ACTR1B (actin related protein 1B)

symbol:
ACTR1B
locus group:
protein-coding gene
location:
2q11.2
gene_family:
alias symbol:
Arp1B
alias name:
centractin beta
entrez id:
10120
ensembl gene id:
ENSG00000115073
ucsc gene id:
uc002syb.3
refseq accession:
NM_005735
hgnc_id:
HGNC:168
approved reserved:
1999-05-17
2q11.2
基因染色体位置图

ACTR1B(也称为ARP1或β-centractin)是肌动蛋白相关蛋白1(ARP1)基因家族的成员,属于中心体肌动蛋白家族(centractin family)。该家族主要参与细胞骨架的动态组装和功能调控,尤其是与微管和肌动蛋白丝相关的细胞过程,如细胞分裂、胞内运输和细胞形态维持。ACTR1B编码的蛋白质是动力蛋白复合体(dynactin complex)的核心组分,该复合体协助动力蛋白(dynein)在细胞内沿微管运输囊泡、细胞器和蛋白质复合物,对神经元轴突运输、纺锤体定位和细胞迁移等至关重要。ACTR1B的生物学功能依赖于其与其他动力蛋白复合体亚基(如p150 glued、p50等)的相互作用,通过稳定微管结合和增强动力蛋白的活性来促进定向运输。若ACTR1B发生功能丧失性突变(如错义突变或截短突变),可能导致动力蛋白复合体组装异常,进而破坏细胞内运输,引发神经退行性疾病(如遗传性痉挛性截瘫)或发育缺陷。此外,ACTR1B表达异常(如过表达)可能干扰微管动力学,导致有丝分裂错误和染色体不稳定,与某些癌症(如胶质母细胞瘤)的进展相关;而表达降低则可能损害突触传递或轴突再生,加重神经损伤后的修复障碍。该基因家族成员的共性是均含有保守的肌动蛋白折叠结构域,能够聚合形成丝状结构,但各亚型(如ACTR1A和ACTR1B)在组织分布和功能细节上存在差异。例如,ACTR1B在神经系统中高表达,而ACTR1A更广泛分布于多种组织。目前针对ACTR1B的研究多聚焦于其在神经疾病和肿瘤中的作用,但具体分子机制仍需进一步探索。

This gene encodes a 42.3 kD subunit of dynactin, a macromolecular complex consisting of 10 subunits ranging in size from 22 to 150 kD. Dynactin binds to both microtubules and cytoplasmic dynein and is involved in a diverse array of cellular functions, including ER-to-Golgi transport, the centripetal movement of lysosomes and endosomes, spindle formation, chromosome movement, nuclear positioning, and axonogenesis. This subunit, like ACTR1A, is an actin-related protein. These two proteins, which are of equal length and share 90% amino acid identity, are present in a constant ratio of approximately 1:15 in the dynactin complex. [provided by RefSeq, Aug 2008]

该基因编码dynactin的42.3 kD的亚单位,包括10个亚基22?150 kD的大小不等的大分子复合物。 Dynactin同时结合微管和胞质动力蛋白并参与的细胞功能,包括ER到高尔基体转运,溶酶体和内涵体的心运动,纺锤体形成,染色体的运动,核的定位,并axonogenesis一个多样化。这种亚单位,如ACTR1A,是一种肌动蛋白相关蛋白。这两种蛋白质,它们是相等的长度和共享90%的氨基酸同一性,存在于大约1:15在dynactin复杂的恒定比率。 [由RefSeq的,2008年8月提供]

ACTR1B基因的碱基序列:[NCBI]
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ACTR1B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3474       rs3475       rs13452       rs873886       rs1042705       rs1550995       rs2053824       rs2290123       rs2290124       rs6716208       rs7608385       rs11547231       rs11547232       rs11692435       rs11886025       rs11886239       rs12615489      

ACTR1B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTTCCCAAACTATGTCGGG
59
TTTGGTCCGATGAAGAGGT
59
ATCAGCTGCAGACCTTCTC
60
GGTTCTTACTCGGGTTGAG
58
TGTTTCCCAAACTATGTCGG
58
TTGGTCCGATGAAGAGGTC
59
ATCAGCTGCAGACCTTCTC
60
GTTCTTACTCGGGTTGAGC
58
ATCAGCTGCAGACCTTCTC
60
TTCTTACTCGGGTTGAGCG
60
GTTTCCCAAACTATGTCGGG
59
TTGGTCCGATGAAGAGGTC
59
      尚未收录相关数据

ACTR1B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ACTR1B基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
P42025 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P42025 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P42025 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
P42025 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
P42025 (UniProtKB)
IDA
GO:0005813
P42025 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
P42025 (UniProtKB)
TAS
GO:0005869
P42025 (UniProtKB)
IEA
GO:0015630
P42025 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
P42025 (UniProtKB)
IDA
GO:0019886
P42025 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
P42025 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P42025 (UniProtKB)
IDA
GO:1990752
P42025 (UniProtKB)
IDA

可能调控 ACTR1B基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.000271442 1 0 BeFree

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