ABCE1 (ATP binding cassette subfamily E member 1)

symbol:
ABCE1
locus group:
protein-coding gene
location:
4q31.21
gene_family:
ATP-binding cassette transporters, subfamily E (OABP)
alias symbol:
RLI|OABP|RLI1
alias name:
RNase L inhibitor 1
entrez id:
6059
ensembl gene id:
ENSG00000164163
ucsc gene id:
uc003ijy.4
refseq accession:
NM_002940
hgnc_id:
HGNC:69
approved reserved:
1995-11-01
4q31.21
基因染色体位置图

ABCE1基因属于ATP结合盒(ABC)转运蛋白超家族中的E亚家族,其编码的蛋白也被称为RNase L抑制剂(RLI)或HP68。该基因位于人类4号染色体上(4q31.21),其表达产物是一种ATP酶,具有两个保守的核苷酸结合域(NBD),但与其他ABC转运蛋白不同,它缺乏跨膜结构域,因此不参与物质转运。ABCE1的主要功能包括参与核糖体生物合成、mRNA翻译起始和抗病毒免疫反应。在核糖体组装过程中,ABCE1作为关键因子帮助40S小亚基的成熟。在翻译起始阶段,它与eIF5和eIF2等起始因子相互作用,促进起始复合物的形成。此外,ABCE1还能抑制RNase L的活性,从而调节干扰素诱导的抗病毒反应通路。该基因的突变可能导致核糖体生成障碍,影响蛋白质合成,进而引发发育异常或疾病。研究发现ABCE1在多种癌症中过表达,如前列腺癌和乳腺癌,可能与肿瘤发生和转移相关。过表达ABCE1会增强细胞增殖和翻译效率,而敲低表达则会导致核糖体生成受阻、蛋白质合成减少和细胞生长抑制。ABCE1还参与HIV-1病毒的复制,其与病毒衣壳蛋白的相互作用对病毒颗粒组装至关重要。作为ABC转运蛋白家族成员,ABCE1保留了该家族典型的ATP结合和水解特性,但因其缺乏跨膜结构域而功能独特。ABC家族蛋白通常利用ATP水解产生的能量进行底物转运,而ABCE1则将这些能量用于核糖体组装和翻译调控等过程。该基因在进化上高度保守,从酵母到人类都存在同源基因,表明其在细胞基本功能中的重要性。

The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the OABP subfamily. Alternatively referred to as the RNase L inhibitor, this protein functions to block the activity of ribonuclease L. Activation of ribonuclease L leads to inhibition of protein synthesis in the 2-5A/RNase L system, the central pathway for viral interferon action. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是ATP结合盒(ABC)转运蛋白的超家族中的一员。 ABC蛋白质跨越预算外内和细胞膜输送各种分子。 ABC基因被分为七个不同亚科(ABC1,MDR / TAP,MRP,ALD,OABP,GCN20,白色)。这种蛋白质是OABP亚科的成员。可替代地被称为的RNase L抑制剂,该蛋白质的功能的核糖核酸酶大号导致抑制蛋白质的合成在2-5A / RNA酶L系??统,用于病毒干扰素作用的中央通路的阻断核糖核酸酶L。活化的活性。已发现了该基因编码的蛋白质相同的两个转录变异体。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ABCE1基因的碱基序列:[NCBI]
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ABCE1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs728674       rs959304       rs1378314       rs1378315       rs1455135       rs2124206       rs3756145       rs3775803       rs3836694       rs4148230       rs4148231       rs4148232       rs4148233       rs4148234       rs4148235       rs4148243       rs4835202      

ABCE1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCCCAAATCAACTGGAAGTG
60
CGGTCACAAATTGTGGGTG
60
TACTCACCCACAATTTGTGAC
59
CCAGATAATGTCTGCACCTC
58
TACTCACCCACAATTTGTGAC
59
CCAGATAATGTCTGCACCTC
58
CAAACTTCACAGGTTGCCT
59
AGCAGTTGACTTTCCAATACC
59
AAAGTGAAGGCAAGAGCTG
58
GAAAGAATATCCAGCTCTTCTGG
59
ATCATGGCCACCTATCTAGC
59
GGTTTGAGGACTGTTTGCA
59
GCAGCTTGATTTAACCCACC
60
ACAGCACAAGCAAATCTCTG
59
GACCAGATTCCTAAGGCTG
57
GGGTTAAATCAAGCTGCTG
57
ACCAGATTCCTAAGGCTGC
60
CAAACATGAAACAAGCTGCTG
59
TTCTCCAGGGAAGTGTTCG
59
GAGGCTTCATTACATCGGTC
59
      尚未收录相关数据

ABCE1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ABCE1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005524
D6R9I9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016887
D6R9I9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
D6RGF4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016887
D6RGF4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
H0Y990 (UniProtKB)
IEA
GO:0016887
H0Y990 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P61221 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P61221 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
P61221 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
P61221 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
P61221 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
P61221 (UniProtKB)
IDA
GO:0005759
P61221 (UniProtKB)
TAS
GO:0006401
P61221 (UniProtKB)
TAS
GO:0008428
P61221 (UniProtKB)
TAS
GO:0009615
P61221 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
P61221 (UniProtKB)
IDA
GO:0016032
P61221 (UniProtKB)
IEA
GO:0016887
P61221 (UniProtKB)
IEA
GO:0043086
P61221 (UniProtKB)
IEA
GO:0055085
P61221 (UniProtKB)
TAS

可能调控 ABCE1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Colorectal Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Prostatic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Colonic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of prostate 0.002367032 1 0 GAD
HIV Infections 0.000814326 3 0 BeFree
Esophageal carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of esophagus 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree

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