ADAMTS4 (ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4)

symbol:
ADAMTS4
locus group:
protein-coding gene
location:
1q23.3
gene_family:
ADAM metallopeptidases with thrombospondin type 1 motif
alias symbol:
KIAA0688|ADAMTS-2|ADMP-1
alias name:
None
entrez id:
9507
ensembl gene id:
ENSG00000158859
ucsc gene id:
uc001fyt.5
refseq accession:
NM_005099
hgnc_id:
HGNC:220
approved reserved:
1999-04-15
1q23.3
基因染色体位置图

ADAMTS4(A Disintegrin And Metalloproteinase with Thrombospondin Motifs 4)属于ADAMTS基因家族,该家族是一组分泌型金属蛋白酶,以其结构中的去整合素域(disintegrin)和血小板反应蛋白基序(thrombospondin motifs)为特征。ADAMTS家族成员主要参与细胞外基质(ECM)的降解和重塑,在组织发育、炎症、血管生成等生理和病理过程中发挥重要作用。ADAMTS4的生物学功能集中在降解细胞外基质中的蛋白聚糖,特别是聚集蛋白聚糖(aggrecan),这是软骨组织的重要成分。ADAMTS4在关节软骨的降解中起关键作用,与骨关节炎(OA)和类风湿性关节炎(RA)等疾病密切相关。该酶通过切割聚集蛋白聚糖的核心蛋白,导致软骨的破坏和关节功能的丧失。ADAMTS4的活性受到多种因素的调控,包括细胞因子(如IL-1β和TNF-α)和生长因子。突变或异常表达可能影响其酶活性或底物特异性,进而加剧或减轻疾病进程。例如,ADAMTS4的过表达会加速软骨降解,促进关节炎的发展;而降低其表达或抑制其活性可能有助于保护软骨,减缓疾病进展。此外,ADAMTS4还参与其他病理过程,如动脉粥样硬化、肿瘤转移和中枢神经系统疾病。在动脉粥样硬化中,它通过降解血管壁的蛋白聚糖,影响斑块的稳定性。在肿瘤中,ADAMTS4可能通过调节细胞外基质的重塑,影响肿瘤细胞的侵袭和转移。ADAMTS基因家族的共性包括含有前导肽、金属蛋白酶域、去整合素域、血小板反应蛋白基序和间隔区等结构域,这些结构域赋予它们特定的底物识别和蛋白水解能力。家族成员在多种生理和病理过程中发挥作用,涉及ECM代谢、凝血、炎症和组织修复等。ADAMTS4作为该家族的重要成员,其功能异常与多种疾病相关,成为潜在的治疗靶点。

This gene encodes a member of the ADAMTS (a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs) protein family. Members of the family share several distinct protein modules, including a propeptide region, a metalloproteinase domain, a disintegrin-like domain, and a thrombospondin type 1 (TS) motif. Individual members of this family differ in the number of C-terminal TS motifs, and some have unique C-terminal domains. The enzyme encoded by this gene lacks a C-terminal TS motif. It is responsible for the degradation of aggrecan, a major proteoglycan of cartilage, and brevican, a brain-specific extracellular matrix protein. The cleavage of aggrecan and brevican suggests key roles of this enzyme in arthritic disease and in the central nervous system, potentially, in the progression of glioma. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的ADAMTS的成员(去整合素和金属蛋白酶与血小板反应基序)的蛋白质家族。家庭共享几个不同的蛋白质模块的成员,包括一个前肽区,金属蛋白酶结构域,一个去整合素样结构域,和一个血小板1型(TS)的基序。这个家庭的各个成员在C端TS图案的数量不同,有的有独特的C端结构域。由该基因编码的酶缺乏C-末端的TS基序。它负责聚集蛋白聚糖的降解,软骨的主要蛋白多糖,和短蛋白聚糖,特定脑细胞外基质蛋白。聚集蛋白聚糖和短蛋白聚糖裂解表明这种酶的重要作用在关节炎症和在中枢神经系统中,潜在地,在神经胶质瘤的进展。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ADAMTS4基因的碱基序列:[NCBI]
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ADAMTS4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3123546       rs3134666       rs3134667       rs3813622       rs3813623       rs4233366       rs4233367       rs4589131       rs4656992       rs7512012       rs11265564       rs11583589       rs11807350       rs12081170       rs12738103       rs12740751       rs17855812      

ADAMTS4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGGCTCATGTGGATCCTG
59
AAGAGACAGTGCCCATAGC
59
GGCGTGTTACAATATCGGG
58
CTACTCAGTGAAGCAAAGCG
59
AGGCGTGTTACAATATCGG
57
TACTCAGTGAAGCAAAGCG
58
CTCATGTGGATCCTGAGGAG
59
TAAGAGACAGTGCCCATAGC
59
CTCATGTGGATCCTGAGGAG
59
AAGAGACAGTGCCCATAGC
59
GGCGTGTTACAATATCGGG
58
TACTCAGTGAAGCAAAGCG
58
      尚未收录相关数据

ADAMTS4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ADAMTS4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001501
O75173 (UniProtKB)
TAS
GO:0002020
O75173 (UniProtKB)
IPI
GO:0004222
O75173 (UniProtKB)
TAS
GO:0004222
O75173 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
O75173 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
O75173 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
O75173 (UniProtKB)
TAS
GO:0005578
O75173 (UniProtKB)
IEA
GO:0005615
O75173 (UniProtKB)
IDA
GO:0006508
O75173 (UniProtKB)
IEA
GO:0008233
O75173 (UniProtKB)
TAS
GO:0008237
O75173 (UniProtKB)
TAS
GO:0008270
O75173 (UniProtKB)
IEA
GO:0022617
O75173 (UniProtKB)
TAS
GO:0031012
O75173 (UniProtKB)
IDA
GO:0004222
Q5VTW1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
Q5VTW1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q5VTW1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5VTW1 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ADAMTS4基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Compression of spinal cord 0.08 1 0 RGD
Transient Ischemic Attack 0.08 1 0 RGD
Degenerative polyarthritis 0.012516121 18 0 BeFree_LHGDN
Rheumatoid Arthritis 0.00408156 5 0 BeFree_LHGDN
Schizophrenia 0.002367032 1 0 GAD
Ehlers-Danlos Syndrome 0.000814326 3 0 BeFree
Atherosclerosis 0.000814326 3 0 BeFree
Arteriosclerosis 0.000814326 3 0 BeFree
EHLERS-DANLOS SYNDROME, DERMATOSPARAXIS TYPE 0.000542884 2 0 BeFree
Prolapsed lumbar disc 0.000542884 2 0 BeFree

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