月提供]

ADGRE4P基因的碱基序列:[NCBI]
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ADGRE4P基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs166156       rs252567       rs252568       rs252569       rs252570       rs252571       rs252572       rs252573       rs252574       rs252575       rs252576       rs252577       rs252578       rs252579       rs367369       rs367378       rs376640      

ADGRE4P基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCACCATCATCAACACCCT
59
TATATTCCATTCGAACCTGGC
58
TAAATATGCCAGCTGCCAC
58
TCATTAATATTCCTGCCAGACC
58
ACATTTACTCACTGTTGGCTC
59
TGGAAGTAGAACACCAGGT
58
TTCACCATCATCAACACCC
58
ATATTCCATTCGAACCTGGC
58
ACATTTACTCACTGTTGGCT
58
TGGAAGTAGAACACCAGGT
58
ATTCACCATCATCAACACCCT
60
GAAATTTGACTTACCTGGCGA
59
TGGAACATTTACTCACTGTTGG
59
CAAGATAATGACTGCTACTGGC
59
ATTCACCATCATCAACACCC
58
TATTCCATTCGAACCTGGC
58
ATTCACCATCATCAACACCC
58
GAAATTTGACTTACCTGGCGA
59
      尚未收录相关数据

ADGRE4P基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ADGRE4P基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004930
Q86SQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q86SQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
Q86SQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q86SQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007166
Q86SQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007186
Q86SQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q86SQ3 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ADGRE4P基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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