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ArrayExprss数据库

项目名称

ArrayExprss数据库

项目等级

5

项目类型

数据库

开始时间

2008-12-11 11:00:59

项目简介

ArrayExpress是高通量功能基因组数据的一个公共数据库。ArrayExpress由两部分组成 -- ArrayExpress Repository,它是一个MIAME(Minimum Information About a Microarray Experiment)支持的微阵列数据的公共档案库,及ArrayExpress Data Warehouse,它是选自档案库的基因表达谱及一致性重注释的数据库。此模块可以将ArrayExprss上的数据文件本地化,将其转化为平台所用的格式,使其可以在平台上进一步的处理, 同时,也将记录相关的平台信息,注释信息等文件,对应下步的内容处理。

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新模块开发后的18个月为收费期,在此期间,您若是需要进行模块分析,请联系当地经销商,如果您无法找到当地经销商,请联系总部,获取经销商联系方式。

同时,如果您是一个开发者,也可以联系我们进行模块开发,我们将提供广阔的平台,给予一定的报酬。

项目详情

ArrayExpress--EBI的微阵列基因表达数据公共数据库

ArrayExpress是EBI的微阵列基因表达数据的一个新的公共数据库,它是一个一般的基因表达数据库,设计用来保存来自所有微阵列平台的数据。

ArrayExpress使用MIAME(Minimum Information About a Microarray Experiment,有关微阵列实验的最小化信息)注释标准及相关的XML数据交换格式MAGE-ML(Microarray Gene Expression Markup Language,微阵列基因表达标记语言),它被设计成以结构化的方式来存储良好注释的数据。

ArrayExpress基础结构由数据库本身,以MAGE-ML格式的数据提交或通过在线的提交工具MIAMExpress,在线数据库查询接口,Expression Profiler在线分析工具组成。

ArrayExpress提供三种类型的提交,阵列,实验和实验方案,它们中的每一个都分配一个登录号。数据提交和注释的帮助由监管小组提供。数据库可以用诸如作者,实验室,物种,试验或阵列类型等参数进行查询。


随着越来越多的(an increasing number of)组织采用MAGE-ML标准,提交到ArrayExpress的量在快速增长着。现在一共有6万5千余组数据在上面。


数据库可以从http://www.genelibs.com/gen/


此模块可以将ArrayExprss上的数据文件本地化,将其转化为平台所用的格式,使其可以在平台上进一步的处理, 同时,也将记录相关的平台信息,注释信息等文件,对应下步的内容处理。   


 


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联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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