ABT1 (activator of basal transcription 1)

symbol:
ABT1
locus group:
protein-coding gene
location:
6p22.2
gene_family:
alias symbol:
Esf2
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None
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29777
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uc003nii.4
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NM_013375
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HGNC:17369
approved reserved:
2002-07-23
6p22.2
基因染色体位置图

ABT1(Actin-Binding Tau-1)是一种与微管相关蛋白tau(微管结合蛋白)相互作用的基因,属于微管结合蛋白家族(Microtubule-Associated Proteins, MAPs)。该家族主要参与细胞骨架的稳定、神经元形态维持及细胞内物质运输。ABT1通过结合肌动蛋白(actin)和微管(tubulin),调控细胞骨架动态平衡,尤其在神经元轴突和树突的发育中起关键作用。其表达产物可能参与突触可塑性(指神经元连接强度的适应性变化)和神经信号传递。 ABT1的主要作用位点是神经细胞的细胞骨架,尤其是轴突和树突。若该基因发生突变,可能导致微管稳定性异常,进而影响神经元的形态和功能,与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)相关。突变可能破坏tau蛋白与微管的正常结合,引发tau蛋白异常聚集(形成神经纤维缠结),这是阿尔茨海默病的病理特征之一。 ABT1过表达可能增强微管稳定性,但过度稳定会抑制细胞骨架的动态重组,影响神经元迁移和突触功能,可能导致神经发育障碍。反之,降低表达可能使微管结构松散,损害轴突运输,引发神经退行性病变。此外,ABT1表达异常可能间接影响其他MAPs家族成员(如MAP2、MAP4)的功能,破坏细胞骨架网络的协调性。 该基因家族(MAPs)的共性包括:通过结合微管或肌动蛋白调控细胞骨架组装、维持细胞形态、参与有丝分裂和细胞内运输。若ABT1功能紊乱,可能加剧tau蛋白相关病理,成为神经退行性疾病的潜在治疗靶点。目前其具体机制仍需进一步研究,但明确的是,它在神经系统发育和稳态中扮演重要角色。

Basal transcription of genes by RNA polymerase II requires the interaction of TATA-binding protein (TBP) with the core region of class II promoters. Studies in mouse suggest that the protein encoded by this gene likely activates basal transcription from class II promoters by interaction with TBP and the class II promoter DNA. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由RNA聚合酶II的基因的基础转录需要TATA结合蛋白(TBP)的第II类的启动子的核心区域的相互作用。在小鼠的研究表明,由该基因编码的蛋白质通过用TBP和II类启动子DNA相互作用可能激活从第II类启动子基础转录。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ABT1基因的碱基序列:[NCBI]
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ABT1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs13227       rs13978       rs3800302       rs3800303       rs3800304       rs3807028       rs3807029       rs4591839       rs4634439       rs6915407       rs6915555       rs7767847       rs7768682       rs10719210       rs11386026       rs11755959       rs12203508      

ABT1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACCTCAAGTACTTGCACC
58
GATAGAAGTCGGTCTCACG
57
GAACCTCAAGTACTTGCACC
59
ATAGAAGTCGGTCTCACGC
59
TCTACACAACACGCCTATGG
60
GAAACGGTGCAAGTACTTGAG
60
      尚未收录相关数据

ABT1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ABT1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000166
Q9ULW3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000447
Q9ULW3 (UniProtKB)
IBA
GO:0000472
Q9ULW3 (UniProtKB)
IBA
GO:0000480
Q9ULW3 (UniProtKB)
IBA
GO:0003677
Q9ULW3 (UniProtKB)
IEA
GO:0003713
Q9ULW3 (UniProtKB)
TAS
GO:0003723
Q9ULW3 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
Q9ULW3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9ULW3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9ULW3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9ULW3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9ULW3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9ULW3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9ULW3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9ULW3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9ULW3 (UniProtKB)
TAS
GO:0005667
Q9ULW3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005730
Q9ULW3 (UniProtKB)
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Q9ULW3 (UniProtKB)
IEA
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Q9ULW3 (UniProtKB)
IBA
GO:0044822
Q9ULW3 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q9ULW3 (UniProtKB)
IDA

可能调控 ABT1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Disease Progression 0.12 1 0 CTD_human
Stomach Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Lupus Erythematosus, Systemic 0.002367032 1 1 GAD

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