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任兵教授Cell子刊解读染色质结构域

来源/作者:Genelibs   发表时间:June 7, 2016, 1:50 p.m.   文章热度:1851   

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  加州大学的任兵(Bing Ren)教授发表文章,回顾了染色质结构域(特别是TAD)的最新研究进展。这篇文章详细介绍了TAD结构域的特点、功能和形成机制,还展望了这一领域 的发展前景。

高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。 所有控制基因转录的调控蛋白,都要结合在DNA上起作用。而染色质的3D结构会随着细胞生活周期而变化,调节调控因子所能接触到的基因。

真核生物的染色体在细胞核内是怎样折叠的呢?这个重要的生物学问题一直没能得到解答。过去的生化和微观研究显示,间期的细胞核普遍存在染色质结构域和环。但人们并不清楚这种组织形式有什么样的生物学意义。

后来,研究者们开发了染色质构象捕获(3C)技术。3C及其衍生技术进一步揭示了间期细胞核内部的染色质结构,为动物发育和人类疾病研究提供了新的分子框架。人们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作,他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。研究显示,进化保守的TAD存在于多种不同的细胞,并且在这些细胞中保持不变。

此前有研究团队通过CRISPR技术发现,一些结构变异会干扰染色质拓扑结构,使增强子-启动子互作发生异常,基因 表达的时空模式发生改变,最终导致发育疾病。

莫斯科国立大学的研究团队发表文章,揭示了染色质自组装成TAD和inter-TAD的分子机制。这项研究表明,TAD是缺少活性染色质标签的凝聚结构域, 由活性染色质区域分隔。研究人员在这项研究的基础上提出了染色质自我组织的分子机制,希望帮助人们开发更科学的疾病治疗策略。

佛罗里达州立大学的研究人员发表文章,首次鉴定了复制结构域的边界,明确了它们在18种人类细 胞和13种小鼠细胞中的位置。这项研究表明,复制结构域边界与TAD边界几乎是一对一的关系。研究人员指出,TAD结构域是稳定的复制时间调控单元。

推荐原文:Chromatin Domains: The Unit of Chromosome Organization


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