ADAMTS2 (ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2)

symbol:
ADAMTS2
locus group:
protein-coding gene
location:
5q35.3
gene_family:
ADAM metallopeptidases with thrombospondin type 1 motif
alias symbol:
ADAMTS-3|hPCPNI|PCINP|ADAM-TS2|NPI
alias name:
procollagen I N-proteinase|procoll…
entrez id:
9509
ensembl gene id:
ENSG00000087116
ucsc gene id:
uc003mjw.3
refseq accession:
NM_014244
hgnc_id:
HGNC:218
approved reserved:
1999-04-15
5q35.3
基因染色体位置图

ADAMTS2(A Disintegrin And Metalloproteinase with Thrombospondin Motifs 2)属于ADAMTS基因家族,这是一个由19个成员组成的蛋白水解酶家族,其共同特点是含有解整合素样结构域(disintegrin-like domain)和金属蛋白酶结构域(metalloproteinase domain),以及至少一个血小板反应蛋白1型重复序列(thrombospondin type 1 repeat, TSP1)。ADAMTS家族成员主要参与细胞外基质(ECM)的加工和重塑,在发育、组织修复和疾病过程中发挥重要作用。ADAMTS2是一种关键的胶原蛋白加工酶,其主要功能是切割前胶原蛋白I、II和III的N端前肽,这一过程对胶原纤维的正确组装和成熟至关重要。该酶主要在成纤维细胞和软骨细胞中表达,其作用位点位于胶原蛋白的N端前肽区域。ADAMTS2的突变会导致Ehlers-Danlos综合征(EDS)的皮肤脆弱型(dermatosparactic type),这是一种罕见的结缔组织疾病,表现为皮肤极度脆弱、关节过度活动以及伤口愈合异常。突变会损害酶的活性,导致前胶原蛋白加工缺陷,进而影响胶原纤维的形成和组织的机械强度。ADAMTS2的过表达可能与某些纤维化疾病相关,因为过量的胶原加工可能导致ECM过度沉积;而表达降低则可能影响伤口愈合和组织修复。ADAMTS2与其他ADAMTS家族成员如ADAMTS3和ADAMTS14在功能上有部分重叠,它们也参与前胶原蛋白的加工,但ADAMTS2是主要的I型胶原加工酶。该基因的调控异常还与骨关节炎和某些癌症的进展有关,因为胶原代谢紊乱会影响肿瘤微环境和转移。总的来说,ADAMTS2在维持结缔组织稳态中扮演关键角色,其功能异常会导致严重的病理后果。

This gene encodes a member of the ADAMTS (a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs) protein family. Members of the family share several distinct protein modules, including a propeptide region, a metalloproteinase domain, a disintegrin-like domain, and a thrombospondin type 1 (TS) motif. Individual members of this family differ in the number of C-terminal TS motifs, and some have unique C-terminal domains. The enzyme encoded by this gene excises the N-propeptide of type I, type II and type V procollagens. Mutations in this gene cause Ehlers-Danlos syndrome type VIIC, a recessively inherited connective-tissue disorder. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2010]

该基因编码的ADAMTS的成员(去整合素和金属蛋白酶与血小板反应基序)的蛋白质家族。家庭共享几个不同的蛋白质模块的成员,包括一个前肽区,金属蛋白酶结构域,一个去整合素样结构域,和一个血小板1型(TS)的基序。这个家庭的各个成员在C端TS图案的数量不同,有的有独特的C端结构域。由该基因编码的酶切除的I型,II型和V型原胶原的N-前肽。突变这个基因导致埃勒斯 - 当洛综合征型VIIC,一个隐性遗传性结缔组织疾病。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2010年7月提供]

ADAMTS2基因的碱基序列:[NCBI]
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ADAMTS2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs15144       rs23438       rs26810       rs26811       rs26812       rs26813       rs26814       rs27697       rs28060       rs28549       rs33896       rs33897       rs33898       rs33899       rs33900       rs35750       rs35751      

ADAMTS2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGATCTCGTCAAAGGGCC
60
CACAGCTTGTTGTAGCCTG
59
AATCTACCATGACGAGTCCT
58
GCTCATGGACTTTCCATAGC
59
CAGTGCTCAGTAACCTGTG
58
GGATCTGAGATGTTTCGGG
58
AAGATCTCGTCAAAGGGCC
60
CACAGCTTGTTGTAGCCTG
59
CGAAACATCTCAGATCCCTC
58
CTTGACGAGATCTTCCGGA
59
ATCACCGTTCTGGTCATCC
60
TCGACATTCAGTGAGTCCTC
59
AAGATCTCGTCAAAGGGCC
60
TTGTTGTAGCCTGGGATGG
60
TACCATGACGAGTCCTTGG
59
GAGGCTCATGGACTTTCCA
59
CCGAAACATCTCAGATCCCT
59
GACGAGATCTTCCGGATGG
60
ATCACCGTTCTGGTCATCC
60
ACATTCAGTGAGTCCTCATGG
60
      尚未收录相关数据

ADAMTS2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ADAMTS2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004222
O95450 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
O95450 (UniProtKB)
TAS
GO:0005578
O95450 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
O95450 (UniProtKB)
IEA
GO:0008237
O95450 (UniProtKB)
TAS
GO:0008270
O95450 (UniProtKB)
IEA
GO:0016485
O95450 (UniProtKB)
IEA
GO:0030199
O95450 (UniProtKB)
IEA
GO:0030324
O95450 (UniProtKB)
IEA
GO:0030574
O95450 (UniProtKB)
IEA
GO:0043588
O95450 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ADAMTS2基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
EHLERS-DANLOS SYNDROME, DERMATOSPARAXIS TYPE 0.441357209 5 2 BeFree_CLINVAR_CTD_human_MGD_ORPHANET
Attention deficit hyperactivity disorder 0.002638474 2 1 BeFree_GAD
Ehlers-Danlos Syndrome 0.001900093 7 0 BeFree
Multiple Myeloma 0.000542884 2 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Mixed phenotype acute leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Psychotic symptom 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm, Residual 0.000271442 1 0 BeFree
Mental Depression 0.000271442 1 0 BeFree

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