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生物信息培训讲座

来源/作者:genelibs   发表时间:2016-04-22 00:27:30  
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  您热爱生物信息学并且准备立足于生物界吗?

  您对于软件繁杂的使用方法和众多参数不知如何取舍吗?  

        您有数据分析的需求却苦于不知从何着手吗?

  您面对众多的生物信息学分析软件却不知该如何选择应用吗?

  ……

  基因云馆帮你翻开生命科学事业新篇章。

  这里有——

  一流的生物信息专家

  个性魅力的教师团队

  浓厚的科研氛围

  宝贵的学习机会

培训班的能给您带来的效果:

  1. 熟练掌握生物信息学种常用软件的下载、安装及使用;

  2. 具备独立分析基因组数据的能力,如组装、基因预测、功能注释、重复序列分析、SNP分析、芯片设计等一系列注释分析,以方便您更好的利用公共数据资源;

  3. 我们还可根据您实验室的具体问题提供相应的软硬件分析解决方案,建立起您自己的生物信息分析实验室。

招生对象:生物各学科的研究人员及在校学生。
导师队伍:请致电详询

授课方式:
  以学习为主,不搞任何虚的东西,为期三个星期。
  小班上课,最多10人,单机实习。理论授课结合具体案例分析,上机操作,教师亲自指点,讲授生物信息学常用软件,教你深入研究生物信息学,毕业颁发结业证。

课程内容安排:


课程内容

具体内容

第一部分

一 Unix/Linux操作系统介绍

基本命令介绍
    系统环境介绍
    上机实习

二   数据的基本处理

    (1)测序原理介绍:
    (2)峰图转化:Phred、Phd2fasta
    (3)载体屏蔽:Cross_match
    (4)序列聚类拼接:Phrap、consed、Cap3
    (5)引物设计:Primer3
    上机实习

三   序列的比对

     (1)全局比对: Clustalw、Mumer、Hmmer
     (2)局部比对:
    Blast、Blat、Blaatz、Genewise、Fasta、Sim4
    Exonerate
    上机实习

第二部分

四   基因组/基因注释分析

    (1)重复序列分析:   Repeatmasker、Trf
    (2)RNA分析:tRNAScan、microrna、snorna、rrna
    上机实习
    基因预测:
    A:原核生物及古菌 Glimmer
    B:真核生物 GlimmerM、Genscan、Twinscan、BGF
    (4) 基因功能注释:
    Nt、Nr、SwissProt、Kegg、Interpro、GO(WEGO)
    上机实习

五 SNP分析

    Polyphred、SNPdetector、Crossmatch
    上机实习

六   分子进化专题

    (1) 进化树,分歧年代计算: Phylip、PAML、FGF、Mega
    (2) 进化压力: kaks_calculator、K_estimator
    上机实习

第三部分

七   基因表达分析专题

    (1) 表达序列标签(EST)分析: 
    A EST数据的基本处理; B 差异表达分析;
    C 功能注释及分类
    上机实习
    (2) 生物芯片(Microarray)分析:
    A 芯片介绍 ; B Oligo设计; C 芯片数据分析
    (3)Motif预测:
    A Meme/Mast; B MDScan
    上机实习

八   蛋白质结构预测专题

    (1) 保守区域(domain)预测: Interpro、Pfam
    (2) 信号胎的预测: SignalP
    上机实习
    (3) 跨膜区结构预测: TMHMM、SOSUI
    (4) 三维结构预测: BGI Protein Pipeline
    上机实习

第四部分

九   公用数据介绍

NCBI、EST、STS、SNP、Genome、cDNA、UCSC、NSEMBL、SWISSPROT、PDB、Rice   Genome、Silkworm Genome、Treefam



时间安排:

培训班编号

开课时间

授课地点

地址

第6期

2016年4月24日-5月5日

济南循证研究中心

济南市舜华路359号  

每两月一期,具体时间请随时关注本公司网站或通过电话邮件咨询

 

培训费用:5000元(含讲课费、上机费、资料费) 
电话报名:0531-88819269 杨老师

邮件报名:project@genelibs.com

热忱欢迎各位有识之士报名参加。名额20人,报名从速。

想对我们了解更多,请登录以下网站查:

基因云馆http://www.genelibs.com

 

住宿:山东大学校区宾馆,标准间(双人间)50-150元/人/天。
有百年历史的校园,环境清幽,景色宜人。

就餐:软件园食堂。 
以上费用自理。

注:
1.请携带本人2张一寸免冠照片,身份证。如果是学生,请带学生证。
2.请携带学费汇款回执或复印件!
谢谢合作! 

汇款帐户: 

账户信息

 

有任何问题请发送邮件到此邮箱咨询:

project@genelibs.com

 

 


联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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