ABCF2 (ATP binding cassette subfamily F member 2)

symbol:
ABCF2
locus group:
protein-coding gene
location:
7q36.1
gene_family:
ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20)
alias symbol:
EST133090|ABC28|M-ABC1|HUSSY-18
alias name:
None
entrez id:
10061
ensembl gene id:
ENSG00000033050
ucsc gene id:
uc003wjp.5
refseq accession:
NM_005692
hgnc_id:
HGNC:71
approved reserved:
1999-10-26
7q36.1
基因染色体位置图

ABCF2(ATP-binding cassette sub-family F member 2)属于ABC转运蛋白超家族中的F亚家族(ABCF家族),该家族成员均含有ATP结合结构域但不具备跨膜结构域,因此不直接参与物质转运,而是主要调控蛋白质合成和免疫应答等过程。ABCF2基因位于人类7号染色体(7q36.1),其编码的蛋白在核糖体生物合成和翻译调控中发挥作用,通过与核糖体相互作用参与蛋白质合成的质量控制。该基因在多种组织中广泛表达,尤其在增殖活跃的细胞(如癌细胞)中表达较高。ABCF家族成员的共性是均含有两个保守的核苷酸结合域(NBD),通过ATP水解提供能量来调控核糖体功能或应激反应。ABCF2的突变可能导致核糖体组装异常,影响蛋白质合成效率,与某些癌症(如肝癌、乳腺癌)的发生发展相关。研究发现ABCF2过表达会促进肿瘤细胞增殖和转移,可能通过激活mTOR信号通路或影响核糖体功能;而敲低ABCF2则抑制肿瘤生长并增加对化疗药物的敏感性。此外,ABCF2还参与内质网应激反应,其表达水平变化可能影响未折叠蛋白反应(UPR)通路。该基因与病毒感染也存在关联,某些病毒会利用ABCF2来促进自身蛋白合成。在炎症反应中,ABCF2可能通过调控免疫相关基因的表达影响NF-κB信号通路。需要注意的是,ABCF2的功能研究仍在深入,其在代谢疾病和神经退行性疾病中的潜在作用也有待进一步阐明。

This gene encodes a member of the ATP-binding cassette (ABC) transporter superfamily. ATP-binding casette proteins transport various molecules across extra- and intracellular membranes. Alterations in this gene may be involved in cancer progression. Alternative splicing results in multiple transcript variants. Related pseudogenes have been identified on chromosomes 3 and 7. [provided by RefSeq, Jul 2013]

该基因编码的ATP结合盒(ABC)转运超家族的一个成员。 ATP结合盒式蛋白跨越细胞内外膜运输各种分子。在这个基因的改变可能参与癌症进展。选择性剪接结果在多个抄本变形。相关假已经确定在[由RefSeq的,2013年7月提供]染色体3和7。

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
ABCF2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2414       rs736053       rs897917       rs1056717       rs1056724       rs1065071       rs1122979       rs1123322       rs1563636       rs2045465       rs2242141       rs2279024       rs2487157       rs2608287       rs2608288       rs2608289       rs2608290      

ABCF2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGCCATCAATGAGTTTGAGG
59
CAAATTTCCTGTGCAACCTG
58
TGCCATCAATGAGTTTGAGG
59
CAAATTTCCTGTGCAACCTG
58
ACATGAAGAACTACATTGCGAG
59
GTAGCGTCTTCTCCTTGCT
60
GAGATGTTGTCACAGAACCA
58
TGGTCAGCAAATCTACTTCTG
58
TTGTAGGGAAACCGGAGAC
59
TTGTTTCAGGGAGCTTTGGA
60
GATCTTGCATGGACTGGGT
60
GAATAAAGAGGGCTCTGGCA
60
GAGATGTTGTCACAGAACCA
57
TGGTCAGCAAATCTACTTCTG
58
TTCTGAATGGTGTCTGTACC
57
CGTACTGATCATAATTACCCGT
58
ATGGAATTGGAAAGTCCATGC
59
GATGGTAGATGTCGATGTGC
59
CATTCAGCAGGTTGCACAG
60
TTGTAAGCCAGGATGTCTCC
60
      尚未收录相关数据

ABCF2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ABCF2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005524
C9JHK9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016887
C9JHK9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
C9JZV3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016887
C9JZV3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
Q9UG63 (UniProtKB)
TAS
GO:0005524
Q9UG63 (UniProtKB)
IEA
GO:0005740
Q9UG63 (UniProtKB)
TAS
GO:0006810
Q9UG63 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
Q9UG63 (UniProtKB)
IDA
GO:0016887
Q9UG63 (UniProtKB)
IEA
GO:0043190
Q9UG63 (UniProtKB)
TAS

可能调控 ABCF2基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Disease Progression 0.12 1 0 CTD_human
Adenocarcinoma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Adenocarcinoma, Clear Cell 0.00272435 1 0 LHGDN
Uterine Corpus Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian adenocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of endometrium 0.000271442 1 0 BeFree
Endometrial Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Uterine Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。