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CRISPR文章盘点

来源/作者:Genelibs   发表时间:2016-07-25 14:42:32  
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CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats)是生命进化历史上,细菌和病毒进行斗争产生的免疫武器,简单说就是病毒能把自己的基因整合到细菌,利用细菌的细胞工具为自己的基因复制服 务,细菌为了将病毒的外来入侵基因清除,进化出CRISPR系统,利用这个系统,细菌可以不动声色地把病毒基因从自己的染色体上切除,这是细菌特有的免疫 系统。让我们一起来盘点一下关于CRISPR的文章:

(本文章盘点带pdf的 信息来源于网络  如有异议  请联系我们)


一、CRISPR先驱发表最新研究成果

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Argonaute蛋白是真核生物RNAi的关键效应子,它还参与了原核生物的基因组防御。加州大学伯克利分校的研究人员最近在细菌中发现了一种CRISPR相关的非经典Argonaute。研究显示,这种Argonaute蛋白有着与众不同的特异性。研究人员指出,细菌Marinitoga piezophila的CRISPR-cas操纵子编码了一种非经典Argonaute(MpAgo)。这种Argonaute蛋白使用5' 羟基化的引导RNA来识别和切割底物,而其它已知Argonaute都使用5'磷酸化的引导RNA。研究人员还获得了MpAgo-RNA复合体的高分辨率晶体结构(2.0Å)。他们以结构为基础进行序列比对,鉴定了其它偏爱5' 羟基化RNA的原核Argonaute。研究表明,这些蛋白都编码在CRISPR-cas位点中。

原文链接:http://www.genelibs.com/article/News.do?method=GetNews&id=53

A bacterial Argonaute with noncanonical guide RNA specificity.pdf



二、马涵慧博士Nature Biotechnology:突破性CRISPR新技术

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来自麻省大学医学院的科学家开发出了一项利用CRISPR/Cas9的新技术:CRISPRainbow,它使得研究人员能够在活细胞中标记和追踪7个 不同的基因组位点。这一标记系统将成为实时研究基因组结构的一个宝贵的工具。基因编辑工具CRISPR-Cas9现在可作为一种灵活、易使用的方法,靶向及追踪活细胞中RNA的活动。有可能最终可用于研究广泛的疾病相关RNA过程,及操控基因转录进行疾病建模。

原文链接:http://www.genelibs.com/article/News.do?method=GetNews&id=142

Multiplexed labeling of genomic loci with dCas9 and engineered sgRNAs using CRISPRainbow.pdf




三、CRISPR发现新基因功能

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CRISPR 系统的一大亮点在于导向RNAs的特异性,张锋说,这样一来我们就能生成靶向每个基因或某个基因多个位点的CRISPR导向慢病毒库。然后再转导进入细胞 系,获得单个基因或被激活,或被失活的细胞池。 CRISPR 系统的一大亮点在于导向RNAs的特异性,张锋说,这样一来我们就能生成靶向每个基因或某个基因多个位点的CRISPR导向慢病毒库。然后再转导进入细胞 系,获得单个基因或被激活,或被失活的细胞池。CRISPR/Cas9对生物技术的研究确实做了很大的研究,对很多技术的研发奠定了基础。

原文链接:http://www.genelibs.com/article/News.do?method=GetNews&id=383

Genome-Scale CRISPR-Cas9 Knockout Screening in Human Cells.pdf



四、CRISPR/Cas新研究成果

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哈佛大学的研究人员利用细菌CRISPR/Cas适应性免疫系统,开发出了一种 方法长期记录活细胞中的分子事件。这一系统将特异的合成DNA元件按一种时间上有序的排列整合到了细菌基因组中,一旦测序就可以提供细菌DNA事件时间表 的读取值。 特拉维夫大学微生物学家Udi Qimron(未参与该项工作)说:“这项工作的重要之处在于提供了一个原理证明:或许可以利用一种令人着迷的细菌免疫系统来作为一种具有骄人记录能力的工具。”

原文链接:http://www.genelibs.com/article/News.do?method=GetNews&id=392

Molecular recordings by directed CRISPR spacer acquisition.pdf



五、张素春教授Cell Stem Cell:当细胞疗法遇上CRISPR

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来自威斯康星大学麦迪逊分校的神经科学家们将一种遗传开关插入到了神经细胞中,使得患者可以通过服用不影响任何其他细胞的设计药物来改变它们的活性。正在研究的细胞是可以生成神经递质多巴胺的神经元,其发生缺陷是广泛运动障碍帕金森病的罪魁祸首。

原文链接:http://www.genelibs.com/article/News.do?method=GetNews&id=168

Chemical Control of Grafted Human PSC-Derived Neurons in a Mouse Model of Parkinson’s Disease.pdf



六、CRISPR基因敲除、CRISPRi与shRNA,谁更胜一筹?

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来自荷兰癌症研究所的研究人员通过鉴别必需基因,验证了CRISPR基因敲除筛查优于短发夹RNA(shRNA)和CRISPR干扰(CRISPRi)。功 能性遗传筛查为研究领域提供了许多有价值的信息,在肿瘤学领域它被利用来鉴别诊断标记物和治疗靶点,或是在病毒学中用于鉴别对于病毒成功入侵和/或繁殖至 关重要的宿主细胞因子。大规模的基因扰动通常是借助于RNA干扰(RNAi)来实现,但这种方法受限于混乱的脱靶活性及易变的基因敲落效率。尽管利用多种 载体来靶向同一基因可以部分程度上减轻这些不利之处,其仍然难以构建出有效及可靠的全基因组文库。

原文链接:http://www.genelibs.com/article/News.do?method=GetNews&id=212

CRISPR knockout screening outperforms shRNA and CRISPRi in identifying essential genes.pdf


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