基因云馆新一代信息数据库

为了支持公共使用和分享基因表达数据，NCBI开始了基因表达汇编（GEO）计划。

GEO是努力建立一个基因表达数据仓库和在线资源，用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。

此模块可以将GEO上的数据文件本地化，将其转化为平台所用的格式，使其可以在平台上进一步的处理，同时，也将记录相关的平台信息，注释信息等文件，对应下步的内容处理。

来自microarray、二代测序、高密度寡核苷酸array（HAD）、杂交膜（filter）和SAGE的许多类型的基因表达数据都可以被接受，登记，和存档，作为一个公共数据集合。

用户可以方便的在GEO搜索框中检索关于疾病的各种数据。即直接在搜索框中输入疾病的英文名称，就可以获得所有与这个疾病相关的基因表达数据。

点击进入GEO数据库

数据仓库简介

GEO结果分为几个重要的部分

标题：数据集的名称，类似于文章的标题

综述：简要介绍数据集的内容，如实验方法，步骤，结果，结论等。

平台：高通量实验使用的平台，一般是平台的商品代码。

引用：如果此数据集已经发表，那么这里显示的就是数据集的文献。

平台号：一般以GSE加数字表示，是平台数据集的唯一识别号，这个号也可以用于数据集在基因云馆平台本地化。

平台模块的使用方法

在GEO平台中找到我们需要的数据后（例如，某些疾病数据，细胞系数据等等），您就可以记录下该数据的平台号，并在云馆平台中进行本地化了。

所谓本地化，就是将GEO里的数据，变成平台可以识读的格式。

点击上面的进入系统运行模块按钮，登入平台操作，如果您还没有注册，您需要先进行免费注册。

登入后显示

在框中输入平台号，点击运行即可。结果如下所示：

结果即可进行进一步的预处理、分析等操作了。