ACTR5 (actin related protein 5)

symbol:
ACTR5
locus group:
protein-coding gene
location:
20q11.23
gene_family:
INO80 complex subunits
alias symbol:
FLJ12785|Arp5|INO80M
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INO80 complex subunit M
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79913
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uc002xjd.3
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NM_024855
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HGNC:14671
approved reserved:
2001-06-11
20q11.23
基因染色体位置图

ACTR5(也称为ARP5或BAF53B)是肌动蛋白相关蛋白BAF(BRG1/BRM相关因子)复合体的一个亚基,属于核小体重塑和组蛋白去乙酰化酶(NuRD)复合体家族。这个基因家族主要参与染色质重塑(chromatin remodeling),即通过改变DNA和组蛋白的相互作用来调节基因表达。ACTR5在细胞核中发挥作用,与BRG1或BRM等ATP酶亚基结合,帮助重塑染色质结构,从而影响转录激活或抑制。ACTR5的突变可能导致染色质重塑异常,进而影响细胞分化、增殖和DNA修复等功能,与某些癌症(如乳腺癌、肺癌)和神经发育障碍(如智力障碍)有关。若ACTR5过表达,可能增强染色质重塑活性,导致基因表达失调,促进肿瘤发生;而降低表达则可能削弱染色质重塑能力,影响细胞正常功能。ACTR5属于肌动蛋白相关蛋白(ARP)家族,该家族成员通常含有保守的肌动蛋白折叠结构域(actin fold domain),参与细胞骨架动态和核内染色质调控。其共性包括与ATP依赖的染色质重塑复合体结合,共同调控基因转录、DNA修复和表观遗传修饰。ACTR5的功能依赖于与其他亚基(如BAF47、BAF57)的相互作用,若这些伙伴蛋白异常,也可能间接影响ACTR5的活性。目前研究还发现ACTR5在干细胞多能性维持和神经发育中起关键作用,其表达水平异常可能干扰这些过程。

None

ACTR5基因的碱基序列:[NCBI]
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ACTR5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs911720       rs911721       rs911722       rs1406855       rs1406856       rs2243520       rs2244193       rs2244281       rs2244440       rs2244791       rs2244797       rs2244925       rs2244937       rs2245231       rs2245237       rs2247983       rs2248100      

ACTR5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACATTCTGGACAGGTACCC
59
CAGGATACATCGTGTTGCC
59
CATTCTGGACAGGTACCCA
59
CCAGGATACATCGTGTTGC
59
CATTCTGGACAGGTACCCA
59
CAGGATACATCGTGTTGCC
59
      尚未收录相关数据

ACTR5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ACTR5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9H9F9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H9F9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H9F9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H9F9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H9F9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H9F9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H9F9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9H9F9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q9H9F9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9H9F9 (UniProtKB)
IDA
GO:0006302
Q9H9F9 (UniProtKB)
IMP
GO:0006310
Q9H9F9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q9H9F9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q9H9F9 (UniProtKB)
IEA
GO:0031011
Q9H9F9 (UniProtKB)
IDA
GO:0031011
Q9H9F9 (UniProtKB)
IDA
GO:0070914
Q9H9F9 (UniProtKB)
IMP

可能调控 ACTR5基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.002367032 1 0 GAD
Anoxia 0.002367032 1 0 GAD

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