ABCB6 (ATP binding cassette subfamily B member 6 (Langereis blood group))

symbol:
ABCB6
locus group:
protein-coding gene
location:
2q35
gene_family:
ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP)
alias symbol:
EST45597|umat|MTABC3
alias name:
ATP-binding cassette half-transpor…
entrez id:
10058
ensembl gene id:
ENSG00000115657
ucsc gene id:
uc002vkc.3
refseq accession:
NM_005689
hgnc_id:
HGNC:47
approved reserved:
1999-10-26
2q35
基因染色体位置图

ABCB6属于ATP结合盒(ABC)转运蛋白超家族,该家族成员广泛存在于生物体中,负责利用ATP水解产生的能量跨膜转运多种底物,如离子、脂类、药物和代谢产物等。ABCB6定位于线粒体和溶酶体膜,主要参与血红素合成途径中的原卟啉IX转运,对维持细胞内铁代谢平衡至关重要。该基因编码的蛋白质具有典型的ABC转运蛋白结构域,包括核苷酸结合域(NBD)和跨膜域(TMD),通过构象变化实现底物转运。ABCB6突变可导致显性遗传性皮肤病——家族性色素异常症(Dyschromatosis universalis hereditaria),表现为皮肤色素沉着与减退斑块,其机制可能与血红素代谢紊乱及线粒体功能异常有关。此外,ABCB6在多种癌症中过表达(如肝癌、结肠癌),可能与肿瘤耐药性相关,因其可外排化疗药物;同时其表达水平升高可能通过影响铁代谢促进肿瘤细胞增殖。敲除或抑制ABCB6会导致原卟啉IX在线粒体积累,干扰血红素合成,引发贫血和光敏性皮炎等表型。值得注意的是,ABCB6还参与细胞解毒过程,并与砷剂敏感性相关。该基因家族(ABC-B亚家族)成员多定位于细胞器膜,在物质隔离和细胞保护中起关键作用。研究还发现ABCB6与ABCB7等家族成员存在功能冗余,共同调控金属离子稳态。其表达受Nrf2转录因子调控,在氧化应激条件下表达上调。

The membrane-associated protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the MDR/TAP subfamily. Members of the MDR/TAP subfamily are involved in multidrug resistance as well as antigen presentation. This half-transporter likely plays a role in mitochondrial function. Localized to 2q26, this gene is considered a candidate gene for lethal neonatal metabolic syndrome, a disorder of mitochondrial function. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的膜相关蛋白是ATP结合盒(ABC)转运蛋白的超家族中的一员。 ABC蛋白质跨越预算外内和细胞膜输送各种分子。 ABC基因被分为七个不同亚科(ABC1,MDR / TAP,MRP,ALD,OABP,GCN20,白色)。这种蛋白是对MDR / TAP亚科的成员。耐多药/ TAP亚家族成员都参与了多药耐药以及抗原提呈。这个半转运可能起着线粒体功能的作用。定位于2q26,该基因被认为是致命的新生儿代谢综合征的候选基因,线粒体功能紊乱。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

ABCB6基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
ABCB6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs10799       rs908195       rs1053289       rs1109866       rs1109867       rs1135602       rs2139823       rs2293080       rs2385398       rs3731884       rs3731885       rs3755047       rs3755048       rs4674369       rs6436126       rs6727770       rs9288542      

ABCB6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GACATTTCACAGGTGACCC
59
GGTGTCATTAAAGAGGACAGTG
59
GAATGATGAGGTGGAGGCT
59
CTGTGTCCTGTACCCTTCAG
60
CTCATCTTCTCCCACCTGC
60
TTGAACACCAGGTAGCTGAG
60
CATTTCACAGGTGACCCAG
59
ATGGTGTCATTAAAGAGGACAG
58
TTTGCAGCTGAGAACTTGG
59
GGCTAAACTGAACCTGCTG
59
CAGGTTCAGTTTAGCCTGTG
59
CAGTCAGCAAGTTCACTGG
59
GAACATTGTGAACTTGCTGAC
58
AACTTGAGGAAGACGTAACTG
58
GTATGTGGTCTCTGGAGGG
59
CAGTCAGCAAGTTCACTGG
59
GGGAATGATGAGGTGGAGG
60
CCACCACACGTTTCTTCAG
59
TTTCGTCGTGCTATGAACAC
59
TGTAATACTTCACCGTCTCGA
59
      尚未收录相关数据

ABCB6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ABCB6基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005524
H7BXK9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7BXK9 (UniProtKB)
IEA
GO:0042626
H7BXK9 (UniProtKB)
IEA
GO:0055085
H7BXK9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7C049 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7C1R6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7C245 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
Q9NP58 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005740
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005741
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005741
Q9NP58 (UniProtKB)
TAS
GO:0005743
Q9NP58 (UniProtKB)
IBA
GO:0005768
Q9NP58 (UniProtKB)
ISS
GO:0005783
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005789
Q9NP58 (UniProtKB)
IEA
GO:0005794
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0006779
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0006810
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0006879
Q9NP58 (UniProtKB)
IBA
GO:0006879
Q9NP58 (UniProtKB)
NAS
GO:0007420
Q9NP58 (UniProtKB)
IMP
GO:0010008
Q9NP58 (UniProtKB)
IEA
GO:0015232
Q9NP58 (UniProtKB)
TAS
GO:0015439
Q9NP58 (UniProtKB)
IMP
GO:0015562
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0015886
Q9NP58 (UniProtKB)
IMP
GO:0015886
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0020037
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0031307
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0043190
Q9NP58 (UniProtKB)
NAS
GO:0043588
Q9NP58 (UniProtKB)
IMP
GO:0055085
Q9NP58 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
Q9NP58 (UniProtKB)
IDA

可能调控 ABCB6基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Pseudohyperkalemia, Familial, 2, due to Red Cell Leak 0.24 0 3 CLINVAR_ORPHANET
DYSCHROMATOSIS UNIVERSALIS HEREDITARIA 3 0.24 4 4 CLINVAR_UNIPROT
MICROPHTHALMIA, ISOLATED, WITH COLOBOMA 7 0.24 1 2 CLINVAR_UNIPROT
Congenital ocular coloboma (disorder) 0.120814326 3 0 BeFree_ORPHANET
Polycystic Ovary Syndrome 0.12 1 0 CTD_human
Dyschromatosis universalis 0.12 0 0 ORPHANET
BLOOD GROUP, LANGEREIS SYSTEM 0.12 0 4 CLINVAR
Colorectal Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Prion Diseases 0.005157396 19 0 BeFree
Diffuse Large B-Cell Lymphoma 0.004885954 18 0 BeFree

联系地址

山东省济南市章丘区文博路2号

齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号

大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。


商务邮箱

E-mail: product@genelibs.com