ABCC11 (ATP binding cassette subfamily C member 11)

symbol:
ABCC11
locus group:
protein-coding gene
location:
16q12.1
gene_family:
ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP)
alias symbol:
MRP8
alias name:
None
entrez id:
85320
ensembl gene id:
ENSG00000121270
ucsc gene id:
uc059txd.1
refseq accession:
NM_032583
hgnc_id:
HGNC:14639
approved reserved:
2001-06-01
16q12.1
基因染色体位置图

ABCC11基因属于ATP结合盒转运蛋白家族(ABC转运蛋白家族),该家族成员广泛参与跨膜物质转运,利用ATP水解产生的能量将底物(如代谢产物、药物、脂质等)逆浓度梯度运输。ABCC11编码一种跨膜蛋白,主要在乳腺、顶浆汗腺(apocrine sweat gland)、耳垢腺及睾丸中表达,其蛋白产物负责将多种疏水性化合物(如胆红素、类固醇、药物等)排出细胞。该基因最著名的功能变异是538位点的单核苷酸多态性(SNP, rs17822931),该突变导致第180位氨基酸由甘氨酸变为精氨酸(G180R),使蛋白功能丧失。这一突变直接影响耳垢类型(干型或湿型)和腋下体味分泌——功能型等位基因(未突变)导致湿性耳垢和强烈体味,而突变纯合子表现为干性耳垢和无体味。此外,ABCC11与乳腺癌耐药性相关,其过表达可能通过外排化疗药物(如5-氟尿嘧啶)降低治疗效果;相反,表达降低可能增加药物敏感性。该基因还与腋臭症(bromhidrosis)和耳垢栓塞风险相关。在东亚人群中突变等位基因频率较高(80-95%),而非洲和欧洲人群则相反(<3%)。若ABCC11过表达,可能增强外源性毒素的清除能力,但也会干扰药物代谢;表达降低则可能导致胆红素等代谢物积累。ABC转运蛋白家族的共性是具有保守的ATP结合结构域(nucleotide-binding domain, NBD)和跨膜结构域(transmembrane domain, TMD),形成"两个NBD+两个TMD"的基本结构单元,通过构象变化实现物质转运。

The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This ABC full transporter is a member of the MRP subfamily which is involved in multi-drug resistance. The product of this gene participates in physiological processes involving bile acids, conjugated steroids, and cyclic nucleotides. In addition, a SNP in this gene is responsible for determination of human earwax type. This gene and family member ABCC12 are determined to be derived by duplication and are both localized to chromosome 16q12.1. Multiple alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的蛋白是ATP结合盒(ABC)转运超家族中的一员。 ABC蛋白质跨越预算外内和细胞膜输送各种分子。 ABC基因被分为七个不同亚科(ABC1,MDR / TAP,MRP,ALD,OABP,GCN20,白色)。此ABC充分转运是其参与多药耐药性的MRP亚科的成员。该基因的产物参与涉及胆汁酸,共轭类固醇,和环核苷酸的生理过程。此外,在该基因的SNP是负责测定人耳垢类型。这个基因和家族成员ABCC12决心通过重复得到,并均定位于染色体16q12.1。多个可变剪接转录物变体已被用于这个基因说明。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ABCC11基因的碱基序列:[NCBI]
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ABCC11基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1075589       rs1468868       rs4396534       rs5017203       rs7184831       rs7185951       rs7187233       rs7191844       rs7194667       rs7195606       rs7196373       rs7203695       rs7206909       rs7359477       rs7500149       rs8043751       rs8046378      

ABCC11基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACCGAAAGGGAAGTCCTC
59
GGATCACTGAGAGCTTGGA
59
TAGATCCCTTTGACCGTCAC
59
ACTTTGAGATGGCCTTGGT
59
GGAAGTGGCAGAGAATTGG
59
ATGTCATCGCCTATGTCGA
59
CATTGAAGACCTAAGAAGGAAGG
59
GATGAACAAGGTTATACTTGTCAGG
60
TAGATCCCTTTGACCGTCAC
59
ACTTTGAGATGGCCTTGGT
59
TAGATCCCTTTGACCGTCAC
59
ACTTTGAGATGGCCTTGGT
59
CCTACTTCATTATTGGATACACTGC
60
TCTTGTCATGAATACCGCCA
60
AGGAACCATCAGATTCAACCT
59
AGGAATGTCCTCTCCAAGG
58
ATTTACAGTCCAGCCTAGACTG
60
GGTATAATCAATATCTTCACCTCCC
59
TAGATCCCTTTGACCGTCAC
59
TAAGGATGATGGCCTTGGTC
60
      尚未收录相关数据

ABCC11基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ABCC11基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005524
H3BRJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H3BRJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0042626
H3BRJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0055085
H3BRJ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
Q96J66 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q96J66 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q96J66 (UniProtKB)
IDA
GO:0008514
Q96J66 (UniProtKB)
IDA
GO:0015216
Q96J66 (UniProtKB)
IDA
GO:0015711
Q96J66 (UniProtKB)
IDA
GO:0015711
Q96J66 (UniProtKB)
IDA
GO:0015865
Q96J66 (UniProtKB)
IDA
GO:0043225
Q96J66 (UniProtKB)
TAS
GO:0055085
Q96J66 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
Q96J66 (UniProtKB)
IDA
GO:0098656
Q96J66 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ABCC11基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Disease Progression 0.12 1 0 CTD_human
EAR WAX, WET/DRY 0.12 0 1 CLINVAR
Malignant neoplasm of breast 0.004810009 9 0 BeFree_GAD
Vasculitis 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Breast Carcinoma 0.002442977 9 0 BeFree
Sweat Gland Diseases 0.002367032 1 0 GAD
Acute Promyelocytic Leukemia 0.001085767 4 0 BeFree
Bromhidrosis 0.001085767 4 0 BeFree
Septicemia 0.000814326 3 0 BeFree
Sepsis 0.000814326 3 0 BeFree

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