ACKR1 (atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group))

symbol:
ACKR1
locus group:
protein-coding gene
location:
1q23.2
gene_family:
Chemokine receptors|Blood group antigens|CD molecules
alias symbol:
CCBP1|GPD|Dfy|CD234
alias name:
atypical chemokine receptor 1|glyc…
entrez id:
2532
ensembl gene id:
ENSG00000213088
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NM_002036
hgnc_id:
HGNC:4035
approved reserved:
2001-06-22
1q23.2
基因染色体位置图

ACKR1(Atypical Chemokine Receptor 1),也称为Duffy抗原受体(DARC),是一种非典型的趋化因子受体,属于G蛋白偶联受体家族中的趋化因子受体亚家族。与典型趋化因子受体不同,ACKR1不能通过G蛋白信号传导激活下游通路,而是通过清除或转运趋化因子来调节炎症反应。它主要表达于红细胞表面、血管内皮细胞及某些组织的上皮细胞,尤其在肾脏、脾脏和大脑中分布较多。ACKR1的生物学功能包括结合并内化多种趋化因子(如CXCL8、CCL2、CCL5等),从而调控局部趋化因子浓度,影响白细胞的迁移和炎症反应。此外,ACKR1还是疟原虫(如间日疟原虫)入侵红细胞的受体,因此其缺失突变(如Duffy阴性表型)可赋予个体对某些疟疾的抵抗力。这种突变在非洲人群中较为常见,是自然选择的结果。ACKR1的过表达可能增强趋化因子的清除能力,减轻炎症反应,但也可能干扰正常免疫应答;而表达降低则可能导致趋化因子积累,加剧炎症或自身免疫疾病风险。研究表明,ACKR1与癌症、动脉粥样硬化、HIV感染等疾病相关,例如在肿瘤微环境中可能通过调节趋化因子网络影响免疫细胞浸润。ACKR1属于非典型趋化因子受体家族(ACKRs),该家族成员(如ACKR2、ACKR3)均缺乏信号传导能力,但通过内化或储存趋化因子参与免疫调控。这一家族的共性在于它们作为“趋化因子清道夫”或“转运体”,平衡趋化因子梯度,间接影响炎症、血管生成和免疫细胞迁移等过程。

The protein encoded by this gene is a glycosylated membrane protein and a non-specific receptor for several chemokines. The encoded protein is the receptor for the human malarial parasites Plasmodium vivax and Plasmodium knowlesi. Polymorphisms in this gene are the basis of the Duffy blood group system. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是糖基化的膜蛋白和几种趋化因子的非特异性受体。所编码的蛋白质是人类疟疾寄生虫间日疟原虫和诺氏疟原虫的受体。在这种基因多态性的达菲血型系统的基础。已发现该基因编码不同亚型的两个转录变异体。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ACKR1基因的碱基序列:[NCBI]
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ACKR1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs12075       rs13962       rs14525       rs863001       rs863002       rs863003       rs1042171       rs1801482       rs2746047       rs2814778       rs3027008       rs3027009       rs3027011       rs3027012       rs3027013       rs3027016       rs3027017      

ACKR1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGACTATGGTGCCAACCT
59
TCATCCAGCAGGTTACAGG
59
GAGACTATGGTGCCAACCT
59
TCATCCAGCAGGTTACAGG
59
TTATCTTGGAAGCACAGGC
58
ACTTGAGTTCTCAGTTGAGGG
60
TTATCTTGGAAGCACAGGC
58
ACTTGAGTTCTCAGTTGAGGG
60
AGACTATGGTGCCAACCTG
59
GTCATCCAGCAGGTTACAG
58
TTATCTTGGAAGCACAGGC
58
ACTTGAGTTCTCAGTTGAGG
57
AGACTATGGTGCCAACCTG
59
GTCATCCAGCAGGTTACAG
58
TTATCTTGGAAGCACAGGC
58
ACTTGAGTTCTCAGTTGAGG
57
TTATCTTGGAAGCACAGGC
58
CTTGAGTTCTCAGTTGAGGG
58
TCAAGTCAGCTGGACTTCG
60
GGAAGGAATCATTCACACCA
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
DBP
ACKR1
Unknown

ACKR1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ACKR1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004872
Q16570 (UniProtKB)
TAS
GO:0004888
Q16570 (UniProtKB)
TAS
GO:0004930
Q16570 (UniProtKB)
IEA
GO:0005769
Q16570 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q16570 (UniProtKB)
TAS
GO:0006952
Q16570 (UniProtKB)
NAS
GO:0006954
Q16570 (UniProtKB)
IBA
GO:0007186
Q16570 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q16570 (UniProtKB)
IEA
GO:0019957
Q16570 (UniProtKB)
IPI
GO:0032642
Q16570 (UniProtKB)
IBA
GO:0055037
Q16570 (UniProtKB)
IEA
GO:0070098
Q16570 (UniProtKB)
IEA
GO:0006954
Q5JY94 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5JY94 (UniProtKB)
IEA
GO:0019956
Q5JY94 (UniProtKB)
IEA
GO:0070098
Q5JY94 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ACKR1基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malaria 0.125895776 14 0 BeFree_CTD_human_GAD
WHITE BLOOD CELL COUNT QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 1 0.12 0 1 CLINVAR
Obesity 0.12 1 1 GWASCAT
Arteriovenous fistula 0.08 1 0 RGD
Malaria, Vivax 0.013463811 10 0 BeFree_GAD
Herpes Simplex Infections 0.008143256 30 0 BeFree
Asthma 0.007458414 2 0 GAD_LHGDN
HIV Infections 0.005276948 4 0 BeFree_GAD
Anemia, Sickle Cell 0.005091382 1 0 GAD_LHGDN
Inflammation 0.005091382 1 1 GAD_LHGDN

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